北京政府批准曹、章、陸三人辭職的當天，英國駐華公使朱爾典曾將這消息電告上海英國總領事法磊斯，令其勸告上海租界內的中國商人開市，上海各界在證實曹、章、陸三人確實已經下台後，於是商人結束罷市，工人結束罷工。
這次愛國運動是勝利了，可是付出的代價也不少，而皖系軍閥也殘忍地採取了高壓手段。8年5月30日，安慶中等以上學校響應罷課，安徽督軍倪嗣衝下令將罷課各校一律解散。6月1日湖北督軍王占元派兵包圍武昌高師，下令對遊行學生「格殺勿論」，有學生16人被軍警毆傷，其中陳開泰一人傷重致死。湖北警務處長崔振魁率領督察長杜傑及大隊警察，四齣追打演講學生，武昌中華大學學生李鴻儒忿而投江自殺。6月7日南京警察廳長王桂林指揮警察壓迫商人開市，與學生發生衝突，金陵大學學生陳昌盛被刺刀戳傷，死而復甦。6月12日上海警察廳長徐國樑親自動手鞭打學生，這天晚上租界巡捕在山東路愛多亞路口槍擊參加愛國遊行的市民，死傷多人。山東福建也都有逮捕學生和槍擊代表的事，湖南督軍張敬堯則禁止湖南各報登載有關魯案的新聞。
吳佩孚又作獅子吼了，他是山東人，山東問題是愛國運動的焦點，他這個山東人自然更要表示態度。6月9日他有青電反對逮捕學生，主張召開國民大會，請政府宣示外交，力爭收回青島，接著又有佳電主張取銷段祺瑞所承諾的中日密約。
錢能訓辭職後，徐世昌想以周樹模繼任，可是安福系國會不會通得過，徐向段祺瑞攤牌：「如果要我繼續幹下去，就要通過周的國務總理」。段答應向安福國會去疏通，他把徐樹錚叫來，要他去辦這事，小徐說：這事不太好辦，國會不見得會通得過。果然，這個一手為段御用的國會，竟不聽段的命令，他們揚言：「我們當議員的，不比軍人有服從的義務。」小徐把他們預擬好的一則電報拿給段看，這通電報是在周樹模被提名國務總理時，安福國會的議員們就要自己宣布安福國會是個非法國會，由非法國會選出來的總統徐世昌也是非法總統。
這一來，徐世昌也不敢堅持提名周樹模了。6月13日准錢能訓辭職，特任龔心湛兼代內閣總理。
愛國運動雖然因曹、章、陸三個親日派下台而獲得勝利，可是這個運動的目的是反對巴黎和會對山東問題的決定，所以曹、章、陸下台後，這個運動並沒有結束。
北京政府是希望參加簽字巴黎和約的，因為不參加簽字就不能加入國際聯盟組織。
五四所開始的愛國運動，在曹、章、陸辭職後，並沒有結束，反而繼續要求北京政府訓令和會代表拒絕在和約上簽字。5月24日北京國務院曾密電北京各省徵求應否簽字的意見，這不是徵求意見而是授意各省軍閥通電贊成簽字而為簽字後的支持者，可是各省軍閥在全國一致的愛國運動中，都不敢太背叛人心。所以都沒有搖旗吶喊。
全國展開了愛國運動的第二目標，反對中國在巴黎和約上簽字。首先發起請願的，是山東人民，6月18日山東各團體推出代表於19日啟程赴北京請願，他們動身時，山東省會濟南的人民萬人空巷前往送行，場面激動而緊張，代表們向送行者沉痛表示，不達目的，誓不生還。
20日山東請願的七個團體代表85人先期到京，下車後徑赴總統府請願，徐世昌拒不接見。代表們在傾盆大雨中，一齊跪在新華門外號啕大哭，徐不得已，只好派秘書長吳笈孫出來傳話，定於次日派代理國務總理龔心湛代表總統接見。山東請願代表抵京的消息，震動了北京城，日本駐華公使小幡特別設宴準備招待他們，他們不接受，卻接受北京學聯在北大法科舉行的歡迎會。
21日，龔心湛接見山東請願代表，代表們要求政府不要在和約上簽字，龔心湛表示這個問題太大，礙難接受。於是代表們一致要求面見總統，徐世昌不得已，遂於23日在總統府接見他們。
這是動人的一幕，代表們哭訴日本人把山東當作屬土，把山東老百姓當做牛馬奴隸，在山東橫行霸道，無惡不作。其中一位代表激動地流著眼淚，用沙啞的聲音質問徐說：「請問大總統，山東是不是我國領土？請問大總統，山東人民是不是中國人？大總統還要不要我們？」他的話說完，淚隨聲下，其他代表也跟著哭了起來。徐面對著這一幕眼淚請願，莫知所措，只得吞吞吐吐地表示政府已經電令陸專使從緩簽字。
徐世昌對山東請願代表的答覆，並不是事實，北京政府拍給巴黎中國代表的電報，只是命令陸徵祥等「相機辦理」，而不是「從緩簽字」。其用意是叫中國代表們仰承意旨，代負簽字的責任，不理國內的反對，徑行簽字。
可是愛國是一致的，中國代表們又何能例外，陸徵祥早於5月14日就有密電向徐請示，電云：
「祥一九一五年簽字在前，若再甘心簽字，稍有肺腸當不至此。惟未奉明令免職以前，關於國際大局，當然應有責任。國人目前之清議可畏，將來之公論尤可畏。究竟應否簽字？倘簽約時，保留一層亦難如願，則是否決計不簽。時間日迫，關係至鉅，聞見所及，合再瀝陳。萬祈速即裁定，立即電示。」
徐的相機處理，就是答覆陸的這封電報。
山東代表在北京哭秦庭一幕，立即震動全國，他們除了向北京政府請願外，還通電山東籍的北洋派軍人盧永祥、王占元、吳佩孚等，請其聯合阻止北京政府簽字和約。同一時期，上海各界人士鑒於安福系「暗中搗鬼，堅決主張簽字」，因此發出了聲討安福系和解散安福系的要求。
6月27日，京津學生和留日、留歐歸國學生推出代表和山東代表聯合起來，共計400餘人，一同到總統府請願，請求拒簽和約。徐世昌仍不肯接見，叫他們去找龔心湛、傅岳棻陳述意見。代表們堅持必須由徐親自接見，當面保證不簽約，否則即不退出，雙方堅持不下，代表們不走，徐則不見，於是請願代表即在新華門外露宿一宵，堅持到28日上午9時，徐不得已只好接見他們。
徐向請願代表們講了一些不著邊際的話，沒有一點明白表示，這使請願人士非常不滿，陝西學生屈武當場放聲大哭，以頭觸壁，徐藉此怒形於色，就拂袖而去。請願代表們一直到28日下午8時40分鐘才散隊。
28日山東第二批請願代表108人也到了北京，30日有天津代表70餘人也到了北京，其他各省也有代表紛紛抵達，於是各省請願的浪潮和學生運動結成了一道洪流，匯合在一起，北京城頓成一個請願城，街頭巷尾，到處可見從各省來的請願代表，市民和商店都熱烈歡迎他們，這一來使到北京政府為之手足無措。
北京政府慌忙通電各省，禁阻各省代表繼續向北京出發，同時怕北京的學生再罷課遊行，乃宣布北京各校提前放假，9月1日開學後再補行暑期考試。
29日上海各界舉行拒簽和約的人民外交大會，上海軍事當局事前關閉了公共體育場大門，門外遍布軍警，大會無法進行。各團體紛紛向淞滬護軍使抗議，這個大會終於在7月1日召開。
全國性的請願運動，使全國人民對政治增加了興趣，同時也增加了愛國的熱誠，帝王時代的中國人民，在專制統制下養成對政治沒有興趣也不敢有興趣的習慣，現在由於抗議外患而勇敢地愛國，所以在請願期間。有人建議推舉人民代表到歐州去進行國民外交，有的主張召開全國國民大會解決外交問題和贖款。學生一面參加拒簽和約請願，一面致力抵制日貨、振興本國工業、推行義務教育。
當全國泛起了拒簽《凡爾賽和約》的運動時，中國出席巴黎和會的代表們正面臨他們一生中歷史性的抉擇。
巴黎和會的結果，《凡爾賽和約》於民國8年6月28日簽字於凡爾賽宮的明鏡殿，明鏡殿位於凡爾賽正宮的後殿，殿長73公尺，闊約10公尺，殿的四壁鑲立17方大鏡，殿頂是名畫師肋朋的大畫七幅，小畫22幅，人在殿中猶如置身瓊樓玉宇。
6月28日午後3時，協約國代表禮服禮帽，齊集明鏡殿。《凡爾賽和約》歷經半年始達成，由27國代表正式簽字。中國代表缺席，並致電政府，引咎辭職，原電云：
「和約簽字，我國對於山東問題自五月二十六日通知大會，依據五月六日祥在會中所宣言維持保留後，分向各方竭力進行，迭經電呈在案。此事我國節節退讓，最初主張注入約內，不允；改附約後，又不允；改在約外，又不允；改為僅用聲明，不用保留字樣，又不允；不得已，改為臨時分函聲明，不能因簽字而有妨將來之提請重議云云。豈知至今午時，完全被拒。此事於我國領土完全，及前途安危，關係至鉅。祥等所以始終未敢放鬆者，因欲使此一問題留一生機，亦免使所提他項希望條件，生不祥影響。不料大會專橫至此，竟不稍顧我國家纖微體面，曷勝憤慨。……竊查祥等猥以菲材，謬膺重任，來歐半載，事與願違，內疚神明，外慚清議。由此以往，利害得失，當難逆睹。要皆由祥等奉職無狀