在雲南上座部佛教發展過程中，也出現過許多派別，主要有潤、擺庄、多列、左抵四派。其中潤派又分為擺罷、擺孫兩個支派，多列派則分出達拱旦、蘇特曼、瑞竟、緬坐四個支派。這些派別都因受泰國等國佛教派別影響而形成。潤派以及與潤派有密切關係的擺庄派，其傳入時間較早，分布區域較廣，寺院和僧侶最多，經典基本齊全，教制相當完善，是雲南上座部佛教的主體。
上述各派在佛教教義、學說方面基本相同。他們奉行的經典是巴利語系統的經、律、論「三藏」，僧侶念誦的是用傣文字母書寫的巴利語佛經。在宗教修持上，仍然保持著早期佛教的某些戒律，主張按「八正道」修行，並特別重視禪定。
但在持戒律儀方面，各派又有所不同，其中擺庄派和潤派比較寬鬆。如擺庄派，出家者的教規雖有75條，但最基本的只有四條，即不殺生，不邪淫，不誑語，不偷盜。其他方面則都比較自由，如袈裟可以用毛料製作；可以自由出入民宅；出門可以乘車騎馬；葷腥不禁，允許吸煙。信眾見佛爺也沒有嚴格的禮節，可以自由交談。潤派的教規最為寬鬆，僧侶生活相當自由，行動限制極少。如允許掛長刀、騎馬，可以殺生、飼養家禽家畜，乃至經商、放高利貸等。這兩個教派之所以勢力較強，很大程度上與戒律的寬鬆有關。
相比之下，多列派和左抵派戒律要嚴格得多。多列派普通教徒要嚴格遵守五戒(不殺生，不偷盜，不邪淫，不妄語，不飲酒)和非時不食(一日兩餐)等項規定，而僧侶還需遵守不親手接受布施、不與在家者同席用餐等傳統習俗。左抵派戒律最嚴，教規最多。教徒一般在七八歲時就開始受戒，隨著年齡的增長，除受五戒、八戒(在五戒基礎上再增加不裝飾打扮，不觀聽歌舞，過午不食三戒)、十戒(在八戒基礎上再增加不坐高廣大床，不蓄金銀財寶二戒)外，還不準吸煙，不準從事煙、酒、鐵器的生產和買賣，嚴禁飼養家禽家畜(除耕牛外)。該派僧侶只披一件黃布袈裟，不穿衣服；不能自由走出寺廟，更不準出入民居；如必須走出寺廟，須赤足而行，不得乘車騎馬。但因戒律過於嚴厲，左抵派的僧侶和信眾已日益減少。
但是，近40多年來，雲南上座部佛教的教派隔閡已經開始削弱，各派之間相互學習，取長補短，有走向統一的趨勢。由於社會生產力的提高和商品經濟的發展，佛教徒的守戒不再十分嚴格。青少年進入寺院主要是履行傳統義務 ，真正在寺廟終身為僧的已並不多見。
由於地域和派別的不同，雲南上座部佛教僧侶的職稱和僧階也有差異，但西雙版納、思茅、臨滄大部分地區的潤派基本相同，由下至上可分為10個級別。它們是：1.帕諾(相當於行童或侍者)；2.帕(相當於沙彌，初出家者)；3.都(相當於比丘，受過戒者)；4.都龍(即大佛爺，寺廟住持)；5.祜〔hu 戶〕巴(相當於都統長老)；6.帕召祜(佛師，指闡教長老)；7.沙密(相當於沙門統長老)；8.僧伽羅闍(意為僧王，相當於僧主長老)；9.松迪(意為僧正長老)；10.松迪阿伽摩尼(意為大僧正長老)。升任祜巴已很不容易，所以每個地區、村寨以及寺院，都以有自己的祜巴為榮。祜巴要有較高的佛教修養，晉陞時要舉行隆重的儀式。一旦升為祜巴，則不得任意還俗。松迪阿伽摩尼是最高一級的僧階，在西雙版納歷史上，只有一位傣族僧侶和一位布朗族僧侶曾榮獲過這一僧階。
德宏和保山地區(州)的僧職，多列派自上而下分為四級，擺庄派也分為四級，只是名稱並不相同。
與上述僧職等級區分相應，西雙版納傣族的寺院也有等級之分。自下而上一般可分為四級，它們是：1.村寨佛寺(最基層一級佛寺)；2.布薩堂佛寺(由四所以上村寨佛寺組成的、行政區級的中心佛寺，寺內設布薩堂即戒堂，用以舉行集體誦戒儀式)；3.勐總佛寺(西雙版納所屬各勐的勐級總佛寺)；4.總佛寺(傣語名拉扎坦大總寺，設於宣慰使駐地)。真正掌有教務實權的是勐總佛寺，它有權召集全勐僧眾會議，主持全勐性佛事活動，決定下級佛寺住持人選，批准祜巴以上僧職的晉陞，開除違犯戒規的僧人等。
歷史上，雲南上座部佛教與政治密切結合在一起。傣族政治上的統治者，同時也是宗教上的統治者；統治者頒布法令，往往藉助於宗教的名義。1949年以後，西雙版納等地實行政教分離，各族人民從此獲得宗教信仰自由的權利。