在傳說中，中醫學是黃帝和他的大臣岐伯所創立的，所以後世把黃帝和岐伯尊為醫祖，甚至把中醫學稱之為岐黃之術。《黃帝內經》便是以黃帝和岐伯問答的形式寫成的，約成書於戰國晚期(一說漢代)。
《黃帝內經》包括《素問》和《靈樞》二部分，以論述人體解剖、生理、病理、病因、診斷為重點，兼述針灸、經絡、衛生保健等方面的內容，是中醫學的一部著名經典著作。它奠定了中醫學的理論基礎，至今仍是學中醫的人所必讀的典籍之一。
《黃帝內經》把陰陽五行學說引入醫學，使其成為醫學的基本理論。書中說：「陰和陽，是天地的根本法則，是萬物的綱紀，是變化的父母，是生與殺的本始，是精神寄藏的寓所，所以治病就要探求陰陽這個根本。」由此，書中提出對於人體健康，最根本的是要保持陰陽的平衡，如果陰陽失去了平衡，人就會生病。治病療疾的宗旨，就是用各種方法使破壞了的平衡重新恢複起來。同時，《黃帝內經》把人體視為一個完整的整體，各部分的器官都是有機地聯繫在一起的。某部分發生病變，將會影響到全身及其他器官，而全身的狀態也可能影響局部的病理變化。五行在書中也得到充分應用，五行的相生、相剋、相乘(有乘虛侵襲之意)、相侮(有恃強凌弱之意)，被用來論述人體疾病的各種起因。書中說：「五行者，金木水火土，更貴更賤，以知死生。」這裡的「貴賤」是指盛衰的意思，就是說以五行的盛衰來觀察身體的健康與疾病。
《黃帝內經》對人體與外部環境的關係也非常重視。它強調指出，人的身體狀況與四季變化、晝夜交替、地理水土、社會生活以及精神狀態等都有著密切的聯繫，因此在診斷和治療中也必須考慮這些因素，因時、因地、因人分別施治。這一診斷和施治的指導思想，已為現代醫學和生物學所證實。