內服方葯是運用適合於病情的配方，採取湯、丸、散、膏、酒、葯膳等多種不同的劑型進行內服。古人治病有一個由單味葯到多味葯的過渡時期，配方即指由多種藥物組成的復方。復方究竟從什麼時候開始的，已不可詳考，但不會晚於商代。古文獻中有「伊尹制湯液」之說。伊尹是湯與有莘氏結姻時，陪嫁過來的奴隸，明於滋味，精於烹飪，又通醫學。曾以烹飪之理喻國事，而被湯賞識，因之擢以為相。後成為商滅夏的開國元勛。以他的技能與地位分析，開創湯液(水煎劑的調製)理論，是非常可能的。出土的殷商時代的甲骨文獻有「鬯〔g暢〕其酒」的記載。鬯是芳草做的藥酒。湯劑、酒劑的出現，其顯然的意義是方便了復方的使用。從《漢書·藝文志·方技略》所錄的書目來看，漢以前的古代醫學書籍中，方書所佔的比例很大 。說明在上古時代內服方葯就已經成為治療疾病的很重要的方法了。之後歷代中醫治病內服方葯所佔的地位越來越重要。關於中藥學與方劑學的豐富內容及發展過程將有專章介紹。
針灸術是我國獨特的治病手段，源遠流長。針和灸本不是一種治療方法，為什麼從古至今針與灸總是相提並論呢？這是因為它們有一個共同點，就是都要根據經絡學說，循經選穴進行治療。
針是針刺，遠古時代針具是用石頭製作的。稱為「砭石」，隨著社會生產力的發展，針具也在不斷地改進，於是先後出現了骨針、竹針、陶針。冶金術發明後，針具有了突破性的革新，出現了銅針、鐵針、銀針、金針等，並且由原始的僅能用於放血、按壓的針具，創造出了具有各種用途的針具，如《靈樞》中就記載了「九針」的形狀特徵及用途。
灸法是以火的溫熱刺激作用於某一部位，來達到治療目的。古人很早就認識到「陳艾」，即存放時間較久的艾，是最好的灸灼材料。艾灸有溫通經絡、祛寒除濕等作用。把艾葉晒乾，搗成絨狀，篩去雜質備用。艾絨點燃後，有火力均勻、不易散裂、不易熄火的優點。艾絨可以做成艾條、艾柱直接灸，或隔姜、蒜、鹽的多種隔灸法。
針灸療法並不局限於止痛，像藥物一樣，可以應用於臨床各科的治療。據傳《黃帝針灸》與《神農本草》、《素女脈訣》並為三世(伏羲、神農、黃帝時代)之書，均已不傳於世 。書出三世雖不足信，但說明我國最早的醫書中就有針灸療法的專著。長沙馬王堆漢墓出土的《足臂十一脈灸經》與《陰陽十一脈灸經》(甲、乙本)，從內容看很明顯是《黃帝內經》以前的著作。其書專論灸法，不論針法。據統計前者論及所主病候有78種；後者已增至147種。至《內經》，經絡學說更加完善，針、灸治法的討論在全書中仍佔有相當大的比重。以上情況說明古代治法有一個重視灸法，針、灸並重，藥物、針、灸並重的演變過程。在《內經》問世之前我們的灸法治療已經很豐富、很系統了。古代名醫一般都具備高超的針灸技術。特別是治療急症時，首選針、灸療法。史籍所載秦越人、淳于意、華佗等人治療的一些病例均反映了這一情況。
早在唐代針灸就已成為獨立的專科。針灸專科的設置一直延續到清代中葉。清道光以後，朝廷雖強令太醫院停用針灸療法，但仍舊廣泛地流傳於民間。新中國成立以後，針灸學受到國家的重視，得到大力發揚，同時在海外也有著深遠的影響。
遠古時代，人們的身體某個部位有了傷痛，經手按揉以後會減輕痛苦，所以自然地會用同樣的方法去減輕別人的痛苦，這就是原始按摩的起源。以後有了經絡、藏象學說的理論指導，才能稱之為按摩療法。按摩又稱「推拿」。
《五十二病方》 有治療小便不通的按摩方法。《內經》中有按摩治療經絡不通等引起的疾病的記載。張仲景在《金匱要略》中介紹了「自縊死」的按摩急救手法：「徐徐抱解，不得截繩，上下安被卧之。一人以腳踏其兩肩，手少挽其發，常弦弦勿縱之，一人以手按據胸上，數動之。一人摩捋臂脛屈伸之。若已僵，但漸漸強屈之，並按其腹。如此一炊頃，氣從口出，呼吸眼開，而猶引按莫置，亦無苦勞之。須臾，可少桂湯及粥清含與之，令濡喉，漸漸能咽，及稍止。若向令兩人以管吹其兩耳，罙〔shen深〕好，此法最善，無不活者。」這是非常珍貴的有關「人工呼吸」手法的最早文獻。可見按摩可適用於臨床各科，但發揮作用最大的要屬養生、兒科和骨傷科。明、清兩代小兒推拿專著就有十幾種。歷代養生及骨傷科專著均離不開按摩手法的介紹。由於按摩治療效果可靠，使我國骨傷科飲譽海外。
我國自唐代起就有了按摩專科的設置。
按摩手法繁雜多變，約有100多種手法。概括起來，有以按捏為主的，如按、壓、點、拿等；有以揉搓為主的，如推、擦、摩、搓等；有以振動為主的，如拍、抖等；有以複位為目的的，如搖、扳、引伸等。此外，有時還要配合應用一些器械，如對脊椎骨折的整復治療。《世醫得效方》強調不可用手整頓複位，須用軟繩從腳吊起，懸墜使脊柱充分直伸，其骨自然歸窠。對頸椎骨折、脫位，《永類鈐方》則用「攀巾踢罌〔ying英〕法」：用手巾兜縛頦下，繫於腦後，繫緊連接的繩子，繩頭繫於房上，令患者坐在大酒罈上，突然踢去罈子，借繩拉力使頸椎複位。二書均出於元代，經600多年後，才有英國人提出「懸吊複位法」，被認為是傷科史上的創舉。
常用的藥物外治法有敷、熏、洗、熨、吹、導等。古代很重視藥物外治法，西周時它是外科、骨傷科醫生最重要的治療手段。戰國時扁鵲(秦越人)見齊桓侯有病，幾次請他接受治療，齊桓侯都拒絕了，及至後來，當齊桓侯感到自己有病需治療時，已經不可救藥了。當時扁鵲說：「病邪在肌膚可用湯熨治療，……在骨髓就沒有辦法了。」說明當時湯熨這一藥物局部熱敷的方法已應用於臨床。他在搶救虢太子時採用了針、灸、湯熨等綜合療法，收到了「起死回生」的治療效果。
在歷代醫籍中，都有藥物外治方的介紹。值得提出的是，清代名醫吳尚先治病主要採用外治法，而且療效頗佳，每天診治病人達一二百名，多時甚至達三四百之多。他講施外治法的體會謂：「初亦未敢謂外治必能得效。逮親驗萬人，始知膏藥治病無殊湯藥，用之得法，其響立應。」他的外治法主要用膏藥貼敷，配合點、搐、熏、擦、熨、烙等方法。更可貴的是，他把數十年的外治經驗進行了系統地整理，撰寫了《理瀹〔yue月〕駢文》一書，對中醫藥物外治法做出了突出的貢獻。
我國從唐代至清代的醫學分科設置，都有「祝由科」(或稱「禁科」)這一專科。
祝由之術起源於古代巫醫。相傳黃帝時有二臣善於醫，歧伯以醫藥診治疾病；祝由治病不用藥，唯清水一碗，以手捏劍訣，敕勒書符水面，讓病人飲其水治病。後來即以其姓氏為名，稱此治病之術。可見「祝由」是一種巫醫的騙術，為封建迷信的糟粕。但是它為什麼能延續幾千年，並在很長一段時間裡，與臨床各科同時存在於宮廷的衛生機構中呢？這是因為古代醫學家發現用語言暗示，也可能達到某些治療目的。於是在古代醫學著作中，提煉了祝由術的合理內容，拋棄了它的迷信色彩，記錄了一些治療手段。《靈樞·賊風》在討論巫者祝由治病的道理時說：有些人曾感受外邪而沒有發病，後因情志「有所惡及有所慕」，造成了氣血逆亂而致病。由於一般人察覺不到病因所在，所以認為是鬼神作怪。先巫知道此病生成的原因和消除此種致病原因的辦法，所以只需用「祝說病由」，即述說病因，不用針、葯，也能治好疾病。明代的張景岳在《類經》中解釋得更清楚，他說祝由治病是「求其致病之由，而釋去心中之鬼」。古代醫學用「移精變氣」來概括祝由治病的依據。「移精變氣」就是通過精神調節，以改變氣血逆亂的病理狀態，即相當於今天的「心理療法」。
《列子·力命》記載了一則故事，有個叫季梁的人，病得很厲害。他兒子為他請了三個醫生，其中的盧醫只用一番話，把病因說明，未用針、葯，病就治好了。盧醫採用的就是典型的「祝說病由」的方法。我們很熟悉的諸葛亮用「萬事俱備，只欠東風」一句話給周瑜治病的故事，其實是有醫學根據的。
精神療法也並不局限於「祝說」，只要達到「移精變氣」的目的，也是可以採用多種手段的。《呂氏春秋·至忠》中有一個實例，就是用醫生的反常行為來調治病人的精神障礙的。齊王有病，到宋國請來了文摯，文摯看過病人後，對太子說：「大王的病，必須激起他發怒才能好，但他病癒後一定要殺我！」太子懇求說：「大王病癒，我和母親一定替你求情。」文摯治病的過程是這樣的：先是約定好診病的時間，卻三次失約，讓齊王空等。後來去了，不脫鞋就登上齊王的床，踩著齊王的衣服詢問病情。齊王憋了一肚子氣不理睬他，他反而用言語進一步地激怒齊王，齊王終於怒不可遏地起身斥責他，可是病狀卻意外地消失了。儘管病癒，怒氣不息的齊王還是