古人說：一個秀才，半個醫。可現代的青年知識分子並非能很容易地學進中醫的。這是因為現在的知識結構較古代已發生了巨大的變化。中醫學理論是基於我國古代哲學理論發生和發展的，它與現代醫學是截然不同的兩種學術思想體系。
春秋、戰國時代，由於社會生產力的迅速發展，社會發生了巨大變革，正由奴隸制向封建制過渡。學術界也出現了「諸子蜂起，百家爭鳴」的空前活躍局面。我國的醫學吸取了各學派哲學思想中確能指導醫療實踐的合理部分，形成了具有樸素的唯物論和自發的辯證法的中醫理論體系，推動了自身的發展。現在我們就看一看古代哲學對中醫理論的重要影響。
傳說伏羲氏「定天地，分陰陽」。其實陰陽概念引起學術界高度重視，且不斷深化、引申，當歸功於儒家的經典《周易》。該書一般認為是殷末周初之作。它本來是古代卜筮之書，但古代學者卻從中提煉出「陰陽」這一樸素的辯證法思想，用於解釋自然界萬物變化的一般規律。甚至在戰國時期還形成了「陰陽家」這一學術派別。醫學自然地也把「陰陽」作為基本概念吸收進來了。因此中醫學者歷來非常重視《易經》，直到清代，醫學界還有「不知《易》者，不可為太醫」的誡訓。
揭開神秘的面紗，用現代語言解釋「陰陽」的奧妙，不難體會出它樸素辯證法的思想真諦，所以現代人也是完全可以接受的。
籠統地說，易學認為，陰和陽是事物的兩種屬性，脫離了具體的事物，也就無從談陰和陽。陰和陽是事物相互對立、相互依存的兩個方面，如動與靜、升與降、外與內、熱與寒、用與體、亢進與衰退等等，前者屬陽；後者屬陰。自然界一切事物都可以分為陰和陽兩個方面。每一方面又可再分陰陽，如此分析，無窮無盡。如《內經》舉例說：「陰中有陰，陽中有陽。平旦至日中，天之陽，陽中之陽也；日中至黃昏，天之陽，陽中之陰也；合夜至雞鳴，天之陰，陰中之陰也；雞鳴至平旦，天之陰，陰中之陽也。」再如五臟：「背為陽，陽中之陽，心也；背為陽，陽中之陰，肺也；腹為陰，陰中之陰，腎也；腹為陰，陰中之陽，肝也；腹為陰，陰中之至陰，脾也。」人體以體表為陽，體內為陰；背為陽，腹為陰；六腑(膽、胃、大腸、小腸、三焦、膀胱)為陽，五臟(肝、心、脾、肺、腎)為陰；臟腑的功能為陽，臟腑的質體為陰。
太極圖形象地表現了陰陽互根、對立的意義。黑色代表陰，白色代表陽，二者統一在一體中相互轉化，黑點表示陰為陽之根；白點表示陽為陰之根。
中醫學認為機體只有陰陽平衡協調，才能維繫正常的生命活動，反之則生疾病，甚至導致生命活動終止。所以《素問·生氣通天論》說：「陰平陽秘，精神乃治；陰陽離決，精氣乃絕。」
中醫診斷疾病，抓住陰、陽、表、里、寒、熱、虛、實八個字，即「八綱辨證」，其中陰和陽為總綱，即表、熱、實歸屬於陽證；里、寒、虛歸屬於陰證。當然這僅就其原則上的屬性而言，也就是診斷時分析病情最基本的依據。而實際上每個患者的臨床表現要複雜得多，不可能如此單純，常常是對立的兩方面交錯出現，這就體現出前面所講的陰或陽中又有陰、陽的思想。因此對病情分析越客觀、細緻，那麼診斷也就越準確，制定的治療方案也越與病情吻合。
中醫治療疾病是以調治陰陽，使其恢複平衡，即以「陰平陽秘」為目的。隨之中藥的性、味、功用也分為兩大類，如辛、甘、淡味，性溫熱、燥烈、升散的藥物屬陽；酸、苦、鹹味，性寒涼、滋潤、降斂的藥物屬陰。由此可見陰陽學說貫穿於中醫的生理、病理、辨證、藥性、治療等各個方面。
有關「五行」最早的文字記載，見於儒家的經典《尚書》。大約春秋時代，用五行解釋事物已很盛行。於是古代醫學家也把五行學說滲入到醫學領域。五行學說把自然界一切事物用五種屬性來歸類，用以概括它們的性質，說明它們之間的聯繫。凡生髮的屬木；炎上的屬火；長養的屬土；堅勁的屬金；寒而下行的屬水。他們以木、火、土、金、水、木的順序相生；按木、土、水、火、金、木的順序相剋。這種相互資生、相互制約的不息運動，推動了事物的發展，所以稱之為「五行」或「五常」。
以五臟為例，肝、心、脾、肺、腎，依次屬木、火、土、金、水。如肝屬木，功能主調暢全身氣機，像木的生髮條達之象。五髒的相生關係中，如「水生木」，指的是腎強精充則可以涵養肝臟。五髒的相剋關係，即相互的制約關係，如肺氣清肅下降，可以抑制肝陽的上亢，即「金克木」。以此類推。關於五行相剋的規律，嚴格地分，凡屬生理上制約的現象，稱為「克」；若成為過分的制約和排斥的反常變化，如一臟偏亢，導致另一臟偏虛的病理現象，則稱為「乘」。還有「反克」現象，即本臟虛弱，其應克之臟反而克本臟，這種情況稱為「侮」，或稱「反侮」。五臟在生理上、病理上均循著相生、相剋的規律互為影響，這就構成了生理上的充分協調和病理上的錯綜複雜的局面。
運用五行學說在治療學上，其內容也是極其豐富的。如治療肝病，應注意同時健脾，這是預防肝病傳脾；又如用補腎的方法調治肝虛之病，就是運用「水生木」的理論等等。同時藥物的五味也歸屬於五行。如酸味葯入肝經，甘味葯入脾經等，故五行學說也指導著用藥規律。
五行所屬表
五行學說不但把人體各組織器官聯絡成一個恆動的整體，而且把人體與自然界各種物質、生物、季節、時間、方位、氣候、自然現象、致病因素等，也形成了有機的聯繫。所以說五行學說的運用是中醫學「天人統一觀」的充分體現。