清代大部分時間，錢塘江涌潮的主溜，仍然對著海寧、海鹽、平湖等浙西沿海，所以這一帶仍是海塘工程的重點。清前期，先後用了半個多世紀的時間，耗費700—800萬兩紋銀，將這裡的大多數海塘，都改建成朱軾創造的最堅固的新魚鱗石塘。
康熙、雍正、乾隆三代，朱軾曾先後擔任浙江巡撫、吏部尚書等重要職務。在他任職期間，多次主持修建蘇、滬、浙等地的海塘。康熙五十九年(公元1720年)，他綜合過去各方面的治塘先進技術，在海寧老鹽倉，修建了500丈新式魚鱗石塘。雍正二年(公元1724年)七月，由於颱風和大潮同時在錢塘江口南北一帶出現，釀成一次特大潮災。當時，除朱軾在老鹽倉所建的新魚鱗石塘外，杭州灣南北絕大部分的海塘都遭到嚴重的破壞，生命、財產的損失十分慘重。起初，朱軾的新魚鱗石塘，由於造價高昂，每丈需銀300兩，沒有推廣，只造了500丈。經這次大潮考驗後，被公認為海塘工程的「樣塘」。為了浙西的安全，清政府遂不惜花費重金，決定將錢塘江北岸、受涌潮威脅最大的地區，一律改建成新式魚鱗石塘。
新式魚鱗石塘，具有以下一些特點：第一，基礎打得更為紮實。明朝黃光升的魚鱗大石塘，清淤後只在塘基的前半部下樁加固，後半部未加處理。而新魚鱗石塘的塘基工程，除清淤和在前半部下樁外，在後半部也下了樁，使前後兩部分具有同樣的承壓性能，並在其上還用三合土夯實。第二，塘身的結構也更為嚴密。條石規格一致，規定長五尺、寬二尺、厚一尺，用丁順相間砌築，以桐油、江米汁拌石灰漿砌，上半部條石之間，用鐵鋦、鐵錠連接。塘底寬12尺，一般砌18層、高18尺，每層向內收縮，頂寬四尺半。它與黃光升石塘相比，雖然小許多，但整體性能優於它。第三，護塘工程也更講究，一方面，在石塘的背海面，培砌碎石和泥土，以加強塘身的御潮性能和防止潮水滲入。另一方面，在石塘的向海面修建坦水，用石塊從塘腳向外斜砌。坦水寬度從12尺到48尺不等，以保護塘腳，消減潮波能量(圖19)。
由於康熙五十九年(公元1720年)和雍正二年(公元1724年)的大潮，受害面很廣，除浙西海塘受到嚴重破壞外，錢塘江口南面和長江口南面的海塘，也多遭破壞。所以清朝除重建浙西海塘外，也在錢塘江近海以南和長江近海以南，修建規模較大的海塘工程。如在浙江的紹興、上虞、餘姚等地，重建7000多丈的海塘；又如將蘇、滬的華亭、松江、上海、南匯、寶山等地的殘破土塘，陸續改建成為石塘等。上述這些地區涌潮的破壞比浙西小，因此，這些地區的石塘多是輕型石塘，造價較低，每丈約為50兩紋銀。
此外，在崇明島，清朝也著手興建海塘工程。崇明島是今天我國第三大島，面積1000多平方公里。唐朝時，它還是一個小沙洲，面積只有十幾平方公里，由於江水和潮水中的泥沙沉積，到明、清時，逐步發展成為大島。從明末起，為了圍墾這塊新地，人們開始在島上修建簡單的海堤。乾隆時，築了一條具有一定規模的土堤，長100多里。光緒時，兩江總督劉坤一又在其上修建石堤。
清朝在防止涌潮災害方面，還作了一些新的探索。一是設法使錢塘江大潮的主溜走中小門。由於涌潮的主溜走北大門和南大門，都易釀成嚴重的潮災，特別是走北大門，災害更為嚴重，只有走中小門，潮災才較小。因此，乾隆時曾組織力量，疏浚中小門水道，引涌潮主溜由此通過，並取得了一定的效果。這是很有意義的探索。二是清末修建海塘時，嘗試著在工程中使用了新式建築材料水泥。這一試驗當時雖因地基沉陷而失敗，但卻為人們提供了經驗教訓。民國時期，以水泥作為塘工的材料，逐漸增多，並取得了一些成就(圖20)。
千百年來，蘇、滬、浙海塘工程的發展，反映了當地人民與潮災鬥爭的堅強毅力和聰明才智。海塘的修建，對廣大人民的人身安全，對當地的工農業生產，都是有力的保證。