所有的水利設施，都必須勤於維修。黃河多沙，這裡的水利設施更是如此。明清之際，因為改朝換代，黃河堤防失修，洪沙災害，又非常嚴重。據統計，從順治元年(公元1644年)清朝建立，到康熙十五年(公元1676年)，33年中，發生嚴重決口的竟有23年；豫東、魯西、冀南、蘇北等地洪水橫流，南北漕運一再中斷。康熙十六年，當時儘管吳三桂等「三藩之亂」尚未最後平定，清政府還是任命靳輔為治河總督，主持治理黃河和運河。
陳潢是靳輔的幕僚，平時重視調查研究，知識淵博。在治河方面，他雖與前人一樣，主張「必以堤防為先務」，強調築堤的作用，但他又力主治河方法多樣化，認為必須因地制宜，並說「或疏、或蓄、或束、或泄、或分、或合，而俱得自然之宜」。後來，他甚至提出，阻止泥沙下行，是治河之本。萌發了後代保持水土的思想。這一思想雖然一時未被當時人們所重視，但他的其他治河主張，卻被靳輔在治河實踐中採用了。
靳輔、陳潢治河，主要措施與潘季馴基本相同，即築堤束水，以水攻沙。但築堤範圍要比潘氏廣泛，除修復潘氏舊堤外，又在潘氏不曾修建的河段加以修建。如河南境內，他們認為「河南在上游，河南有失，則江南(原文為南字，當為北字之誤)河道淤淀不旋踵」。因此，在河南中部和東部的滎陽、儀封、考城(儀、考都已併入蘭考)等地，都修建了縷、遙二堤。又如在蘇北雲梯關(今濱海縣縣治)以東，潘氏認為這裡地近黃海，不屑修建河堤。而靳、陳認為「治河者必先從下流治起，下流疏通，則上流自不飽漲」。因而也修建了18000丈束水攻沙的河堤。
但靳、陳治河除上面所說的與潘氏有異同外，還在許多方面超過了潘氏。潘氏只強調築堤束水，以水攻沙，而靳、陳除了也很強調束水攻沙外，又十分重視人力的疏導作用。他認為三年以內的新淤，比較疏鬆，河水容易沖刷，而五年以上的舊淤，已經板結，非靠人力浚挖不可。他們不僅注意人力浚挖，還總結出一套「川」字形的挖土法。其法，在堵塞決口以前，在舊河床上的水道兩側三丈處，各開一條寬八丈深溝，加上水道，成為「川」字形。堵決口、挽正流後，三條水道很快便可將中間未挖的泥沙衝掉。「川」字形挖土法，可減輕挖土的工作量，挖出來的泥沙，又可用來加固堤防。在疏浚河口時，他們還創造了帶水作業的刷沙機械，系鐵掃帚於船尾，當船來回行駛時，可以翻起河底的泥沙，再利用流水的衝力，將泥沙送到深海中。這是我國利用機械治河的濫觴。
靳、陳等經過10年不懈的努力，堵決口，疏河道，築堤防，成績超過前人。以築堤為例，累計築了1000多里。這樣，不僅確保了南北運河的暢通，也為豫東、魯西、冀南、蘇北的復甦，創造了條件(圖17)。
靳輔、陳潢等雖然在治河工作中取得了重大的成就，但不久，卻遭到壞人陷害，受到不公平的待遇。當他們基本上治平河患後，黃河下游一些因洪水泛濫而無法耕種的土地可以耕種了。一些有政治後台的豪強們，利用權勢，紛紛霸佔這些土地。靳、陳加以制止，並用這些土地募民屯墾。認為這樣做，一可以安置流民，二可以增加治河經費。結果，遭到了豪強們的誣告，誣以「攘奪民田，妄稱屯墾」。結果，靳輔被罷官，陳潢被下獄。
為了開發黃河下游，為了這一地區人民生命財產的安全，元、明、清三代還為了保運，千百年來，人們與黃河的水沙災害，進行著頑強的鬥爭。他們取得了許多成就，為這一地區經濟、政治、文化的繁榮，提供最必要的保證。但黃河下游水沙災害的根源不在下游本身，而是在中上游，特別是中游。然而古人對這個問題缺乏認識，或認識不深，將全部力量放在下游。只知築堤、浚河等，不知治本、治理中游的水土流失，所以受到很大的局限。只有統籌安排，綜合治理，以中游為主，兼及上游和下游；以保持水土為主，兼及建水庫、築堤防、浚河道，才能取得更好的效果。