經過長期的泥沙淤積，王景、王吳治理的這條原來地勢較低、河床較深的河道，又被逐漸抬高了。到唐朝，決口泛濫開始增多。到北宋慶曆八年(公元1048年)，河決濮陽東面的商胡埽〔sao掃〕，終於導致一次重大的改道，向北流經館陶、臨清、武城、武邑、青縣等地方，至今天津市境入海。南宋建炎二年(公元1128年)，金兵南下，東京留守杜充妄圖用河水攔擋，決開黃河南堤。軍事目的並未達到，卻釀成豫東、魯西、蘇北的大災，黃河下遊河道再一次大遷徙，奪泗水、淮水河道，與泗、淮合槽入海。
賈魯治黃河，恩多怨亦多。
河決白茅堤後，賈魯是主張徹底治河的大臣之一。在如何治河的問題上，他主張堵塞白茅堤決口，挽河南流，回到泗水、淮水舊道，東入黃海。挽河南流，工程量很大，但對保運有利，符合元朝政府的要求。於是，元順帝於至正十一年(公元1351年)，命他為工部尚書，率領汴梁、大名等路民夫15萬，廬州等地戍兵二萬，開往工地。工程於當年四月正式開始。
大體上說，賈魯這次治河的施工順序，先治理白茅堤決口以下的黃河舊道，再堵塞白茅堤決口。這是由於治理舊道的工程量很大，要浚深展寬河床，要截彎取直，要修建堤防等，只有在堵口之前，在河床乾涸的情況下，最便於施工。但是，將堵口工程安排在後期，又會遇上七-九月間的黃河汛期，而汛期堵口，非常艱難，是治河大忌。由於賈氏事先對堵口工程制訂了詳細的方案，作了周密的準備和部署，因此，堵口工程和疏浚工程一樣，都進行得比較順利。當年十一月，全部工程峻工。先後疏浚黃河故道280餘里，修築堤防700多里，堵塞治理大小決口107處。工程量如此巨大，耗時僅為八個月，很不容易。治理後的河道流路，大致說，經今封丘、曹縣、商丘、碭山等縣市境內，徐州以下，循泗水、淮水河道，注入黃海。
這條由人工決口形成的黃河下游新道，問題很多。從決口到泗水一段，系在泛濫中形成，河床很淺，極易漫溢成災；泗水以下一段，河道狹窄，又有徐州洪、呂梁洪之險，很難容納黃河汛期洪水。因此，從金代起，它頻繁決口和泛濫。元至正四年(公元1344年)，黃河在山東白茅堤的決口特別嚴重，水災遍及豫東、魯西南、冀南等地，不僅危及人民生命財產，而且沖毀了會通河，切斷了南糧北運的運河航道。元朝政府遂下決心治河。
賈魯勇於負責，敢於創新，並在治河上的成就，人們基本上都予以肯定。但是，由於他施工過急，「不恤民力」，強制人們夜以繼日的勞作，使這次治河成為元末農民大起義的導火線，也受到了人們的非議。賈魯治河，雖然存在著一些缺陷，但成績還是主要的。下面一詩，便反映了後人對他的基本看法。