起柔兆涒灘，盡柔兆敦牂，凡十一年。
建武十二年（丙申，公元三六年）
春，正月，吳漢破公孫述將魏堂、公孫永於魚涪津，遂圍武陽。述遣子婿史興救之，漢迎擊，破之，因入犍為界；諸縣皆城守。詔漢直取廣都，據其心腹。漢乃進軍攻廣都，拔之，遣輕騎燒成都市橋。公孫述將帥恐懼，日夜離叛，述雖誅滅其家，猶不能禁。帝必欲降之，又下詔喻述曰：「勿以來歙、岑彭受害自疑，今以時自詣，則宗族完全。詔書手記，不可數得。」述終無降意。
秋，七月，馮駿拔江州，獲田戎。
帝戒吳漢曰：「成都十餘萬眾，不可輕也。但堅據廣都，待其來攻，忽與爭鋒。若不敢來，公轉營迫之，須其力疲，乃可擊也。」漢乘利，遂自將步騎二萬進逼成都；去城十餘里，阻江北營，作浮橋，使副將武威將軍劉尚將萬餘人屯於江南，為營相去二十餘里。帝聞之大驚，讓漢曰：「比敕公千條萬端，何意臨事勃亂！既輕敵深入，又與尚別營，事有緩急，不復相及。賊若出兵綴公，以大眾攻尚，尚破，公即敗矣。幸無它者，急引兵還廣都。」詔書未到，九月，述果使其大司徒謝豐、執金吾袁吉將眾十許萬，分為二十餘營，出攻漢，使別將將萬餘人劫劉尚，令不得相救。漢與大戰一日，兵敗，走入壁，豐因圍之。漢乃召諸將厲之曰：「吾與諸君逾越險阻，轉戰千里，遂深入敵地，至其城下，而今與劉尚二處受圍，勢既不接，其禍難量；欲潛師就尚於江南，並兵御之。若能同心一力，人自為戰，大功可立；如其不然，敗必無餘。成敗之機，在此一舉。」諸將皆曰：「諾。」於是饗士秣馬，閉營三日不出，乃多樹幡旗，使煙火不絕，夜，銜枚引兵與劉尚合軍。豐等不覺，明日，乃分兵拒水北，自將攻江南。漢悉兵迎戰，自旦至晡，遂大破之，斬豐、吉。於是引還廣都，留劉尚拒述，具以狀上，而深自譴責。帝報曰：「公還廣都，甚得其宜，述必不敢略尚而擊公也。若先攻尚，公從廣都五十里悉步騎赴之，適當值其危困，破之必矣！」正是漢與述戰於廣都、成都之間，八戰八克，遂軍於其郭中。臧宮拔綿竹，破涪城，斬公孫恢；復攻撥繁、郫，與呈漢會於成都。
李通欲避權勢，乞骸骨；積二歲，帝乃聽上大司空印綬，以特進奉朝請。後有司奏封皇子，帝感通首創大謀，即日，封通少子雄為召陵侯。
公孫述困急，謂延岑曰：「事當奈何！」岑曰：「男兒當死中求生，可坐窮乎！財物易聚耳，不宜有愛。」述乃悉散金帛，募敢死士五千餘人以配岑。岑於市橋偽建旗幟，鳴鼓挑戰，而潛遣奇兵出吳漢軍後襲擊破漢，漢墮水，緣馬尾得出。漢軍餘七日糧，陰具船，欲遁去。蜀郡太守南陽張堪聞之，馳往見漢，說述必敗，不宜退師之策。漢從之，乃示弱以挑敵。冬，十一月，臧宮軍咸陽門；戊寅，述自將數萬人攻漢，使延岑拒宮。大戰，岑三合三勝，自旦及日中，軍士不得食，並疲。漢因使護軍高午、唐邯將銳卒數萬擊之，述兵大亂；高午奔陳刺述，洞胸墮馬，左右輿入城。述以兵屬延岑，其夜，死；明旦，延岑以城降。辛巳，吳漢夷述妻子，盡滅公孫氏，並族延岑，遂放兵大掠，焚述宮室。帝聞之怒，以譴漢。又讓劉尚曰：「城降三日，吏民從服，孩兒、老母，口以萬數，一旦放兵縱火，聞之可為酸鼻。尚宗室子孫，嘗更吏職，何忍行此！仰視天，俯視地，觀放麑、啜羹，二者孰仁？良失斬將弔民之義也！」
初，述征廣漢李業為博士，業固稱疾不起。述羞不能致，使大鴻臚尹融奉詔命以劫業，「若起則受公侯之位，不起，賜以毒酒。」融譬旨曰：「方今天下分崩，孰知是非，而以區區之身試於不測之淵乎！朝廷貪慕名德，曠官缺位，於今七年，四時珍御，不以忘君；宜上奉知己，下為子孫，身名俱全，不亦優乎！」業乃嘆曰：「古人危邦不入，亂邦不居，為此故也。君子見危授命，何乃誘以高位重餌哉！」融曰：「宜呼室家計之。」業曰：「丈夫斷之於心久矣，何妻子之為！」遂飲毒而死。述恥有殺賢之名，遣使吊祠，賻贈百匹，業子翚逃，辭不受。述又騁巴郡譙玄，玄不詣；亦遣使者以毒藥劫之，太守自詣玄廬，勸之行，玄曰：「保志全高，死亦奚恨！」遂受毒藥。玄子瑛泣血叩頭於太守，願奉家錢千萬以贖父死，太守為請，述許之。述又征蜀郡王皓、王嘉，恐其不至，先系其妻子，使者謂嘉曰：「速裝，妻子可全。」對曰：「犬馬猶識主，況於人乎！」王皓先自刎，以首付使者。述怒，遂誅皓家屬。王嘉聞而嘆曰：「後之哉！」乃對使者伏劍而死。犍為費貽不肯仕述，漆身為癩，陽狂以避之。同郡任永、馮信皆托青盲以辭征命。帝既平蜀，詔贈常少為太常，張隆為光祿勛。譙玄已卒，祠以中牢，敕所在還其家錢，而表李業之閭。征費貽、任永、馮信，會永、信病卒，獨貽仕至合浦太守。上以述將程烏、李育有才幹，皆擢用之。於是西土咸悅，莫不歸心焉。
初，王莽以廣漢文齊為益州太守，齊訓農治兵，降集群夷，甚得其和。公孫述時，齊固守拒險，述拘其妻子，許以封侯，齊不降。聞上即位，間道遣使自聞。蜀平，征為鎮遠將軍，封成義侯。
十二月，辛卯，揚武將軍馬成行大司空事。
是歲，參狼羌與諸種寇武都，隴西太守馬援擊破之，降者萬餘人，於是隴右清靜。援務開恩信，寬以待下，任吏以職，但總大體，而賓客故人日滿其門。諸曹時白外事，援輒曰：「此丞、掾之任，何足相煩！頗哀老子，使得遨遊。若大姓侵小民，黠吏不從令，此乃太守事耳。」傍縣嘗有報讎者，吏民驚言羌反，百姓奔入城，狄道長詣門，請閉城發兵。援時與賓客飲，大笑曰：「虜何敢復犯我！曉狄道長，歸守寺舍。良怖急者，可床下伏。」後稍定，郡中服之。
詔：「邊吏力不足戰則守，追虜料敵，不拘以逗留法。」
山桑節侯王常、牟平烈侯耿況、東光成侯耿純皆薨。況疾病，乘輿數自臨幸，復以弇弟廣、舉並為中郎將。弇兄弟六人皆垂青紫，省侍醫藥，當世以為榮。
盧芳與匈奴、烏桓連兵，數寇邊。帝遣驃騎大將軍杜茂等將兵鎮守北邊，治飛狐道，築亭障，修烽燧，凡與匈奴、烏桓大小數十百戰，終不能克。
上詔竇融與五郡太守入朝。融等奉詔而行，官屬賓客相隨，駕乘千餘兩，馬牛羊被野。既至，詣城門，上印綬。詔遣使者還侯印綬，引見，賞賜恩寵，傾動京師。尋拜融冀州牧。又以梁統為太中大夫，姑臧長孔奮為武都郡丞。姑臧在河西最為富饒，天下未定，土多不修檢操，居縣者不盈數月，輒致豐積；奮在職四年力行清潔，為眾人所笑，以為身處脂膏不能自潤。及從融入朝，諸守、令財貨連轂，彌竟川澤；唯奮無資，單車就路，帝以是賞之。帝以睢陽令任延為武威太守，帝親見，戒之曰：「善事上官，無失名譽。」延對曰：「臣聞忠臣不和，和臣不忠。履正奉公，臣子之節；上下雷同，非陛下之福。善事上官，臣不敢奉詔。」帝嘆息曰：「卿言是也！」
世祖光武皇帝中之下建武十三年（丁酉，公元三七年）
春，正月，庚申，大司徒侯霸薨。
戊子，詔曰：「郡國獻異味，其令太官勿復受！遠方口實所以薦宗廟，自如舊制。」時異國有獻名馬者，日行千里，又進寶劍，價直百金。詔以劍賜騎士，馬駕鼓車。上雅不喜聽音樂，手不持珠玉，嘗出獵，車駕夜還，上東門候汝南郅惲拒關不開。上令從者見面於門間，惲曰：「火明遼遠。」遂不受詔。上乃回，從東中門入。明日，惲上書諫曰：「昔文王不敢盤於游田，以萬民惟正之供。而陛下遠獵山林，夜以繼晝，其如社稷宗廟何！」書奏，賜惲布百匹，貶東中門候為參封尉。
二月，遣捕虜將軍馬武屯虖沱河以備匈奴。
盧芳攻雲中，久不下。其將隨昱留守九原，欲脅芳來降；芳知之，與十餘騎亡入匈奴，其眾盡歸隨昱，昱乃詣闕降。詔拜昱五原太守，封鐫胡侯。
朱祜奏：「古者人臣受封，不加王爵。」丙辰，詔長沙王興、真定王得、河間王邵、中山王茂皆降爵為侯。丁巳，以趙王良為趙公，太原王章為齊公，魯王興為魯公。是時，宗室及絕國封侯者凡一百三十七人。富平侯張純，安世之四世孫也，歷王莽世，以孰謹守約保全前封；建武初，先來詣闕，為侯如故。於是有司奏：「列侯非宗室不宜復國。」上曰：「張純宿衛十有餘年，其勿廢！」更封武始侯，食富平之半。
庚午，以紹嘉公孔安為宋公，承休公姬常為衛公。
三月，辛未，以沛郡太守韓歆為大司徒。
丙子，行大司空馬成復為揚武將軍。
吳漢自蜀振旅而還，至宛，詔過家上冢，賜谷二萬斛；夏，四月，至京師。於是大饗將士，功臣增邑更封凡三百六十五人，其外戚、恩澤封者四十五人。定封鄧禹為高密侯，食四縣；李通為固始侯，賈復為膠東侯，食六縣；余各有差。已歿者益封其子孫，或更封支庶。帝在兵間久，厭武事，且知天下疲耗，思樂息肩，自隴、蜀平後