起強圉大淵獻，盡屠維赤奮若，凡三年。
世祖光武皇帝上之下建武三年（丁亥，公元二七年）
春，正月，甲子，馮異為征西大將軍。鄧禹慚於受任無功，數以飢卒徼赤眉戰，輒不利；乃率車騎將軍鄧弘等自河北度至湖，要馮異共攻赤眉。異曰：「異與賊相拒數十日，雖虜獲雄將，餘眾尚多，可稍以恩信傾誘，難卒用兵破也。上今使諸將屯澠池，要其東，而異擊其西，一舉取之，此萬成計也！」禹、弘不從，弘遂大戰移日。赤眉陽敗，棄輜重走；車皆載土，以豆覆其上，兵士飢，爭取之。赤眉引還，擊弘，弘軍潰亂；異與禹合兵救之，赤眉小卻。異以士卒飢倦，可且休。禹不聽，復戰，大為所敗，死傷者三千餘人，禹以二十四騎脫歸宜陽。異棄馬步走，上回溪孤，與麾下數人歸營，收其散卒，復堅壁自守。
辛巳，立四親廟於雒陽，祀父南頓君以上至春陵節候。
壬午，大赦。
閏月，乙巳，鄧禹上大司徒、梁侯印綬；詔還梁侯印綬，以為右將軍。馮異與赤眉約期會戰，使壯士變服與赤眉同，伏於道側。旦日，赤眉使萬人攻異前部，異少出兵以救之；賊見勢弱，遂悉眾攻異，異乃縱兵大戰。日昃，賊氣衰，伏兵卒起，衣服相亂，赤眉不復識別，眾遂驚潰；追擊，大破之於崤底，降男女八萬人。帝降璽書勞異曰：「始雖垂翅回溪，終能奮翼澠池，可謂失之東隅，收之桑榆。方論功賞，以答大勛。」
赤眉餘眾東向宜陽。甲辰，帝親勒六軍，嚴陣以待之。赤眉忽遇大軍，驚震不知所謂，乃遣劉恭乞降曰：「盆子將百萬眾降陛下，何以待之？」帝曰：「待汝以不死耳！」丙午，盆子及丞相徐宣以下三十餘人肉袒降，上所得傳國璽綬。積兵甲宜陽城西，與熊耳山齊。赤眉眾尚十餘萬人，帝令縣廚皆賜食。明旦，大陳兵馬臨雒水，令盆子君臣列而觀之。帝謂樊崇等曰：「得無悔降乎？朕今遣卿歸營，勒兵鳴鼓相攻，決其勝負，不俗強相服也。」徐宣等叩頭曰：「臣等出長安東都門，君臣計議，歸命聖德。百姓可與樂成，難與圖始，故不告眾耳。今日得降，猶去虎口歸慈母，誠歡誠喜，無所恨也！」帝曰：「卿所謂鐵中錚錚，亻庸中佼佼者也。」戊申，還自宜陽。帝令樊崇等各與妻子居雒陽，賜之田宅。其後樊崇、逢安反，誅；楊音、徐宣卒於鄉里。帝憐盆子，以為趙王郎中；後病失明，賜滎陽均輸官地，使食其稅終身。劉恭為更始報仇，殺謝祿，自系獄；帝赦不誅。
二月，劉永立董憲為海西王。永聞伏隆至劇，亦遣使立張步為齊王。步貪王爵，猶豫未決。隆曉譬曰：「高祖與天下約，非劉氏不王；今可得為十萬戶侯耳！」步欲留隆，與共守二州；隆不聽，求得反命，步遂執隆而受永封。隆遣間使上書曰：「臣隆奉使無狀，受執凶逆；雖在困厄，授命不顧。又，吏民知步反畔，心不附之，願以時進兵，無以臣隆為念！臣隆得生到闕廷，受誅有司，此其大願。若令沒身寇手，以父母、昆弟長累陛下。陛下與皇后、太子永享萬國，與天無極！」帝得隆奏，召其父湛，流涕示之曰：「恨不且許而遽求還也！」其後步遂殺之。帝方北憂漁陽，南事梁、楚，故張步得專集齊地，據郡十二焉。
帝幸懷。
吳漢率耿弇、蓋延擊青犢於軹西，大破降之。
三月，壬寅，以司直伏湛為大司徒。
涿郡太守張豐反，自稱天上大將軍，與彭寵連兵。朱浮以帝不自征彭寵，上疏求救。詔報曰：「往年赤眉跋扈長安，吾策其無谷必東；果來歸附。今度此反虜，勢無久全，其中必有內相斬者。今軍資未充，故須後麥耳！」浮城中糧盡，人相食，會耿況遣騎來救，浮乃得脫身走，薊城遂降於彭寵。寵自稱燕王，攻拔右北平、上谷數縣，賂遣匈奴，借兵為助；又南結張步及富平、獲索諸賊，皆與交通。
帝自將征鄧奉，至堵陽。奉逃歸淯陽，董？降。夏，四月，帝追奉至小長安，與戰，大破之；奉肉袒因朱祜降。帝憐奉舊功臣，且釁起吳漢，欲全宥之。岑彭、耿弇諫曰：「鄧奉背恩反逆，暴師經年，陛下既至，不知悔善，而親在行陳，兵敗乃降；若不誅奉，無以懲惡！」於是斬之。復朱祜位。
延岑既破赤眉，即拜置牧守，欲據關中。時關中眾寇猶盛，岑據藍田，王歆據下邽，芳丹據新豐，蔣震據霸陵，張邯據長安，公孫守據長陵，楊周據谷口，呂鮪據陳倉，角閎據汧，駱延據盩厔，任良據雩阝，汝章據槐里，各稱將軍，擁兵多者萬餘人，少者數千人，轉相攻擊。馮異且戰且行，屯軍上林苑中。延岑引張邯、任良共攻異；異擊，大破之，諸營保附岑者皆來降，岑遂自武關走南陽。時百姓飢餓，黃金一斤易豆五升，道路斷隔，委輸不至，馮異軍士悉以果實為糧。詔拜南陽趙匡為右扶風，將兵助異，並送縑、谷。異兵谷漸盛，乃稍誅擊豪傑不從令者，褒賞降附有功勞者，悉遣諸營渠帥詣京師，散其眾歸本業，威行關中。唯呂鮪、張邯、蔣震遣使降蜀，其餘悉平。
吳漢率驃騎大將軍杜茂等七將軍，圍蘇茂於廣樂，周建招集得十餘萬人救之。漢迎與之戰，不利，墮馬傷膝，還營；建等遂連兵入城。諸將謂漢曰：「大敵在前，而公傷卧，眾心懼矣！」漢乃勃然裹創而起，椎牛饗士，慰勉之，士氣自倍。旦日，蘇茂、周建出兵圍漢；漢奮擊，大破之，茂走還湖陵。睢陽人反城迎劉永，蓋延率諸將圍之；吳漢留杜茂、陳俊守廣樂，自將兵助延圍睢陽。
車駕自小長安引還，令岑彭率傅俊、臧宮、劉宏等三萬餘人南擊秦豐。五月，己酉，車駕還宮。
乙卯晦，日有食之。
六月，壬戌，大赦。
延岑攻南陽，得數城；建威大將軍耿弇與戰於穰，大破之。岑與數騎走東陽，與秦豐合；豐以女妻之。建義大將軍朱祜率祭遵等與岑戰於東陽，破之；岑走歸秦豐。祜遂南與岑彭等軍合。延岑護軍鄧仲況擁兵據陰縣，而劉歆、孫龔為其謀主；前侍中扶風蘇竟以書說之，仲況與龔降。竟終不伐其功，隱身樂道，壽終於家。秦豐拒岑彭於鄧，秋，七月，彭擊破之。進圍豐於黎丘，別遣積弩將軍傅俊將兵徇江東，揚州悉定。
蓋延圍睢陽百日，劉永、蘇茂、周建突出，將走酇；延追擊之急，永將慶吾斬永首降。蘇茂、周建奔垂惠，共立永子紆為梁王。佼強奔保西防。冬，十月，壬申，上幸春陵，祠園廟。
耿弇從容言於帝，自請北收上谷兵未發者，定彭寵於漁陽，取張豐於涿郡，還收富平、獲索，東攻張步，以平齊地。帝壯其意，許之。
十一月，乙未，帝還自春陵。
是歲，李憲稱帝，置百官，擁九城，眾十餘萬。
帝謂太中大夫來歙曰：「今西州未附，子陽稱帝，道里阻遠，諸將方務關東，思西州方略，未知所在，奈何？」歙曰：「臣嘗與隗囂相遇長安。其人始起，以漢為名。臣願得奉威命，開以丹青之信，囂必束手自歸。則述自亡之勢，不足圖也！」帝然之，始令歙使於囂。囂既有功於漢，又受鄧禹爵署，其腹心議者多勸通使京師，囂乃奉奏詣闕。帝報以殊禮，言稱字，用敵國之儀，所以慰藉之甚厚。
世祖光武皇帝上之下建武四年（戊子，公元二八年）
正月，甲申，大赦。
二月，壬子，上行幸懷；壬申，還雒陽。
延岑復寇順陽；遣鄧禹將兵擊破之。岑奔漢中。公孫述以岑為大司馬，封汝寧王。
田戎聞秦豐破，恐懼，欲降。其妻兄辛臣圖彭寵、張步、董憲、公孫述等所得郡國以示戎曰：「雒陽地如掌耳，不如且按甲以觀其變。」戎曰：「以秦王之強，猶為征南所圍，吾降決矣！」乃留辛臣使守夷陵，自將兵沿江溯沔止黎丘。辛臣於後盜戎珍寶，從間道先降於岑彭，而以書招戎曰：「宜以時降，無拘前計！」戎疑臣賣己，灼魚卜降，兆中坼，遂復反，與秦豐合。岑彭擊破之，戎亡歸夷陵。
夏，四月，丁巳，上行幸鄴；己巳，幸臨平，遣吳漢、陳俊、王梁擊破五校於臨平。鬲縣五姓共逐守長，據城而反；諸將爭欲攻之。吳漢曰：「使鬲反者，守長罪也。敢輕冒進兵者斬！」乃移檄告郡使收守長，而使人謝；城中五姓大喜，即相率降。諸將乃服，曰：「不戰而下城，非眾所及也！」
五月，上幸元氏，辛巳，幸盧奴，將親征彭寵。伏湛諫曰：「今兗、豫、青、冀，中國之都，而寇賊縱橫，未及從化。漁陽邊外荒耗，豈足先圖！陛下舍近務遠，棄易求難，誠臣之所惑也！」上乃還。
帝遣建義大將軍朱祜、建威大將軍耿弇、征虜將軍祭遵、驍騎將軍劉喜討張豐於涿郡。祭遵先至，急攻豐；禽之。初，豐好方術，有道士言豐當為天子，以五彩囊裹石系豐肘，雲，「石中有玉璽」。豐信之，遂反。既執，當斬，猶曰：「肘石有玉璽。」傍人為椎破之，豐乃知被詐，仰天嘆曰：「當死無恨！」上詔耿弇進擊彭寵。弇以父況與寵同功，又兄弟無在京師者，不敢獨進，求詣雒陽。詔報曰：「將軍舉宗為國，功效尤著，何嫌何疑，而欲求征！