當神魔兩族達成了默契，用蜀山群峰鎮壓住神魔之井，原本打得熱火朝天的神魔之井戰線一下子變得冷清。剛開始時還有些小股的神軍和魔兵在疆界兩側巡視，隨著時間流逝，後來所有的兵力，只剩下兩位將軍。魔界一方，由蚩尤嫡傳的重樓巡視邊界。這時候他已經被尊為魔尊。因為不想介入魔界沸騰如岩漿般的攻殺爭鬥，再加上對有些事情的心灰意冷，魔尊重樓選擇了整日巡視在空空蕩蕩的神魔邊界。
神界這一邊，巡守邊疆的人選恰好也是對面那位守將的老熟人，神將飛蓬。
因為千年大戰中發生的一些事情，飛蓬雖然沒有被共工的讒言打倒，但在神界的地位已大不如前。當年他仁愛守信、果敢多謀的聲名，隨著和平歲月的到來，逐漸隨著時間消淡。同時在一些神族長老的刻意冷落下，最終神界中流傳的飛蓬評價，只是個曾經有些個戰績、現在劍法還不錯的武夫。這樣的過氣人物，自然最適合巡守那冷冷清清、鬼影都不見一個的神魔邊疆。
於是，兒時的夥伴、戰時的敵手，最後就在這樣的時機下，用這樣的方式重新相守千年。魔尊自不必說，從來獨來獨往，在寥廓的邊界上並不感到寂寞；但飛蓬不同，他還有個傾心相知的愛侶夕瑤。地位的下降，職責的邊緣化，反而讓他們兩人的愛情更加堅貞。
因為神界飛升後，缺少了盤古大陸的資源支撐，於是能搜集匯聚天地靈氣的神樹更加重要。作為神樹的守護女神，相比她曾經聲名顯赫的愛侶，夕瑤反而在地位上發生了一個戲劇性的轉變。她以神樹守護者的身份，成了除九天玄女、葵羽玄女外，神界最重要的女神。地位的變化，加上本來就明媚的外表、清幽的氣質，給夕瑤帶了更多的仰慕者。
但所謂「有得必有失」，看守神樹的職責變得如此重要，夕瑤便再也不能輕離職守。而神樹之圃因為天然的特質，並非一般的神族能夠進入。所以，日復一日，月復一月，年復一年，嬌艷如春花的神女，就在千里無人的神樹之圃，寂寞了青春的容顏。天道守恆的法則，再一次在夕瑤這裡得到了驗證。
因為神界浮於高渺天穹，則神樹背後的天際圓月，顯得更為巨碩。但在這樣的巨月清光下，卻更顯得神女寂寞。
「神女生涯原是夢，小姑居處本無郎。」夕瑤的生涯，幾近於此。不過幸運的是，她還有一位情郎，能夠穿越遼闊的神樹之圃，來到這棵婆娑之樹下，陪伴寂寞的神女。兩顆孤寂的心，在天邊圓月和身畔神樹的見證下，從此靠得更近。
在飛蓬與夕瑤的戀情變得更加深刻和堅貞時，神將與魔尊那種敵友難明的微妙感情，也得到了進一步的延伸。雖然此時名義上還是敵族，兩人各自又身負看守疆域、抵擋對方入侵的職責，但天長日久的寂靜無事下，飛蓬與重樓漸漸地開始私下約定比武。
他們有時就在邊界線上小打小鬧，有時候會去新發現的空間里大打出手。雖然他們兩個對此事做得比較小心，但堅守神樹的那位孤單神女，還是從飛蓬的隻言片語中得知他們私自比武，便對他們的前途表現出不安和憂慮。
在這樣表面穩定、暗藏隱憂的歲月中，還發生了一件小小的插曲。夕瑤有一位最知己的姐妹，名為「靈華仙子」，因為偷偷前去神魔邊界，與對面一位有大法力的魔族勇士相戀，便違反了神界的規條，即為「天條」，得到了最嚴厲的懲罰。靈華仙子不僅身軀被天雷所殛，灰飛煙滅，其三魂六魄也被拘禁在鬼界幽都里。
這時候鬼界中包含輪迴盤的核心地域，已經被昔日上古五魔神之一的后土大神，率領神官佔領。雖然曾經被女媧打倒，但后土在天帝那裡的榮寵絲毫沒有衰減。當天帝醉心於預言和操控未來宇宙大勢，決定將鬼界輪迴盤納入自己的控制後，便讓后土大神接過了這個神界當年最重要的任務。此後后土帶領精英神官墮入鬼界，在經歷血腥廝殺後，終於控制了輪迴盤，建立了幽都。從此后土本人也有了新的名號，號為「幽都大統領」。
神族建立幽都，除了為天帝管控未來的大業，同時也是建立神界囚犯的拘禁流放之所。所以，當夕瑤的那位好友靈華仙子違反天條被剝奪肉身之後，魂魄便被打入鬼界幽都的神獄之中。
自靈華仙子遭此劇變，夕瑤便芳心震顫，整日蹙眉。飛蓬得知原委，為博美人一笑，便決定要將靈華仙子的靈魄救回。本來，要從已經趨於穩定、受到嚴格管控的鬼界幽都中救出神犯靈魄，不僅千難萬難，還要冒被神界天罰的危險。但飛蓬為了愛侶有個好心情，依然不畏風險，利用昔日的關係和自己越來越精純強大的劍技法力，歷經種種艱險之後，終於將夕瑤的知己姐妹魂魄救回。
當然，遭遇神雷殛身的嬌軀已經無法挽回，但飛蓬還是竭盡法力，讓靈華仙子的魂魄混合神界的煙霞，化為神樹上的一隻靈鳥。自此之後，這隻泯滅了前世神智的靈鳥，整日「靈華」、「靈華」地悅耳叫著，繞樹翩飛，有時還停在夕瑤的手裡肩頭，與她對望嬉戲，聊解苦悶。飛蓬用這樣的方式，讓昔日的兩位知己姐妹，能夠朝夕相處。
從幽都中救出靈華仙子的魂魄，雖然在整個飛蓬的經歷中，算不上什麼大事，但所謂「每下愈況」，越微小卑下的事情越能反映真相；從這樣的小事中便可看出，表面磊落洒脫、不計得失的飛蓬，其實骨子裡有一顆藐視強權的叛逆之心。
而千年大戰之後的神界，越來越拘謹和有序。像飛蓬這樣心存叛逆的神將，從一開始就註定了結局。終有一日，曾經威震三族的神將飛蓬，竟被剝奪神格，絀落凡間，打入輪迴之中！
至於他因為什麼理由，被處以如此嚴重的懲罰，則幾乎不用爭辯。在有心人的處理下，多少年前的陳穀子爛芝麻都被翻起。什麼在千年大戰中私放敵酋、早年傳授給后羿的箭術後來被后羿用來射日、鎮守神魔邊界不顧操守私自與敵族魔尊比武，甚至連他和神女夕瑤的美好戀情，也被說成引誘身擔重責的神樹守護者，從而對整個神界神族的安全造成了重大威脅！
於是，曾經那麼光輝璀璨的神界戰神、號稱「天帝權杖」的神將飛蓬，有一天就這麼被毫無爭議眾口一同地絀落輪迴！
不過，即使是醉心預言和操控未來的天帝伏羲，也無法算到，自己的親信長老們這一個相對整體清洗策略而言「小小的決定」，會對自己那個似乎越來越可控、越來越可知的「未來」，造成如此多的不可知、不可控的影響。
神界的高位者們，很快就看到了飛蓬墮世的第一個影響：
從來鐵板一塊、對族義萬般認同的神族中，出現了第一個投靠敵國魔族的叛逃者！
這便是聞名後世的「葵羽玄女永墮成魔」。
葵羽，神樹誕生的第一位新神族。其出生甚至讓失去人性感情的天帝也心旌搖動，從而對她寵溺無比，還封她為神族中難得的「玄女」頭銜，與自己的女兒九天玄女齊名。那些高高在上、已經無情如聖人的神族高位者，從來想不到，一些流淌在人際間的微妙感情，竟能造成天帝寵女如此犀利和決絕的嚴重後果！
作為神樹誕生的第一位新神族，葵羽玄女擁有著最強大的靈力。不為人知的是，葵羽玄女向來就因為飛蓬曾在她還是一顆神果時，一個小小的守護和救治動作，便將一顆芳心牢牢地拴在他身上。那一次，太古凶禽當扈試圖將她吞噬，結果被飛蓬劍斬；為了安撫她，飛蓬還用神光去除她的驚恐。
葵羽玄女這種感情，有點類似小雞破殼初生時，會把它看到的第一眼之人當成它的母親。飛蓬對還在果殼中的她一個輕輕的手撫動作，便讓她三生悸動，造就一世情緣。
沒有人能想到，並無七情六慾的神樹，竟還誕生出這樣一位重情重義的子女。事實上，作為後來越來越多的神樹新神族，不僅靈力越來越衰減、身上羽衣條縷越來越少，他們的感情也越來越淡漠。但葵羽玄女不同，在她表面純潔清爽、溫柔順從的性情下，掩藏的是一顆如火山岩漿般熱烈的心！
不過，為什麼這樣熱烈的感情，始終沒有對心愛的人噴發？那是葵羽哀傷地看到，飛蓬的一顆心始終都系在那位清幽冷艷的神樹神女身上。對葵羽來說，如果說飛蓬是她的救命恩人，那夕瑤就像看護自己孕育、出生的保姆。自己如何能破壞兩位恩人之間的戀情？所以，一如她後來的決絕舉動，葵羽玄女堅決而痛苦地將自己的情感隱藏在內心的深處。
只不過，這樣的隱藏，並不等於消除；它反而還像埋藏多年的美酒，隨著歲月的流逝變得越來越甘醇刻骨。當她看到飛蓬在戰後歲月里遭遇的種種不公，她也為之憤怒和爭取，但往往徒勞無功。剛烈的玄女，在無人的背後，竟也會為飛蓬的遭遇暗暗抹淚——可以說，葵羽的這份感情，恐怕是古往今來最刻骨和動人的「暗戀」；因為對飛蓬深入骨髓的羞怯，以及對破壞他人戀情的道德潔癖，葵羽玄女在那麼漫長的歲月里，竟幾乎一次都沒跟飛蓬說過話！
所以，當最終飛蓬有一天被處以削除神格、墮入輪迴的慘重神罰之後，一向溫柔