辜鴻銘原本打算在日本終老，但隨著中日關係的惡化，辜日漸受到冷落和白眼。1927年秋，辜隻身踏上歸途，返回北京，蟄居在椿樹衚衕的家中，生活極為貧困，有時甚至無米為炊。
好友梁敦彥去世後，辜鴻銘沉浸在彌爾頓失明後的詩作里。其時，辜精神上異常苦痛，「日惟祈求速死」。
1928年3月，辜鴻銘突然發高燒，各種治療均告無效，身體日漸衰微。後來痰中出現血絲，中西醫診斷均為肺炎。4月底，已經無法進食。病中，辜鴻銘仍不時要求愛女珍東為他朗誦《失樂園》。
30日，辜鴻銘感覺大限來臨，兩個女兒床前飲泣。下午3時40分，辜鴻銘幾乎無聲地說了句「名望、地位都不過是泡泡，轉瞬即逝」之後，永遠地閉上了眼睛。
辜珍東是淑姑所出，辜娜娃為吉田蓉子所出（一說二女均為淑姑所出），她們不僅聰穎明慧，學得多國語言，而且繼承了乃父驕傲、清高的性格。據說，辜的一位弟子暗戀珍東多年，終於鼓足勇氣前來求愛，珍東卻說：「只要你用中、英、法、德、意、日六種文字各寫一封求愛信，什麼都依你。」一句話嚇退了求愛者。辜鴻銘去世後，他的兩個愛女十六歲的辜珍東和辜娜娃在蘇州削髮為尼。
據辜振甫回憶，辜鴻銘只有一子一女，子名守庸，40年代便已去世，無後。女名震東，喜著男裝，經年長袍馬褂，舉止有若鬚眉，終身未嫁。