——1945年8月9日
731部隊把3000多名活人作為細菌戰的實驗材料而殺害，為所欲為地施加惡魔般的暴行，但是，他們崩潰和逃亡的日子終於來臨。日本帝國主義的失敗，帶來了731部隊的崩潰，而直接的契機是蘇軍1945年8月9日開始對日宣戰。
早在頭一年，馬里亞納戰敗（7、8月）、伊姆帕爾作戰的中止（7月）、雷伊泰海戰的放棄（12月）……日軍連續遭到失敗。由於空襲和艦炮射擊，日本國內主要城市遭到破壞，物質生產急劇下降，國土荒廢，曾經沉醉於「大日本帝國萬歲」的勝利幻想中的國民，開始厭惡戰爭而怨聲載道。飢餓和失去親人的悲痛與絕望嚴重地打擊了群眾。
當時，流行著這樣一首「川柳」 ：「如今世道變，金星鐵錨 行無阻，辦事靠情面。」職業軍人、高級官吏和軍火商等公然利用戰爭大發橫財，腐化墮落，但是，前線的幾十萬名官兵卻作為「肉彈」在炮火中死去。在「一機拼一艦」的口號宣傳下，許多有為的年輕人在特攻作戰中喪失了生命。
在歐洲戰線上和日本結成三國同盟的義大利墨索里尼政權已經土崩瓦解，無條件投降（1943年9月）；剩下德國在東部戰線上也遭到嚴重打擊，在蘇軍進攻的面前，一直敗退。法西斯主義在世界上正在逐步崩潰。
1945年夏，在中國大陸，表面上看來，「所向無敵的70萬關東軍」一直在誇耀它的威容，但是，那只是一個假象。伴隨南方戰線局勢的惡化，關東軍的主力20個師被抽調至南方各地，許多軍馬、車輛、重炮、重機槍、飛機以及彈藥也都抽調到南方，甚至連蘇滿邊境的要塞炮都拆了下來，由此可見其裝備水平之低。
關東軍雖然號稱70萬人，但精兵幾乎全部都抽調至南方戰線，在所謂「滿洲總動員」的號召下，在當地徵召參加滿蒙開拓團的民間人士當兵，包括朝鮮人和中國人的部隊在內，好不容易才做到每5個人一支步槍，其中有的部隊是用大刀、鐮刀和驅趕野獸用的獵槍裝備起來的。在不得已時，在缺少武器裝備的情況下，還編成了竹槍部隊。關東軍巳失去了當年的雄姿。敗落的關東軍握有的惟一「現代化武器」就是731部隊製造的各種細菌和毒藥。
1945年3月，再次擔任731部隊長的石井四郎把部隊的代號由731部隊改為25202部隊。同年5月，把部隊幹部召集在一起，下達了著名的「增產訓令」，他說：「日蘇開戰勢在必行，……從今天起，集中731部隊全部力量，突擊增產細菌、跳蚤和老鼠。」他激勵大家說，實驗階段業巳結束，今後要以實施細菌戰的「X日」為目標，堅持增產下去。
731部隊已經研製成功了乾燥保存鼠疫菌技術——製造乾燥菌技術，甚至連毒性比一般鼠疫高60倍的變性菌也已生產出來。鼠疫菌的霧化技術也取得了很大的進展，陶器炸彈也巳經完成，尤其是大量繁殖了具有很強生存力的老鼠和一種「有著有效吸血能力的跳蚤」。
「5月10日還下達命令說，要在今後兩個月內以鼠疫菌為主，大量生產投入井裡和蓄水池裡用的傷寒菌、霍亂菌和污染河流、牧場用的炭疽菌。……在細菌製造廠——『口』字樓一層工作的柄澤班增加了人員，24小時日夜進行生產……結果，僅鼠疫菌就製造了近20公斤……包括貯備的細菌和乾燥菌在內，估計可能達到100公斤」，這是原部隊人員（第四部）做出的證詞。
731部隊在戰爭結束前夕，作為「可以使用」而保存著的各種細菌，數量是非常可觀的，「如果用理想的辦法全部把它撒布開來的話，地球上的人類就會全部死光」。（原部隊人員語）
上級機關下達了「增產300萬隻」老鼠的命令。為了捕捉老鼠，組織了「特別攻擊隊」，部隊人員把大量捕鼠器裝在卡車上，在哈爾濱和新京市內到處轉來轉去，動員居民、中學生、女學生們大捉老鼠。731部隊的各支隊自不待言，無論辦公室或宿舍，都圍起了不到一米高的木板圍牆，甚至派上守夜的人，瘋狂地進行老鼠增產活動。鼠疫跳蚤的增產指標，定為「300公斤」（約十億隻）。田中班裡共有4500個跳蚤飼養器。據說僅在幾天內就確保生產了一億隻跳蚤。
「可是，10億隻馬上就能使用的活蹦亂跳的跳蚤，是一個很嚴重的問題……他們深感在這些跳蚤中撒上鼠疫菌，然後都放到蘇軍中去，放到蘇聯的城市中去……那將會造成怎樣嚴重的後果啊……」原部隊人員回憶說道。
但是，席捲731部隊的「增產細菌、老鼠、跳蚤狂想曲」至1945年8月9日宣告結束。
8月9日拂曉，蘇軍宣布開始對日作戰。
1945年8月9日凌晨0時至1時，蘇軍開始進攻滿洲和朝鮮。在遠東軍總司令華西列夫斯基元帥的指揮下，梅列柯夫元帥統率的第一方面軍從滿洲東部和北朝鮮，布爾柯耶夫大將率領的第二方面軍從北部正面，馬利諾夫斯基元帥統率的第三方面軍從西部邊境，約150萬名蘇軍怒濤般地全線發起進攻。
1945年4月5日，蘇聯政府廢除了和日本簽訂的中立條約。在此之前，於同年2月，美、蘇、英三巨頭在克里米亞半島舉行的會談（雅爾塔會議）確認：「蘇軍在德國投降後三個月內參加對日作戰。」不久後的5月，德軍宣布無條件投降，只剩下日軍以盟軍為對手還在進行作戰。
另方面「蘇軍在蘇滿邊界集結了異常大的兵力」的情報，不斷地送到了大本營參謀總部，日本政府認為，蘇聯宣布對日作戰已僅僅是個時間問題了。
關東軍總司令部也估計蘇軍將要大規模進攻，把迎擊敵人的主力部署在牡丹江一線；從前一年底起，便在吉林省的通化地區修建了大規模的兵站基地，以「6號作戰」為名，把戰略器材和秘密文件等都轉移到了通化。隨之，731部隊的部分器材也轉移到了通化，什麼情況也不了解的只是一般官兵和住在中國東北地區的日本市民，而軍隊的上級機關是深知蘇聯即將參戰的形勢的。
「蘇軍開始進攻」的消息，使整個中國東北地區陷入了大混亂之中。
8月9日蘇軍轟炸機出現在長春上空，並進行空襲。當時很多人都誤認為是美軍飛機，這個笑話廣為人們所知曉。由於市民一點也不知道蘇滿邊界的緊張局勢，所以，蘇軍進攻簡直如同晴天霹靂。
蘇聯採取的戰術是建立在事先透徹研究和周密準備的基礎上的。空軍炸毀了鐵路、軍事設施和機場，爾後，從8月9日半夜到10日拂曉，在坦克的引導下，裝甲部隊怒濤般地向前推進，雖說因地形而有所不同，他們自豪地說，以每天50公里的速度向前推進。
8月10日午夜1時，蘇軍第一遠東方面軍先遣支隊從濱海省地區跨越邊界，開始向哈爾濱——吉林一線發起進攻。根據原蘇聯國防部長馬利諾夫斯基元帥的回憶，上午8時30分，從邊界進入縱深20公里，輕而易舉地突破了日軍防守陣地，當時幾乎連炮兵的支援射擊都不需要。
在蘇軍進攻的當天，731部隊是處於何種狀態呢？據許多原部隊人員做出的一致的供詞，8月9日那一天，石井四郎部隊長不在平房。部隊像平時一樣地執行任務。蘇聯空軍飛機已在中國東北各地開始轟炸，而731部隊全體人員還很平靜，這是一件怪事。但是，有一種說法是：731部隊的幹部都飛往各支隊，正在指揮向通化轉移，石井部隊長從長春的關東軍司令部發給731部隊的密碼電報由於無人解碼而原封不動地放在部隊里，這就是8月9日「731部隊保持平靜」的原因。
731部隊人員從8月9日夜裡開始為之騷動。這一天夜晚，出現在哈爾濱上空的幾架戰鬥機投擲了照明彈。這些都是蘇聯空軍的飛機。
哈爾濱被照得滿天通亮，市民嚇得目瞪口呆，街上亂成一團，甚至連空襲警報器都沒有響。
731部隊人員和他們的家屬在防空洞里度過了一個不安的夜晚，因為有的情報說：「蘇軍已逼近哈爾濱。」
10日清晨，收到關東軍司令部致石井部隊長的一份電報：「立即前來接受命令。」
但是，石井部隊長不在部隊，他的行跡是秘密的，誰也不知道。部隊幹部慌忙利用飛機把N副官送往長春。
N副官到關東軍司令部一看，關東軍司令山田乙三以及各位參謀都巳飛往各地，那裡沒有一個負責幹部。不斷收到來自中國全國各地的緊急電報，詢問有關陸軍參謀本部指示的電報……關東軍司令部像發生火災的現場那樣騷動起來。
N副官報告說前來領受命令，關東軍司令的命令是：「蘇軍的進攻速度極為迅速，關東軍各部隊也都開始轉戰南下，731部隊可以獨斷專行。」
獨斷專行是關東軍的「絕招」，製造諾門坎事件，從柳條湖事件到進攻奉天，關東軍一直無視本國政府的訓令，一口氣擴大了對中國的侵略。
但是，8月10日凌晨，731部隊