渤海郡是袁氏父子經營多年的基地，他們在這一地區的影響持續了十多年。曹操攻佔渤海郡後，需要儘快樹立起自己的權威，保證這一地區長治久安。
袁譚被殺後，曹操命令將其梟首示眾，同時下令誰要敢來哭他，就把他的妻子、兒女一塊兒殺了（敢哭之者戮及妻子）。曹操沒想到偏偏有個人不怕死，跑過來向自己求情，要收殮袁譚。這個人就是袁譚在青州的屬下，州政府秘書長（別駕）王修。
王修曾勸袁譚兄弟和睦相處，共同對付曹操，袁譚不聽。袁譚被殺時，王修在高密，他本有機會逃命，但聽說主人已死，就跑來弔喪，一下馬便哭著喊道：「沒有主人了，還能到哪裡去（無君焉歸）？」
曹操認為他是一個義士，就接見了他。王修說：「我受袁氏的恩德，如果能殮葬舊主，然後自己從容就戮，也沒什麼遺憾了。」
曹操深為王修的大義所感動，同意了他殮葬袁譚的請求。
曹操對王修原本就有好感，南皮攻破之後，他帶人在城內巡視，曾到過一個官員的家裡，看到其全部家產只有不滿十斛糧食，幾百卷書而已，聯想到鄴縣被攻破時查抄審配等人家產數以萬計的情形，當時就對這個官員留下了深刻印象。這個官員正是王修。
曹操禮聘王修到他的司空府工作，擔任處長（司空掾），後來又兼任冶金部隊司令（司金中郎將），這個職務主要負責礦山開採、冶煉以及兵器、農具的鑄造，雖不是一個顯要部門，卻掌管著大部分「軍工企業」，有著重要的地位。
王修幹得很稱職，一干就是七年，期間有很多次升遷的機會，但都因為曹操實在找不出比王修更合適的人接替他而作罷。為此曹操有點過意不去，專門給王修寫了一封長信，表明司金中郎將一職的重要性和對王修工作的肯定。到後來，王修終於改任魏郡太守，在地方治理方面卓有成績。
在此前後，曹操先後以司空和冀州牧的身份頒布了一系列命令，恢複冀州地區的生產和生活，整頓社會秩序。這些命令包括《蠲河北租賦令》、《抑兼并令》、《赦袁氏同惡令》、《整齊風俗令》等。
在《蠲河北租賦令》中，曹操下令免除冀州地區建安九年（204年）全年的田租和賦稅，以恢複和發展生產。這道命令的頒布，受到了百姓的擁護。
袁紹統治冀州期間，政治和軍事上依靠豪強地主，使得這些人的政治和經濟勢力迅速膨脹。長期以來，曹操一直在思考東漢政權在機制上的弊端，他認為豪強勢力發展太快是造成政權衰弱的主要原因，所以對如何抑制豪強勢力的問題十分關注。曹操認為如果這個問題解決得不好，即使得到政權也不會穩固，在關鍵時候上會被豪強勢力們所左右。
基於這些長期的思考和對現實情況的分析，曹操頒布了《抑兼并令》，他強調一個社會「不患寡而患不均，不患貧而患不安」，任由貧富差距拉大，必然會帶來嚴重後果。他說，像審配這樣的家族，不僅經濟實力很強大，而且成為窩藏罪犯的據點，是黑惡勢力的保護傘，老百姓怎麼能擁護這樣的政權？
曹操借民意向豪強勢力開刀是有深思遠慮的，他不願意在自己統治的地區出現豪門經濟和豪門政治。作為抑制豪門的一個重要步驟，在《抑兼并令》中他明確規定，每畝地收租的標準是四升，每戶另收二匹絹、二斤絲，除此之外一律不再收取其它賦稅。他要求各郡縣要嚴格檢查，看看有沒有豪強地主搭順風車額外收取其它稅費的現象，同時禁止弱勢群體替那些豪強們交賦稅。
攻佔南皮後，冀州全境成為「曹統區」，那些曾在袁氏政權及軍隊里任職的各級官員，有的仍舊被錄用，有的則心懷不安，害怕有朝一日會清算他們的舊賬。針對這種情況，曹操在南皮頒布了《赦袁氏同惡令》，明確表示跟袁氏做過壞事的人，允許他們改惡從善（與袁氏同惡者，與之更始）。
袁氏政權之所以失敗，一個重要原因是內部結黨營私、勾心鬥角很嚴重，這種風氣由社會上層傳達到社會的各個層面，成為一種不良風氣。在過去的「袁統區」，不僅官員、豪強們操縱輿論、排斥異己、顛倒黑白，而且在一般老百姓里也存在是非不分、缺乏普遍的社會正義感、歪門邪道盛行等現象，針對這些問題，曹操在南皮又下達了《整齊風俗令》：
「結黨營私是古代聖賢所痛恨的。聽說冀州這個地方，父子也會分成兩派，互相中傷爭鬥。以前直不疑沒有哥哥，大家卻說他與嫂子私通；第五倫三次娶的都是孤女，有人卻說他虐待岳父；王鳳獨斷專行，谷永卻吹捧他為周代的申伯；王商忠誠，張匡說他搞旁門左道。這些都是顛倒黑白、欺君罔上的例子，整頓社會風氣，以上現象不根除，我認為那是恥辱。」
曹操舉的這些例子雖發生於前代，卻都是有所指的。拉幫結派到了很嚴重的程度，就連父子兄弟也分成兩派進行文攻武鬥。他們沒能給社會做出好的表率，以至於民風迅速惡化，不僅敗壞了社會風氣，也影響到社會穩定和生產發展。曹操花大力氣整頓社會風俗，有很強的現實意義和迫切性。
經濟上免除租稅、抑制豪強兼并，政治上化解新舊勢力的衝突，繼而又從整頓社會風氣入手，恢複社會秩序，曹操一系列政策的出台，很快使冀州的社會面貌得到改觀，生產得到了恢複和發展。
在此期間，幽州的局勢也發生了新變化。袁熙的部將焦融和張南看到袁氏集團即將覆滅，於是發動兵變，將袁熙、袁尚趕出幽州，二袁只得投奔遼西的烏桓首領蹋頓。蹋頓以前娶了袁家的姑娘為妻，跟袁家有姻親關係，如今在遼西一帶勢力很大。
焦融自稱幽州刺史，他率全州各郡縣長官歸降曹操。曹操大為高興，幽州不戰而勝，省去了遠征的麻煩，他以朝廷的名義承認焦融為幽州刺史，將焦融、張南都封為列侯。在此之前，一直活躍在幽州的鮮於輔和閻柔已經加入到曹操陣營了。
鮮於輔在官渡之戰前率部歸附曹操，被曹操任命為北部邊防軍副司令（左度遼將軍），封為亭侯，讓他鎮守在幽州，成為牽制袁氏集團的一股力量。官渡之戰時，鮮於輔親自率軍到前線助戰。袁紹敗走，曹操聽到報告欣喜異常，當時鮮於輔剛好就在旁邊，曹操對他說：「年初的時候袁本初送來公孫瓚的人頭，我看了都覺得眩暈（孤自視忽然耳），不想今天把他打敗了，這既是天意，也是大家努力的結果啊！」後來，鮮於輔也參加了南皮之戰。
鮮於輔的戰友和同盟閻柔在北方少數民族中素有聲望，鮮於輔曾經聯合他以及劉虞的兒子劉和等人一直與公孫瓚作戰。公孫瓚死後，閻柔也站在了曹操的一邊，他被曹操任命為抗烏桓軍司令（護烏桓校尉）。南皮之戰後，閻柔又說動一部分烏桓、鮮卑等少數民族首領歸附曹操，獻上名馬，閻柔被封為關內侯。
據《魏略》說，曹操很喜歡閻柔，曾經對他說：「我把你當成兒子一樣，你也要把我當成父親呀（視卿如子，亦欲卿視我如父也）。」閻柔於是跟曹丕等處得像兄弟一般。
有鮮於輔和閻柔，如今又有焦融、張南的歸順，幽州問題可以說初步解決了。但是沒多久，幽州刺史部涿郡故安縣（今河北淶水）人趙犢、霍奴起兵，殺死了刺史焦融以及涿郡太守，在袁熙、袁尚的鼓動下，蹋頓也趁機出動，在幽州刺史部漁陽郡北部的獷平（今北京密雲水庫北）一帶進攻鮮於輔。
這一年的七八月間，曹操率部離開南皮進軍幽州，在涿郡斬殺趙犢、霍奴，又渡過潞河救援獷平，這是曹軍第一次北征幽州。蹋頓所部未作抵抗，撤到了塞外，曹操於是率軍回師鄴縣。
建安十年（205年）十月，曹操回到了鄴縣。此次出征歷時整一年，收穫頗豐，曹軍攻下了南皮，掃蕩了幽州殘敵，將袁熙、袁尚趕到了塞外，原來「袁統區」的北方四州中，已全部佔領冀州、青州和幽州，不太有把握的只有太行山西面的并州，但高幹即使想造反，也沒有什麼大礙了。