現在，讓我們檢討一下興平元年（194年）下半年到興平二年（195年）夏天曹操的軍事行動。在不到一年的時間裡，曹操率軍縱橫馳騁於兗州大地，所向披靡，攻無不克，戰無不勝，與剛從徐州回師時的情形判若兩人。
首先是曹操制定了正確的戰略，在極端劣勢的情況下，他沒有驚惶失措，而是收縮防線，集中兵力，固守戰略要地，尋找機會，發動反擊。
其次是袁紹的支持，由於袁軍在黃河北岸的行動，動搖了呂布固守濮陽的決心，在軍糧匱乏、遠離友軍的情況下，呂布決定向南運動，進入了他不擅長作戰的河湖交叉的濟陰郡、山陽郡一帶，給曹操取勝創造了條件。
再者，是對手接二連三的失誤。在整個戰役中，張邈作為呂布的友軍，應該明白唇齒相依的道理，但他遲遲沒有具體的軍事行動，在與呂布的配合上態度消極，呂布被趕走，他也無法在陳留郡再呆下去。
還有一個內在的原因，就是曹軍的逐漸成熟。曹操手下的將領經過兩次徐州之戰以及與袁術之戰而逐漸成長起來，曹軍從最早的硬沖硬打、常吃敗仗，到現在聲東擊西、遊刃有餘，對戰場形勢的把控能力已有新的躍升。此戰役期間，曹仁、樂進、于禁、李典、程昱等人均有率軍獨立作戰的記載，曹軍由最初獨立的一支軍事力量，已經發展成為一個相互呼應、配合作戰的集團軍。
呂布、陳宮被趕走，張邈、張超被殺，兗州八郡國重新回到曹操手中。這一年的十月，獻帝下詔，正式任命曹操為兗州牧，曹操終於擁有了合法身份，這是他一仗一仗打出來的。
這是一份遲來的任命，當曹操派王比歷盡千辛萬苦前往長安進貢的時候，就是想得到這樣的確認，用自己對皇室的忠心換來一份肯定。但長安的「三人小組」對曹操沒有好感，在他們眼裡曹操比袁術、劉表、陶謙差得遠，儘管丁沖、鍾繇等人從中斡旋，但曹操也只得到了幾句冠冕堂皇的慰問而已。
現在，曹操靠自己的實力打敗了袁術，消滅了陶謙，打跑了呂布，統一了整個兗州，終於贏得了長安朝廷的重視，主動送來了任命。
《曹操集》中收錄有《領兗州牧表》，是曹操接受兗州牧後的謝表。在這份上表中，曹操回顧了爺爺曹騰、父親曹嵩以及自己深受皇恩的情況，表示自己將效忠帝室，繼續努力進取。在《太平御覽》一書中還保存了曹操以兗州牧的身份向獻帝進貢的記載，他進的貢大體上都是兗州當地的土特產，如山陽郡特產的美梨二箱，以及一種青黑色的棗二箱。
在很多人心目中，曹操是漢室的奸臣，但最少到現在，曹操的內心對漢室都是充滿敬意的。即使在以後的歲月里，曹操也很少說漢室的壞話，相較於同時期的那些空發議論的人，曹操對漢室的貢獻更大，相對於袁術、袁紹這樣對當今天子充滿敵視的人來說，曹操似乎更應該受到尊敬。
在張邈、陳宮叛亂中，兗州有很多官民跟隨他們背叛了曹操，曹操重新取得兗州後，很多人心存不安，不知道曹操會不會追究。針對這種心理，曹操通過重用畢諶讓他們打消了顧慮。
如前所述，畢諶因為母親等人被叛軍扣留離開了曹操，與曹操話別時還流了淚，畢諶表示決不會依附呂布，但他一離開曹操，就投靠了呂布。呂布失敗後，畢諶被抓，大家都認為老畢這一回算是完了。
沒想到曹操並沒有追究他，曹操說：「一個人能做到對親人盡孝，豈能不忠於君嗎，這正是我所要的（夫人孝於其親者，豈不忠於君乎，吾所求也）。」不僅如此，曹操還讓他做了魯國相。曹操對畢諶的安排很恰當，不追究反而褒獎，讓過去反對過曹操的人吃了定心丸：連畢諶都能得到曹將軍的原諒，我們還怕什麼呢？
但是畢諶畢竟有投敵行為，如果讓他繼續在自己身邊處理機要大事，曹操已經信不過他了。於是安排他到外地魯國任國相，這裡是孔子的故鄉，孔子主張孝，更主張忠，孔子有一個著名的思想就是「移孝入忠」，曹操讓畢諶到魯國去，就是讓他繼續思考忠與孝的關係。
跟畢諶情況差不多的還有魏種，曹操對魏種很賞識，擔任兗州刺史後曹操有資格推薦孝廉，他推薦了魏種。兗州反叛時，曹操說：「假如都參加叛亂，魏種也不會的。」後來聽說魏種竟然也參加了叛亂，曹操大怒：「魏種如果沒逃到南越、北胡，我就決不放過他！」
叛亂平息，魏種也被抓了，捆著帶到了曹操面前。但是，曹操的怒火卻不見了，說：「魏種這小子是個人才呀！」解開繩索，繼續用他。後來，魏種在曹操手下一直干到了河內郡太守。
曹操在處理畢諶和魏種事件上很理性，他知道必須儘快平息兗州人的不滿和恐懼，彌補以前處理兗州事務的不足。
對於下一步的行動，曹操汲取了第二次征徐州的教訓，考慮軍事行動應該暫停，抓緊時間鞏固地方。荀等人也認為，呂布投奔劉備以後，他們二人未必能真心合作，如果此時攻打徐州，他們反倒會團結起來，不如先觀察一段時間，讓他們自己內鬥。
這是一個正確的戰略選擇。現在，曹操終於可以把精力放在對兗州的治理上了，他多次向程昱、毛等兗州本土人士徵求意見，毛勸曹操重視農業，發展經濟，曹操接受了他的建議。這是一項重要的政策建議，對曹操日後的事業發展起到了很大的作用。毛替曹操分析道，隨著局勢的進一步動蕩，國家的經濟將陷入更大的困難，決定戰爭勝負的關鍵因素就是物資供應和裝備，對此必須早做準備。唯今之計應該鼓勵農業生產，積蓄力量，成就霸業。
毛的思想在當時的形勢下是十分有遠見的。經過長時間的天災人禍，各地的經濟幾陷於崩潰，糧食和其它軍需物資很難保障，要成就大業，必須解決這個問題。
曹操立即下令在「曹統區」範圍內著手恢複農業生產，到第二年夏收時，「曹統區」農業得到一定恢複，曹操手裡積累了足夠的糧食。這些糧食成了曹操的秘密武器，讓他處處居於主動。