處理完蔡邕的事，王允面對著如何解決涼州軍的問題。當時有兩種意見，一種認為讓老將皇甫嵩重新出山，統帥涼州軍，以皇甫將軍的威名，應該可以鎮住他們；另一種意見認為應把涼州軍全部殺掉。前一種意見佔大多數，持後一種意見的，是呂布等并州派。
并州派想借用士人和社會力量趁機消滅涼州派，然後自己獨霸朝廷。王允沒有採納呂布的主意，但自己又是個沒有主見的人，他一會兒想赦免涼州將領的罪過，一會兒又想下令解散涼州軍，弄得外面謠言四起，都說王允要大開殺戒，最少要殺十萬人。
後來王允決定還是解散涼州軍，馬上有人表示異議，說如此一來涼州軍人都會人人自危，天下必亂。
然而王允認為，關東聯軍是自己的盟友，現在董卓死了，還把大軍駐紮在函谷關、陝縣一帶，必然讓盟友疑心。他堅持將涼州軍就地解散。
涼州軍人都在想，蔡邕那樣的人王允尚且不放過，現在我們要是被解散了，馬上就會成為任人宰割的魚肉。所以，當李肅帶人拿著詔書到陝縣宣布解散涼州軍的時候，牛輔等人起兵反抗，李肅大敗而回。呂布斬殺了李肅，親自迎戰牛輔。
還沒等呂布動手，牛輔自己先出了事。晚上大營里發生夜驚，全營一片混亂，牛輔心驚膽顫，準備隻身逃走，結果被手下人幹掉了。
李、郭汜、張濟等涼州大將聽說牛輔被攻，急忙馳援陝縣，到達後牛輔已死。李等人沒了主意，派人到長安向王允請降，王允既沒有立即同意，也沒有說不能赦免。他的回答很有意思：「一年之內，不能有兩次赦令。」
本年的正月里曾經大赦過一次，一年不能有兩次大赦，這倒也是制度規定。王允這時候變成了遵章守紀的模範，只不過在此時這非常不合時宜。
李等人六神無主了，他們原來都是跟著董卓混世界的，所有的大主意都由董卓拿，他們只管打打殺殺，他們既來不了文的，也搞不了政治，只想榮華富貴，能過上花天酒地的生活。現在領路人董卓、牛輔都死了，他們還真不知道怎麼辦好。
既然人家不願意現在赦免他們，等明年可以頒布赦免令時再打報告上去的話，這中間還有大半年時間，顯然不大可能。李等人簡單商議一下，決定讓隊伍自行解散，大家化整為零繞道逃回家鄉涼州。
這時候，原牛輔所部的一個師長（討虜校尉）出來對大家說，這樣做萬萬不可。他警告道：「如果分散突圍，必然會個個擊破，不如向西進攻長安，給董太師報仇，事情成功可以擁戴皇上，號令天下；事情不成，再跑也不遲。」
他一下子把大家說醒了：是呀，跑什麼呀，咱們實力也不差，幹嘛求人呢？於是集齊人馬，大家向西挺進。
出這個主意的人叫賈詡，字文和，涼州刺史部武威郡人，此時四十五歲，比曹操大八歲。
賈詡早年也被舉孝廉為郎，後因有病辭官回武威郡老家，路上遇見氐人，與其同行的幾十個人全部被抓。搶完東西之後，氐人要把他們活埋。賈詡騙他們說：「我是段太尉的外孫，你們別埋我，我家必然拿錢來贖。」段太尉即「涼州三明」之一的段，大名威震西土，賈詡拿這話嚇唬氐人，氐人果然不敢害他，還與他磕頭拜把子，送他回去。
董卓當了太尉以後，賈詡以涼州出身的緣故被聘為太尉府里的處長（太尉掾），後來升為黃河上的平津渡口守衛司令（平津都尉），再升為師長（討虜校尉），駐紮在陝縣一帶，歸牛輔指揮。
後世多認為，賈詡的這個主意闖下了大禍，使得有可能出現的和平契機化為烏有，令帝國再次陷入混亂狀態。
裴松之注《三國志·賈詡傳》的時候忍不住評論說：這個時候，元兇已除，天地始開，但隨之國家又四分五裂，黎民百姓再次遭受塗炭，這一切難道不都是因為賈詡的一句話嗎（豈不由賈詡片言乎）？賈詡的罪過，竟然如此之大！
將天下重新陷入動蕩的罪過全部歸於賈詡一人，未免誇大了他那一句話的作用。沒有賈詡，天下該亂還會亂，只不過，此時此刻，他的一個主意至少改變了局部事態的發展。李等人率兵殺來，路上涼州軍越聚越多，除李、郭汜、張濟、賈詡外，樊稠、李蒙等涼州將領也來加入，人數達十多萬。此時長安的守軍也就一兩萬人而已，形勢危急。
偏偏這個時候，守軍里有人反水，這是一支特殊的部隊，名叫「叟兵」。
叟人是西南的一個少數民族，叟兵以打仗勇猛而著稱，這支叟兵人數不詳，可能是益州牧劉焉派來的。這夥人打仗有一套，戰場上隨機應變更有一套，作為川軍里的僱傭軍團，他們犯不著跟別人一塊送死。
王允、呂布等人守了八天，叟兵打開城門，涼州軍殺入長安。呂布不敵，帶領幾百名騎兵殺出城去，這一行人里，應該有張遼、高順等人。呂布臨走時不忘把董卓的人頭掛在馬鞍上，這個東西他見著袁術、袁紹時還用得上。
呂布路過青瑣門的時候，招呼王允一塊走，王允不想走，就請呂布帶話給關東諸位首領，要他們設法來救皇上。
太常卿種拂、太僕卿魯馗、大鴻臚卿周奐、城門校尉崔烈、越騎校尉王頎等大臣在混亂中被殺，和他們一同被殺的有一萬多人。司徒王允、司隸校尉黃琬、左馮翊郡太守宋翼、右扶風郡太守王宏等被抓，幾天之後一塊兒被涼州軍處死。
李脅迫獻帝任命自己為揚武將軍，郭汜為揚烈將軍，樊稠為中郎將。三個月後李又任車騎將軍兼司隸校尉，郭汜、樊稠分別為右將軍和後將軍，他們三個人組成領導小組共同主持朝政（朝政）。張濟為驃騎將軍，出屯潼關以東的弘農郡一帶。
與涼州集團關係密切的韓遂、馬騰等人聽說長安大亂，也帶兵前來湊熱鬧，看能不能混水摸魚。「三人小組」任命韓遂為鎮西將軍，屯駐金城（今甘肅蘭州）；任命馬騰為征西將軍，屯駐董卓昔日苦心經營的大本營塢。
這些多年來與朝廷水火不容的叛軍，被正式任命為朝廷的高級將領。此時同在長安的皇甫嵩，以及將要來到長安的朱俊等老將看了之後想必無言以對。
涼州軍人又把持了朝政，和平的曙光雖曾一閃，但再次與帝國無緣。接下來，將是無休無止的混戰。