蔡元培一生所作聯語甚多，大多平易渾成，不用僻典，切人貼事。楊昌濟先生生前在北大教倫理學，與蔡私交甚篤，1920年楊逝世，蔡挽以聯云：「言有物，行有倫，論人格可稱君子；學不厭，誨不倦，惜本校失此良師。」
蔡元培於辛亥革命後，曾一度出任南京臨時政府教育總長，與湖南湘陰范源濂（1876～1927）共事。范逝世，蔡挽以聯云：「教育專家，猶憶十六年前推誠共事；科學先進，豈惟數百社友痛惜斯人。」按：范氏曾任1915年成立於美國的中國科學社董事，做了大量普及科學的工作。該社所辦《科學》、《科學畫報》、《科學季刊》，在學界影響甚大，故下聯及之。
蔡元培挽魯迅聯云：「著述最謹嚴，非徒中國小說史；遺言太沉痛，莫作空頭文學家。」蔡掌北大時，曾聘魯迅講中國小說史與文藝理論。又魯迅曾說：「孩子長大，倘無才能，可尋點小事情過活，萬不可去做空頭文學家或美術家。」全聯寥寥數語，從學術著眼，提綱挈領，以簡馭繁，針對性極強，可見作者膽識。
蔡元培又挽新詩人徐志摩云：「談論是詩，舉動是詩，畢生行徑都是詩，詩的意味滲透了，隨遇自有樂土；乘船可死，驅車可死，斗室坐卧也可死，死於飛機偶然耳，不必視為畏途。」
蔡元培又挽孫中山先生聯云：「是中國自由神，三民五權，推翻歷史數千年專制之局；願吾儕後死者，齊心協力，完成先生一二件未竟之功。」
蔡元培為古越藏書樓親書對聯一副：「吾越多才由續學，斯樓不朽盡在藏。」懸於書樓之門廳。
蔡元培以為陶冷月畫融會貫通中西，據《孟子》：「子謂韶盡美又盡善也，謂武盡美以未盡善也」，撰寫一聯贈陶：「盡美盡善武韶異，此心此理東西同。」