白話文興起後，至四十年代，時人已不再學四書五經。大儒馬一浮倍感惆悵，嘆息說：「日日學大眾語亦是苦事，故在祖國而有居夷之感。」
馬一浮對新式的學校教育頗有成見，認為「當今學校，不如過去的書院。教師為生計而教，學生為出路而學。學校等於商號，計時授課，鈴響輒止」。
馬一浮堅決主張尊孔讀經，反對現代學校廢除六經。早在1912年，他就反對蔡元培廢除六經的主張，并力主學校恢複讀經科。辛亥革命成功後，蔡元培被孫中山委任為教育總長，而蔡元培與馬一浮既是好友，又仰慕馬一浮的學術和名望，就委任馬一浮為教育部秘書長，襄助部務。馬一浮出於友誼接受了委任。當他到了南京後得知蔡要廢除六經，並已公布了《小學校令》廢止讀經科；公布了《中學校令》廢除「讀經講經」；公布了《大學令》和《專門學校令》取消「經學科」，便非常不滿，要求蔡收回部令。「道不同不可為謀」，因兩人意見相左，於是馬一浮到職不到三個星期，就辭謝了這份差事。他對蔡元培說，「我不會做官，只會讀書，不如讓我回西湖。」
事後，馬一浮在追憶此事時寫道：「南京臨時政府收羅人望，以蔡孑民長教育。蔡君邀余作秘書長，余至而廢止讀經、男女同學之部令已下，不能收回，與語亦不剩又勸設通儒院，以培國本，……蔡君河漢吾言，但云時間尚早，遂成擱置，而余亦去」。