一八八四年（清光緒十年，甲申）一歲
九月二十八日（陰曆八月初十日），出生於日本橫濱。原名戩，字子谷，後改名玄瑛，又名湜，出家後法號曼殊。
父親蘇傑生，在日本經商，當時任橫濱萬隆茶行買辦。其原籍為廣東省香山縣（今中山縣）恭常都瀝溪鄉白瀝港村。
生母河合若（若子），日本江戶人，與蘇傑生非正式同居，生下曼殊後，不到三個月便離去。曼殊歸河合仙撫養。
義母河合仙，日本江戶人，為蘇傑生之大妾。一八七七年養一子蘇焯，一八七七年攜蘇焯來中國，在瀝溪住約三年，因不堪蘇氏家族的歧視，於一八七九年返回橫濱，留下蘇焯在瀝溪。
嫡母黃氏，這時居住原籍。
庶母陳氏，蘇傑生之次妾，這時隨居橫濱。
一八八五年（光緒十一年，乙酉）二歲
隨義母河合仙，母愛甚篤。
一八八六年（光緒十二年，丙戌）三歲
嫡母黃氏由瀝溪來橫濱，與蘇傑生同居，曼殊始見嫡母。
是年，庶母陳氏生妹祝齡。
一八八七年（光緒十三年，丁亥）四歲
曼殊喜好圖畫，如《潮音跋》所記：「四歲，伏地繪獅子頻伸狀，栩栩欲活。」
一八八八年（光緒十四年，戊子）五歲
受母教，開始識字。
庶母陳氏生二妹祝年。
一八八九年（光緒十五年，己丑）六歲
隨嫡母黃氏歸瀝溪鄉白瀝港村，始見祖父母。
一八九〇年（光緒十六年，庚寅）七歲
入瀝溪鄉鄉塾，開始讀書。
庶母陳氏生三妹惠芳。
一八九一年（光緒十七年，辛卯）八歲
仍在鄉塾就讀。
庶母小陳氏（蘇傑生之第三妾），從廣東來橫濱歸蘇傑生。
一八九二年（光緒十八年，壬辰）九歲
橫濱萬隆茶行營業失敗，十二月間，蘇傑生偕妾大小陳氏回瀝溪白瀝港村。河合仙獨留日本，直至一九二三年死於地震，再也沒有來中國。
一八九五年（光緒二十一年，乙未）十二歲
曼殊仍就讀鄉塾；性近美術，好作畫。
蘇傑生偕大陳氏及所生諸女赴上海；同時遣長子蘇焯往橫濱，隨表叔林北泉（祖母之侄）習商。
庶母大陳氏生四妹齊生，不久夭亡。
一八九六年（光緒二十二年，丙申）十三歲
隨姑母蘇彩屏到上海，與父及庶母同居；然頗受庶母虐待。這時開始學英文。
一八九七年（光緒二十三年，丁酉）十四歲
在上海繼續學習英文和中文。得識西班牙人庄湘博士，在其教導下，學習大有進步。
四月，祖父蘇瑞文病重，父親遄歸侍疾。十一月十四日（陰曆十月二十日），祖父病故，庶母大陳氏攜女回瀝溪。曼殊仍就留上海就讀。
十一月，庶母小陳氏病卒。
一八九八年（光緒二十四年，戊戌）十五歲
春初，隨表兄林紫垣（祖母侄孫）赴日本。在橫濱，入華僑主辦的大同學校學習，為通學生，食宿於林紫垣家。同學有馮懋龍（號自由）、鄭貫一、張文渭，及從兄蘇維翰（號墨齋，叔父蘇德生之次子）。
與兄蘇焯在橫濱相遇。
一八九九年（光緒二十五年，己亥）十六歲
在大同學校繼續學習，學業進步甚速。
一九〇〇年（光緒二十六年，庚子）十七歲
春，升入大同學校甲級，兼習英文。大同學校分甲乙二級，甲級所授為中英二科，乙級所授為中文一科，曼殊原讀乙級。
一九〇一年（光緒二十七年，辛丑）十八歲
仍讀大同學校。課餘，間作畫，下筆瀟洒挺秀，已顯露出繪畫才能。
蘇焯歸國，返瀝溪。
一九〇二年（光緒二十八年，壬寅）十九歲
在大同學校畢業，與蘇維翰、張文渭籌議升學，往東京同考高等師範學校，僅蘇維翰考取；繼而曼殊與張文渭又投考早稻田大學高等預科，方同被錄取。其時，表兄林紫垣每月補助十元，僅敷下宿屋膳宿費用，生活十分艱苦，曼殊卻能刻苦自勵。
是年冬，中國留學生葉瀾、秦毓鎏、張繼等（多屬早稻田大學學生），發起組織「青年會」，宣言以實行民族主義為宗旨。馮自由介紹曼殊加入「青年會」。
蘇焯從瀝溪來日本，在神戶經商。
庶母大陳氏生幼妹惠珊。
一九〇三年（光緒二十九年，癸卯）二十歲
經僑商保送，轉入成城學校（此為日本陸軍的預備學校），學習陸軍，易名蘇湜，與同學劉三（號季平）相識。
三四月間，俄軍侵略我東三省，中國留日學生聞訊極為憤慨，葉瀾、秦毓鎏等發起組織留學生「拒俄義勇隊」；被日本政府解散後，又組織「軍國民教育會」。曼殊均參加組織活動。林紫垣卻極力反對，幾次勸告不聽，竟中斷接濟，迫使曼殊不得不輟學。
九月，曼殊乘博愛九回國。蘇維翰、張文渭冒雨至船埠送別。在輪船上，曼殊草遺書致林紫垣，假稱已投海自殺，用以脫離林紫垣的干預。
九月上旬，抵達上海，會晤陳獨秀。旋即赴蘇州，任吳中公學教習；同事中交好者有包天笑、祝心淵。後又往上海，任《國民日日報》翻譯，與陳獨秀（仲甫）、何靡旋（梅士）、章行嚴（士釗）共事。
其間，翻譯囂俄（現譯雨果）的小說《慘世界》（現譯名《悲慘世界》），撰寫《女傑郭耳縵》、《鳴呼廣東人》二文，及《以詩並畫留別湯國頓》二首，在《國民日日報》上發表。
十一月，《國民日日報》被查封，《慘世界》刊登至第十一回之半，亦中輟。曼殊與陳獨秀、何靡施、章行嚴另租屋同住。一日，曼殊忽思南行，趁陳章外出，邀何靡施觀劇，至劇場前，卻稱忘記帶錢，獨返寓所，於章行嚴行篋中取三十元，留下字條而遁。
曼殊離開上海，經過湖南，「入衡山，登祝融峰，俯視汀流明天」（據曼殊《畫跋》所記）；然後往香港。
抵香港後，持馮自由在日本所寫的介紹信，往訪陳少白。這時陳少白任《中國日報》社長，遂下榻於該社。住未久，曼殊因感身世有難言之恫，衷懷抑鬱，決意出家為僧。陳少白知其性僻，無可挽留，贈送數十金為行資。曼殊遂往惠州投一破寺受戒，取法名為「曼殊」。
一九〇四年（光緒三十年，甲辰）二十一歲
二月，因破寺只住持一老僧，並臼躬操，且無隔宿之糧，唯恃化緣為活，曼殊不堪如此困苦生活，乃離惠州，再返香港。據陸丹林《記蘇曼殊出家及欲槍殺康有為事》一文所記：「一日，（曼殊）乘其師他地，遂竊其已故師兄之度牒，及其師僅存之二角以逃。步行至省城，乘輪抵香港，銀洋二角僅足以充船費，路上不食已二日矣。」師兄法名博經，其俗家原為南雄州始興縣趙姓子。此後，曼殊有時也以「博經」為自己的法名。
在香港期間，偶然被鄉人簡世錩碰見，並探長其住址。簡返瀝溪，即將情況告知其父蘇傑生。這時蘇傑生已病重，托簡再至香港促曼殊歸鄉。曼殊託辭不歸。三月十五日（陰曆正月二十九日），蘇傑生病故，曼殊也未奔喪。實因蘇傑生絕緣河合仙，曼殊深為抱恨。
三月下旬，至上海，訪「青年會」舊友葉瀾於「國學會」。此時曼殊決心南遊，得庄湘博士助旅費，春未啟程，遊歷邏羅、錫籣。至邏羅時，從喬悉磨長老習梵文，研究佛典；並至佛誕生處，瞻阿輸迦王表彰佛誕生處碑。
七月，返國，到長沙，訪留日舊友秦毓鎏。這時，秦任湖南實業學堂教務監督，併兼明德、經正兩學堂歷史教習。因此，曼殊亦受聘為實業學堂教習。
九月，「華興會」謀在長沙起義失敗。曼殊雖未參與，但與會中主要人物黃克強、楊性恂、楊篤生、秦毓鎏、張溥泉等交往密切，因黃克強等都是實業學堂的同事。
一九〇五年（光緒三十一年，乙巳）二十二歲
上半年仍在長沙實業學堂任教。暑假中至上海，重晤秦毓鎏（去年，因「華興會」起義失敗逃來上海）。秋後，至杭州游西湖，作畫寄陳獨秀。
下半年，在南京，任教於陸軍小學，授英文，與劉三共事。此時，並與趙聲（伯先）相識。據曼殊《燕子龕隨筆》記述：「余教習江南陸軍小學時，伯先為新軍第三標標統，始與相識，余嘆為將才也。每次過從，必命兵士攜壺購板鴨黃酒。伯先豪於飲，余亦雄於食，既醉，則按劍高歌於風吹細柳之下，咸相與馳騁於龍盤虎踞之間，至樂也。」亦常與劉三出遊作畫，在曼殊《畫跋》中有記載：「乙巳羈秣陵，偕季平登雞鳴寺，觀台城後湖，百感交集，畫示季平。」又記：「乙巳與季平行腳秣陵，金鳳出素絹索畫，未成而金鳳他適。及後，渡湘水，作此寄