十二月初七，天陰沉沉的，象是要直壓到地上來似的。翁同龢從中南海儀鸞殿見了慈禧回來，剛在家中喝了一口茶，有人來報刑部浙江司郎中翁同龢的侄子翁曾桂前來拜見。翁同龢急忙叫人把他請進來道：「案情進展如何？什麼時候開棺驗屍？」
翁曾桂道：「不好了，叔父大人，開棺的事有點兒不妙。有人到刑部發話，反對開棺驗屍。」
「是誰？」
「四川總督丁寶楨。他這幾日正在京中辦事。昨天他跑到刑部大發雷霆，面斥刑部尚書桑春榮老耄糊塗。又到處揚言，說這個鐵案如果要翻，將來沒有人敢做地方官了，也沒有人肯為皇上出力辦事了。」
丁寶楨並非是見錢眼開的人物，此人在做山東巡撫時曾殺過慈禧太后得寵的太監安德海。慈禧不但不報復他，反而誇他清廉剛直，後來吳棠出缺，慈禧便將丁寶楨擢為四川總督。用他去整飭被吳棠搞壞了的四川吏治。提起丁寶楨，朝中一般的京官都有些怕他。這一回丁寶楨插手此事，的確有些麻煩。翁同龢的心不禁一陣緊縮，他低頭不語，想了一會兒才道：「你不用害怕，朝廷既然諭令刑部全權辦理此案，咱們就放心去做。此案若天下大白，丁寶楨也沒有什麼可說的了。你們定在什麼時候開棺驗屍？」
「十二月十二。」
「夜長夢多，時間長了恐生變故，要提前驗屍。明天是來不及了，就定在十二月初九吧。」
初七這晚，紛紛揚揚的大雪鋪天蓋地的下起來，一下就沒個完了。到初八晚上，仍是停不下來，眼見得碎玉亂珠、扯棉丟絮般的大雪沒有要歇的意思，夜幕下泛著幽幽的白光，翁同龢著實有些心慌。這雪若是還不停，初九開棺又要推遲，拖的時間久了，恐生事端啊。
到了第二日晨，竟然紅日初升，將朝陽門外蓋了一層雪被的田野阡陌都映的紅了。朝陽門外宛平縣的海慧寺，天寒地凍也擋不住紛至沓來的看客。早在卯時初的時候（凌晨五點）步軍統領衙門派出的兵丁，就把寺廟內外圍得緊緊的。接著刑部各位堂官、司官也乘著綠呢大轎、藍呢大轎陸續來了。翁同龢也早早來到海慧寺壓陣，坐在大殿偏廂里，靜候時辰。
巳時四刻（上午十點鐘），開棺的時辰已到。眾人來到公堂之上。
公堂設在大雄寶殿關的平台上，香煙繚繞，鋪著黃緞罩縵的長桌，翁同龢與刑部諸官並坐。司官八人，仵作二人，差役十餘人，分列於大殿左右。楊乃武案中的一干證人及原被告也被帶到現場見證。
葛品連的棺木抬到了殿前的空地。數百雙眼睛都盯在這個被五十六道封條包裹著的棺材上。開棺之前，先由刑部八個第一流的仵作對封條驗定，揭封之後，又叫劉錫彤認明原棺無誤。負責督驗的翁曾桂才喊了一聲：「開棺。」
四個差役手揮斧釺，砰的一聲撬開了棺蓋。那棺木已經入土數年，四角已腐朽，隨著棺蓋滑落，也朴簌簌的掉下黑黃的木屑。一股屍臭頓時從棺中瀰漫出來，幸虧事先已在庭前大香爐內焚起黃熟、檀降兩種香料，才將屍臭壓住。
首席仵作秦德山已經八十一歲，是翁曾桂特地派人花重金聘來的，他的徒弟將屍首輕輕抬出。只見屍體皮肉大多腐化，僅留一點腐肉留在骨上。秦德山走過去，用布滿青筋的手捏了一根銀針，飛快的插入死者喉間，輕輕捻動了一下，又緩緩抽出，用皂角水洗凈。如此反覆多次，銀針上並不顯示黑色。他又取銅盤一個，用榔頭敲下一塊黑色的囟門骨，映日細看了一會兒。如此驗了半日，報到：「驗得該屍鹵門骨並無紅暈浮出，喉骨、牙齒、牙齦、胸部龜子骨、手指骨、足趾骨及周身大小骨殖均呈黃白色；凡服毒者，囟門骨必定里外皆黑色。而此屍囪骨為黃色骨頭，外面受潮霉變發黑，內里卻瑩白。不僅如此，該屍所有骨殖無一處有毒黑之色，很顯然，此人一定沒有中過毒。」
翁曾桂問道：「那麼，餘杭縣仵作沈祥用銀針發黑又是什麼緣故呢？」
「大人，判斷一個人是否中毒，可以用銀針來探死者的喉部。如果銀針沒有變色，可作無毒的結論。但銀針變色，卻不能輕易下結論。因屍體發生腐爛之後，就會產生屍氣（就是硫化氫），這個東西也能使銀針變黑。所以必須要用皂水來擦洗，如果皂水能去屍氣，如果擦洗不掉才能證明是中毒。即使經皂水銀針驗出中毒，還應當結合其他的癥狀來判斷驗實。」
「這麼說，葛品連不是中毒死的？」
「我作仵作六十多年了，敢打這個保票。」
秦德山在屍格上畫了押，翁曾桂又叫八名京中仵作復驗，個個驗過都說無毒。再叫餘杭原驗仵作沈祥復驗，問他有毒無毒，沈祥口稱願領審驗不明之罪。再看劉錫彤，此時已經是氣焰始落，面色慘白，全身發抖。
圍觀的看客頓時歡呼雷動，有的喊「青天有眼」，有的喊「斷案如神」，一個法國記者也跑到關著楊乃武的囚車木籠旁，操著半生不熟的漢語笑著道：「無毒，無毒。」
後來，這個記者在一篇發往歐洲本土的通訊中，以「中國奇案，寺內開棺」作標題，刊載了消息。其中有一句是「大殿邊的小屋子，木籠里關著兩個穿紅色囚衣的犯人，一個是楊乃武，一個是畢秀姑。」
此時，從跪著的證人中衝出兩個人，直衝到劉錫彤的面前，要與他拚命。早有眼疾手快的差役一把將兩人扯住，雖然不能近前，兩個人對著劉錫彤仍是痛罵不止，悲憤之極。翁曾桂見是楊乃武的妻子楊詹氏和姊姊楊菊貞，嘆了口氣，只叫人把兩個人帶了下去，吩咐不準難為她們。
海會寺驗屍後，案情已經大白，刑部立即將複審勘驗情況，奏知兩宮，這時才將劉錫彤革職拿問。
刑部對劉錫彤無故入人以罪、原審各官審辦不實等事又進行了幾次大規模的審訊，這一回所審問的人犯已經不是普通百姓而是大清官員了。