無論是高級班還是中級班的軍官們的學習時間都是一個月，結業之後，他們帶著使命回到了軍隊中，立即主持了轟轟烈烈的軍隊改造。
軍隊在那個月里一直訓練，沒有改變，不過餉銀是發足的。
等到老長官回來，他們在兵部、總參人員的協助下，對官兵們進行甄別挑選，擇其能戰者、強壯者留下，為「新明軍」的一部分，列為正兵，乃是正規軍、野戰軍。
淘汰下來的官兵進行分流，一部分成為各地駐防的機動鄉兵，叫做「團結兵」這樣有喜感的名稱。
為什麼要用「團結兵」？
沒別的，因為老大顏常武喜歡這個名字……
其餘的確實不合適當兵的，則解甲歸田，朝廷出資遣散。
比起以前要好，以前的朝廷要不沒有錢，要不有錢也被各級官員剋扣，但現在不同，朝廷兵部對於軍餉非常重視，確保每一個官兵都能夠拿足他們的收入。
所有正兵平均加百分之五十工資！
團結兵加百分之十至二十工資！
離開軍隊的官兵得到充足的遣散金。
餉銀髮足，沒有誰與錢過不去，如此軍隊分流改造這麼一件大事就輕易的被完成了，沒有激起多大的反彈。
顏常武擒賊先擒王的措施起到了很大的作用，各部總兵、參將都認同他的管治，各部老大尚且如此，其他的人無話可說。
部隊的變化很大！
東南府的作戰軍官、政治軍官進入各支部隊中，按東南府的訓練大綱，因地制宜進行訓練，
經過整編，在南直隸、江西、湖廣、浙江、福建、廣東、廣西均設立了新軍，其中南直隸駐紮了高傑、劉澤清共六萬人，江西有劉良佐三萬人，湖廣有黃得功的三萬人，至於浙江、福建、廣東、廣西則均有三萬人，加上南京亦有二萬人，總共新軍達二十萬人，團結兵有六萬人，加上各支獨立軍，合計兵力達到了三十萬人。
這些軍隊，全部被東南府所控制，軍制如東南府，訓練亦如東南府，吃得也是東南府的伙食。
餉銀充足，訓練充分，掛的是殿下的大幅戎像，軍中只知殿下，不知道明帝。
有了他們的支持，加上顏常武自帶的東南軍十數萬，顏常武遂能夠大展拳腳。
他下達國公旨令，分別委派了越其傑（馬士英妹夫）為江西布政使、袁樞（袁可立之子）為湖廣布政使，為三地最高地方指揮連發，陳潛夫（一代名士）為浙江布政使，此三人，都是他所開設的東南府政治學院南京分校的佼佼者，已對他效忠！
顏常武在軍人官吏里灌輸他的治政理念：忠君（就是聽他的話）、發展經濟、民生三大方面，主要是講社會河蟹。
一些官員覺得很難適應，紛紛退群，但亦有一些官員應時而起，越其傑、袁樞、陳潛夫認同他的理念，自然得到了重用。
不過，他這一套在南明官員中爭執很大，官員們普遍認為這是對自古以來朝廷牧民的一個巨大的傾覆！
「君君臣臣父父子子，三綱五常不容傾覆！」內閣中，禮部尚書王鐸反對道。
「我們並沒有傾覆這一套制度，主要是對民眾要好一點，讓他們能夠活下去，為我們提供兵員和納稅糧！」首輔孫承宗說得明白道。
姚明恭亦道：「孟子曰『君為輕，民為重』，我們雖不致於如此地步，但要讓百姓得到好處，是為正理！」
閣員馬士英諂事顏常武，說得粗俗地道：「我們吃肉，百姓喝湯，大家利益均沾！」
對於發展經濟，南明官僚普遍有抵觸，認為官就管民，哪管得了他們家裡吃肉吃飯！
要不是東林黨的例子在前，只怕他們早就要跪闕犯顏直諫了！
他們的不合作在所難免，這不要緊，顏常武進宮去見永明帝朱由產。
南京明宮！
南京紫禁城，乃朱重八在南京建造的皇宮，建造前後歷時二十餘年，佔地面積達百萬平方米，面積之大，勝過北京明宮！
南京故宮始建於元至正廿六年（1366年），明洪武廿五年（1392年）基本完工，其址選於元集慶城外東北處，遷三山填燕雀湖而建。明故宮為明初三朝皇宮，長達54年之久。直到明永樂十九年（1421年），明成祖朱棣遷都北京，南京設立南直隸，仍由皇族和重臣駐守，地位十分重要。
南京故宮坐北向南，有門四座，南為午門，東為東華門，西為西華門，北為玄武門。入午門為奉天門，內為正殿奉天殿，殿前左右為文樓，武樓。後為華蓋殿，謹身殿。內廷有乾清宮和坤寧宮，以及東西六宮。
朱棣北遷後，此後數百年間，南京故宮鮮有修葺，風吹雨打，自然損壞嚴重。
明朝正統十四年（1449年），夏六月天降雷雨，謹身、華蓋等殿被雷電擊中起火。
明朝成化二十一年（1485年），五月，「南京大風拔太廟樹，摧大祀殿及皇城各門獸吻」。
明朝嘉靖元年（1522年），「秋七月，暴風雨，江溢，郊社陵寢宮闕城垣皆壞」。
……
顏常武帶著衛隊進宮，這是他的特權，所以一些老封建痛恨他身為權臣的飛揚跋扈。
他不想這麼高調，但更不想像何進、韓信這些人被宮裡人炮製，死於非命，所以保命要緊，別人怎麼看是能咬我咩？
一路可見維修工人和物資車輛進進出出，正在忙碌於修葺。
乾清宮則已經修好，但腳手架還沒拆光光，顏常武求見，很快被允許進內。
他的衛隊擺在乾清宮之外，列出戰陣，紋絲不動！
此地乃是大明宮廷的腹心之處，皇帝真要對權臣不利，也不敢在此動手，甚至還要保權臣平安，否則君臣相爭之事傳出去就是駭人聽聞。
「見過陛下！」顏常武很恭敬地下跪行禮。
不沖別的，永明帝是他的岳父，也都值得。
「罷了！」永明帝朱由產揮揮手道，顏常武就站了起來。
朱由產氣色很好，他雖然是個傀儡皇帝，但他心態擺得正，知道這個位置本不應輪到他來坐的，如今能夠坐上去全賴他面前的這位「賢婿」。
且他沒有那種雄視天下之心和管治天下之才，所以他幾乎不理事，有事情報來盡說：「甚好，找東南公解決！」
因他這樣態度，顏常武對他執禮甚恭，孝敬豐厚，敢不敬皇帝者必嚴懲，因此朱由產日子過得舒心。
「東南公來見朕，可有事？」朱由產問道。
「啟奏陛下，凡新朝建立，必開恩科，以攬天下英才，為我朝所用！」顏常武奏上道。
「准奏！」朱由產同意道。