關原會戰結束後，雖然德川家康仍然保持著豐臣政權大老的名義，但豐臣政權的統治體系卻已經崩潰了，五大老之中有三人（毛利輝元、上杉景勝、宇喜多秀家）成為戰敗者，五奉行之中也有三人（石田三成、增田長盛、長束正家）受到處罰，秀吉臨終時建立的整個決策、執行體系已失去了繼續存在的可能。不過家康此時卻也不敢過於激化與豐臣秀賴這位自己名義上的主君的矛盾，因而在關原戰後只能和豐臣秀賴聯名發布命令執掌天下。
在大名轉封結束後，家康便開始著手毀滅豐臣政權的經濟基礎。秀吉在世時，曾將全日本絕大部分金礦都控制在自己手中，並使大批金銀流入市場，使得京都、堺一帶的商業愈發繁榮起來，而他自己便以此基礎賺取大量稅收。關原會戰結束後，家康迅速取得了堺町的控制權，將其納入德川氏的直轄領。1601年5月，家康又在伏見設置掌管金銀鑄造的銀座以確保自己對於全國金礦、銀礦的控制。
在確保了自身的經濟優勢，並切斷豐臣氏的經濟來源之後，家康終於開始在政治方面施展權術。早在1600年關原會戰結束後不久，前田利家的遺孀、前田利長的母親春芳院阿松便被送往江戶居住，成為了家康控制前田家這一百萬石大名的人質。一年之後，伊達政宗又正式建議，諸大名均應將妻小送到江戶居住，就如同在豐臣政權下大名將妻小送到大坂一樣。1602年，細川忠興和加藤清正首先將人質送到了江戶，諸大名也隨即響應，紛紛在江戶建造宅邸，安頓自己的妻小，而這也成為了後來江戶幕府參覲交代制度的開端。
不過到此時為止，出身豐臣氏家臣的大名對此雖然不敢反抗，但在義理上卻沒有義務將僅是豐臣家大老的德川家康視為主君。而其中福島正則、加藤清正二人則更是被視為豐臣秀賴的忠實維護者，一直反對著家康削弱豐臣氏的行動。不過這一情況在1603年2月12日家康被天皇冊封為征夷大將軍之後發生了逆轉。
在此之前，豐臣秀吉以太政大臣兼任關白之職統轄日本，雖然關白一職並非武家官位，卻位極人臣，擁有代替天皇攝政的權力，因此秀吉對天下的執掌也合乎法理。不過在他將關白之位讓給養子豐臣秀次之後，雖然這位太閣仍然保有著天下實權，但頒布政令卻也必須與秀次聯名。秀次被處死後，雖然秀吉仍然保有太政大臣的官位，但這一官位自古以來便沒有實權，因此其對天下的控制便只能單純依靠武力和諸大名對他個人的忠誠。對豐臣政權而言致命的是，太政大臣並不像征夷大將軍或關白一樣可以世襲，因此政權的繼承依據在秀次被處死那一刻便終結了，而終結豐臣政權的事實上正是秀吉本人。
1600年12月19日，家康邁出了在政治上十分關鍵的一步，將公卿九條兼孝推上了關白之位，給予豐臣家致命一擊。在此之後，關白之位便重新由毫無實權的朝廷貴族接掌，而豐臣氏則被排除出了日本的政治核心，淪為了一個實力強大的普通大名。家康成為征夷大將軍並開設江戶幕府之後，德川氏和豐臣氏之間的地位完全被逆轉了。在就任將軍之前僅僅4天，家康還曾以豐臣氏大老的身份前往大坂對秀賴進行新年朝賀，但在那之後便從未再次拜見。不過為了安撫豐臣系出身的大名，家康也按照秀吉的遺言，將自己的孫女、德川秀忠的女兒千姬嫁給了秀賴，而且宣稱自己只是為秀賴代掌天下，待後者成年後便會將將軍之位讓出。
在此之後，家康首先面臨的工作便是組建一個穩定的幕府體制，控制日本各地大名，阻止豐臣氏再興的可能。而在這三者之間，又以豐臣氏為德川天下最大的一個不穩定因素。德川家康在就任將軍時已經年逾70，如果自己不能在離世前徹底消滅豐臣家，在關原會戰後遭到處罰的大名們便有可能以光復豐臣政權為名掀起反旗。為在軍事上斷絕這一可能，家康在關原會戰後的大名轉封中便將自己家臣出身的大名安插在了中山道和東海道附近，牢牢將這兩條從大坂通往江戶的要道控制在了自己手中。此後家康又重建了在關原戰役期間被燒毀的伏見城，並將其建設得比之前更大，以此作為控制大坂的橋頭堡。另外，他還在京都天皇御所不遠處開始建造二條城，將其作為京都所司代的駐地，用以對天皇朝廷進行監視和控制。為消耗原豐臣系大名的實力，伏見城和二條城的建造主要便由這些大名承擔，家康還命令這些大名參與擴建江戶城、駿府城，幫助自己的譜代大名井伊家修建彥根城等工程。
在初步確立了江戶幕府的統治之後，家康在1605年把將軍職位讓給了兒子德川秀忠，自己則移居駿府城，其目的也和豐臣秀吉將關白讓給秀次一樣，在於向世人宣告征夷大將軍一職自此由德川家世襲，實權則並未交給秀忠。與此同時，家康也開始尋找借口，試圖對大坂挑起戰事，以便將其徹底毀滅。
在秀忠繼任將軍的典禮開始之前，家康便要求秀賴前往京都進行參拜，宣告豐臣氏從屬於德川氏。秀賴之母淀姬對此勃然大怒，拒絕了家康的要求，甚至開始聯絡前田利長、福島正則等人，希望這些老臣能夠興兵討伐家康。但令淀姬意外的是，前田利長斷然拒絕了自己的請求，而福島正則也在安撫了淀姬一番之後便沒有進一步行動。
與此同時，為平息豐臣系大名的不滿，並利用豐臣氏鉗制幕府，朝廷在4月16日加封德川秀忠為將軍之前四天將豐臣秀賴晉陞為從一位右大臣。家康對朝廷的這一行為十分不滿，自鎌倉時代開始，武家的賞罰應先由幕府定奪，而後再申報朝廷宣布。朝廷擅自加封秀賴一事不僅違背了這一原則，而且如果任由此事發展，豐臣氏早晚便會以秀吉受賜豐臣姓躍升為皇族後便不再屬於武家的理由脫離幕府節制，成為獨立於江戶體系以外的一方諸侯，甚至動搖江戶幕府的基礎。
家康這一次雖然沒有強制要求秀賴上京參見秀忠，但卻在1606年4月26日向朝廷重申武家的官位必須由幕府定奪。豐臣秀賴為避免與幕府發生衝突，也被迫在次年1月辭去了朝廷授予的右大臣官位。1609年7月，朝廷內部發生了私通事件，幕府借處理此事件的機會插手朝廷事務，並逼迫與豐臣氏交好的後陽成天皇退位，終於將朝廷完全握在了自己的手裡。
有了對朝廷的控制權，家康終於可以隨意定奪豐臣氏的地位了。1609年12月8日，武家傳奏廣橋兼勝前往大坂賞賜薰物給豐臣秀賴。由於武家傳奏一職專門負責朝廷與武家之間的事務，因此這一行動也成為了朝廷確認豐臣氏屬於武家，而非公卿的宣告。這也就意味著，豐臣氏必須服從於幕府管轄。在這之後，家康便可以一心尋找借口來剷除豐臣家了。
1611年，二條城建成後，家康再次要求秀賴上京參見自己，如果對方再像1605年那樣拒絕自己，將軍德川秀忠便可以以秀賴抗拒幕府命令為由對其進行討伐。不過此時已經明確了自身武家地位的豐臣秀賴也不敢拒絕家康，被迫選擇上京，而這一決定使家康暫時沒能獲得討伐豐臣家的借口。由於在此過程中，加藤清正、福島正則等豐臣系大名仍對秀賴的安危抱以擔心，福島甚至還在大坂屯兵保衛秀賴。再加上秀賴本人仍然保持著高傲的態度，這也使行將就木的家康再次堅定了要在生前剷除豐臣氏這一幕府毒瘤的決心。
不過在興兵討伐之前，家康還是決定要先對豐臣氏的現金儲備進行消耗，以免其在開戰時憑藉巨額黃金招募浪人與自己作戰。在關原之戰結束後，雖然家康已經將堺町、京都等商業繁華地帶以及全國礦山控制在了自己的手中，但大坂卻依然在全國的大米交易中佔據著主導地位。因此除65萬石封地所帶來的稅收以外，豐臣家依然坐擁大量經濟收入。《荷蘭東印度商會史》中便曾在1607年8月記載如下：「他（秀賴）現在年齡在十八歲左右，雖然還沒有統治天下的才能，不過卻有不菲的收入和（秀吉）留下的巨大財富。如果能有更多大名和百姓支持他的話，可以斷言，即使沒有過人的才華，他也能憑藉巨額的財富來獲取天下。」
下定決心剷除豐臣後，家康便開始哄騙淀姬，消耗豐臣家的財力。秀吉在世時，曾經在京都的方廣寺建造了一尊大佛像，但後來卻毀於地震。現在家康便以希望秀賴繼承太閣遺志為名，鼓動淀姬出資重修京都的一些寺院，並重鑄大坂方廣寺的大佛。身為女流之輩的淀姬非但沒有察覺家康的陰謀，反而對後者提及太閣遺志而報以好感，很快便將這一行動付諸實施，不過這一行動最終卻招致了豐臣的滅亡。
1614年，家康突然向豐臣家發難，聲稱其在方廣寺的鐘上銘文「君臣豐樂，國家安康」是在用將「家康」二字分開的方式來詛咒德川氏毀滅。在家康的一生中，其這次所尋找的借口可以算是最為牽強的一個，其原因便在於在秀賴上京參拜家康後德川家再難尋找更為合理的借口，而家康又壽命將盡，即使再為牽強，也只得抓住了。
大驚失色的淀姬和秀賴雖然百般解釋，但早已下定決心剿滅豐臣一族的家康對此根本沒有理會，並針鋒相對地