第四次出任別當
應仁三年（1469），大亂依舊持續。二月末，興福寺別當東門院孝祐表示要辭任，他的繼任者成了個問題。一般的慣例是權別當升任別當，但權別當西南院光淳卻說「再等一兩年」。於是又有了一乘院教玄再任別當的方案，卻遭到了教玄的拒絕。戰亂中興福寺各莊園田租收不上來的現狀之下，別當難以維持興福寺的經營。大乘院尋尊的再任方案也被提出來，但也被尋尊拒絕了。（《大乘院寺社雜事記》）平時令人垂涎的別當之職，在戰時卻是多勞少得的差使，興福寺的院主們互相推來推去。
第一章已述，幕府在這個時代也與興福寺的人事安排有關聯。興福寺別當之職懸而未決，沒完沒了，對於幕府而言不是件好事。這時以足利義視為首的西幕府已成立，於是幕府越發期望新別當儘快就任。於是最後的辦法竟然是拜託七十五歲的經覺再度出任。
經覺已經三次擔任興福寺別當。最初是應永三十三年（1426）二月到應永三十五年三月，第二次是大和永享之亂（參考第一章）激化之時，即永享三年（1431）八月到永享七年十二月，第三次是岳山城之戰（參考第二章）時，即寬正二年（1461）二月到寬正四年六月。經覺總是在困難時刻被請出來擔任別當，「麻煩的時候就請經覺出山」。
三月二十二日，依南都傳奏 日野勝光的意思，九條家（經覺出身的家族）家臣信濃小路兼益拜訪經覺住處。兼益傳達了日野勝光想讓經覺出任別當的意思。四度擔任興福寺別當，這是沒有先例的，因此是十分光榮的事情，日野勝光試圖以這樣的邏輯說服經覺。
筆者已多次講到，經覺一貫是偏向西軍的。這是因為他與西軍的越智家榮親近，與東軍的成身院光宣敵對。此外，為了保全越前的興福寺領屬莊園，他還與朝倉孝景交涉過，此後也維持著與朝倉的交流渠道。
應仁元年十月，後花園法皇發布處罰山名宗全的院宣，為與其對抗，西軍諸將聯名發布文書彈劾細川勝元。這一文書在送往興福寺別當（當時是孝祐）處時，朝倉孝景委託經覺代為轉交，可見二者之間聯繫之緊密。（《經覺私要鈔》）對日野勝光來說，偏向西軍的經覺出任別當絕不是他期望的，但此刻也別無他法了。
即使是經覺，這時也還是對出任別當一事猶豫了。天下大亂之中，興福寺領名存實亡。收入貧乏的現狀之下，法會看起來也是無法運行的。加之經覺年事已高，對能否承擔別當繁重的工作存有不安。經覺拒絕了。
然而日野勝光無視經覺的推辭，又通過朝廷下功夫。結果，朝廷於三月三十日任命經覺為興福寺別當（第一章已述，興福寺是官寺，形式上別當的任免權在朝廷手中）。四月四日，寺門雜掌（興福寺駐京都代表）柚留木重藝來到經覺所在的迎福寺，向他傳達了這一訊息。
經覺表示抗議：「我既已拒絕，仍擅自任命我為別當，真是豈有此理。」重藝並不讓步：「當今之困局，其他人斷然挺不過去。您年事已高，托您出山我亦於心不安，但為天下計，請您鼎力相助。這是朝廷和幕府的考慮。還有比這更光榮的事情嗎？」經覺說：「讓我想想。」重藝於是離開了。（《經覺私要鈔》）
但是，經覺 「讓我想想」這話只是形式上的應付，他心裡已經決定出任了。當天，經覺向尋尊派去使者，對他說：「之前對出任別當表示推辭，但現在已被強行任命了，沒有辦法，只得就任。無論何事，今後拜託了。」尋尊約定相助於他。（《大乘院寺社雜事記》）
四月十日，經覺招來柚留木重藝，命他上京，托他轉交其給日野勝光的回信。（《經覺私要鈔》）經覺具有領袖氣質，勇於任事，若是熱心地請他出山，他便會應允。這一點與沉著冷靜而萬事慎重的尋尊正好相反。
供目代 人事的調整
興福寺別當有權任命自己的下屬。四月十日，經覺就立即著手人事安排了。負責堂舍建築和橋樑修理的修理目代繼續讓成身院光宣留任。經覺雖不喜歡光宣，但現在東西兩軍勢力在伯仲之間，想要排除光宣等筒井一方勢力單獨運營興福寺是不可能的。
其他的人事安排也很順利，但意想不到的是，供目代的人事安排出現了困難。供目代是法會的執行人，在法華會、慈恩會、三藏會等論義法會之中負責確認學侶出席情況等事務。不僅如此，供目代肩負促成學侶集會等使命，政治意義重大，在眾多目代職位中也是最高級的。經覺想任命專心為供目代，也私下向他傳達了這一想法。專心是個在諸法會中積攢學識經驗的法會執行僧，具備擔任供目代的資格。
然而，學侶一方卻中止了他的計畫。四月十日，兩名使者代表學侶一方造訪經覺，祝賀經覺出任別當，而後對專心出任供目代示以難色。專心出自番條氏，故無法同意。
番條氏是侍奉大乘院的眾徒。大乘院的良家松林院兼雅以荒蒔庄（今奈良縣天理市荒蒔町）為抵押，向番條的長懷法師借了錢。但是松林院兼雅不還錢，於是變成了死當。借款轉移到學侶一方頭上，學侶們遂要求長懷歸還荒蒔庄，長懷錶示拒絕。（《經覺私要鈔》）因此學侶一方與長懷陷入對立，雖經筒井順永調停，但仍然不行。（《大乘院寺社雜事記》）應該是長懷受到六方眾的支持而有了底氣，變得強硬。這樣，學侶一方就對專心出任供目代表示反對。
學侶一方雖然有理，但從經覺角度來說，剛剛上任別當就被潑冷水，不是件有趣的事情。經覺已經決定在十三日舉行任命儀式了，如今再要延期，會損害他作為別當的權威。於是經覺提議說：「專心若長時間擔任供目代，別當可能會偏袒番條一方，但如果任命之後立即讓他辭任，就沒有問題了吧。」
如經覺的提議，十三日專心就任供目代。本來計畫是專心立即辭職，但繼任候補兼實卻推辭道：「出任供目代所需的費用沒有準備好。」（《經覺私要鈔》）一旦就任供目代，就必須要大開宴會，請客吃飯，給那些照顧過他的人送禮，開銷很大。最終，以專心起誓「不支持長懷」為條件，學侶一方承認了專心的在任。（《大乘院寺社雜事記》）
四月二十日，藤氏長者一條兼良的任命書送到，二十一日在古市的迎福寺舉行了交接儀式。這樣經覺正式成為別當，但他並沒有回到興福寺，而是繼續住在古市。經覺這波瀾起伏的第四次別當之旅開始了。
封印名字
作為學侶對番條長懷的懲罰，他們採取了「封印名字」這一措施。「封印名字」是什麼意思？根據植田信廣和酒井紀美的研究，把反抗寺社者的「名字」寫在紙片上，將其封印，實施詛咒，就是「封印名字」。目前僅能在興福寺、藥師寺、東大寺等大和國寺院看到這種情況。這裡選取興福寺的事例。
由於僧侶的名字有時也被「封印」，這裡的「名字」不是指苗字 ，而是指能夠指定詛咒對象的名（元服、出家等時接受上位者命名的情況稱作「賜名字」）。封印名字的場所多種多樣，或放入洗手池中，或封入內陣中，或釘在神社前。封印後，僧侶們聚集於南圓堂，念誦大般若經，實施降伏祈禱。封印名字與降伏祈禱是一個組合，兩者都實行完畢後詛咒才結束。
實施封印的主體是學侶、六方眾，或學侶與六方眾一同，門主不能私自實施封印名字的行為。學侶或六方眾要先舉行「神水集會」，才能封印。集會之時，如果不獲得全員贊同，共飲神水，對神起誓，也就是說不結成「一揆」 的話，是無法決意行事的。因此，封印名字的行為並非私刑，而是學侶、六方眾這樣的興福寺決議機構依照一定的手續實施的「公」罰。
被封印名字的對象主要是眾徒、國民等武士，平民是不會被封印的。眾徒、國民等若妨害興福寺的莊園控制，就被斷定為興福寺的敵人（「寺敵」「佛敵」），遭到封印。
被封印了名字的人將會遭遇發病、發狂、猝死這樣的災禍。在那個時代，得病猝死者並不稀奇，如果是被封印名字的人猝死了，人們就會認為是詛咒在起作用。換言之，封印名字的行為，就是利用了中世人們對神佛的恐懼和信仰，是一種宗教制裁。但是，正如筆者在拙著《一揆的原理》中講到的，中世的人們對神佛的信仰亦非絕對，若過多強調宗教性的恐懼，也是有問題的。
植田氏認為，將封印名字這一事實公示出來，不僅僅能發揮咒術上的作用，也帶有剝奪其武士身份的意思。雖然是否稱得上身份剝奪，尚有討論的餘地，但實施者應該是期待該儀式所帶來的貶低封印對象的社會效果的。
長懷的情況是，他的名字被封印在「五社七堂」。（《經覺私要鈔》）五社就是春日社本殿的四殿和若宮，也就是指春日社全體，七堂指興福寺七堂，即興福寺全體。可能是被封印於興福寺及與其一體的春日社境內各處了吧。然而，興福寺寺僧並非一致團結排斥長懷，因為六方眾（據尋尊的記載是六方眾的一部分）支持長懷，所以對他的宗教和社會制裁併不徹底。