燕王奉太孫朱文至進入京城後，因皇宮大火，許多宮室都被燒了，便只草草收拾了前頭大殿的幾處房屋，以作太孫下榻之所。其餘房屋，就只能等到日後再整修了。至於燕王本人，他在京城裡原有一處府第，雖然多年未住人了，但他長年在外征戰，本是武將性情，倒也不介意。
燕王大軍攻入皇城時，太孫還帶著隨從遠在百里之外的後方，接到燕王急信日夜兼程趕來，身體已經頗為勞累了。但他看著自小長大的宮院，心裡也是感慨萬千。宮人中有不少仍然感念悼仁太子夫婦的舊人，聞訊趕來拜見，他一個一個認下去，說起往事，心中十分傷感，當即便留下了幾個曾經侍候過先帝元後——也就他親祖母的老宮人，至於其他內侍宮女，則全交由胡四海打發了。他雖是個仁善的性子，卻不是傻瓜，燕王再三提醒他要小心宮中還有建文餘黨，他當然不會讓自己陷入危險之中。
這撥宮人離開後，太孫才有空歇口氣，這時候，燕王來了。
燕王是請他到大殿上朝去的：「大軍入城已有兩日，但京城臣民還有些人心惶惶，尤其是當年你父親慘死，但凡是站在他那邊的人家都落難了，剩下的這些勛貴都是袖手旁觀甚至是落井下石的，除去臨國公石家在去年重又投向我們，其他人都有些心虛，又有建文提拔起來的幾家人，都擔心你會秋後算賬呢。雖說他們可惡，死不足惜，但眼下還是以大局為重，陛下且忍讓著些，等日後局勢平定下來，再慢慢收拾他們不遲。」
太孫忙道：「王叔言重了，侄兒怎會不知道事情輕重？況且侄兒本來也沒打算對他們從重發落。」說罷嘆了口氣：「當年建文帝奪位，有多少世家勛貴一夕之間敗落？死的人更是不計其數，侄兒絕不會學他那樣暴虐！」
燕王微笑道：「這怎麼一樣呢？陛下宅心仁厚，卻也要賞罰分明，這不是天子一怒，伏屍千里，而是讓罪有應得之人得到他們該得的下場。否則，人人都以為自己即使背叛君主，也能依仗君主的仁慈逃得性命，日後哪裡還會有敬畏之心？」
太孫聞言肅然：「王叔說得對，是侄兒想岔了。」
燕王擺擺手：「陛下還年輕呢，難免有些思慮不周之處，算不得什麼。臣已經命人傳召文武大臣上朝，一會兒陛下就去露個面，宣布幾件事，安撫一下他們，就把他們打發走吧。接下來還要預備陛下登基之事，有的是事情要忙呢。」
太孫忙應了，又問：「要宣布希么事？」
燕王答道：「第一件事，就是對朱允炆的處置。如今明面上他下落不明，只說他拋下生母兄弟和子嗣逃走了就是，臣已經備好了詔書，陛下儘管廢了他的帝位，重新降為越王，再命宗人府審理他逼父弒兄篡位之罪，多多數上十幾二十條罪名，廢去他的王爵，並公布天下，也叫世人知道他罪無可恕，死有餘辜。」
太孫聽出幾分不對：「明面上下落不明？那實際上……」
燕王輕咳一聲，見殿內只剩下自己和太孫以及胡四海三人，便壓低聲音道：「宮中起火時，翰之帶人秘密潛了進來，命臣安插在宮內的人手幫著將朱允炆誆到此處綁起來，燒死了。翰之和他身邊的人都親眼看著朱允炆被燒成黑炭，確認無誤。」
太孫吃了一驚：「弟弟怎能冒這麼大的險？！」但他對於大仇人的死還是很高興的：「好弟弟，他總算為父親母親報了仇了！只是為何不等我一等？我也想親手殺了朱允炆！」
燕王嘆道：「這事兒是他自作主張，事後還特地來向臣請罪。他說，朱允炆雖是你們兄弟弒父仇人，但他身份在那兒，論血緣又是你們親叔，若讓你進城後，再將他處死，總會有多管閑事之人跑出來說嘴，指責你不該殺叔，到時候豈不是叫你為難？倒不如象如今這般，悄悄兒把人解決了，外頭人也不知道，只當他早已逃走，日後即便是下落不明，也沒人會再怪你。這是他做弟弟細心之處，雖有些莽撞了，但臣也不好說他什麼。」
太孫紅了眼圈，道：「他這是一心為了我，連大風險都顧不得了。我領他這份情。王叔若要罰他，就讓我代受吧！」
「陛下說笑了，臣也是擔心他行事莽撞，會傷到自身，哪裡是真要罰他。」燕王轉了話題，「朱允炆死了，陛下日後也能安心，這事兒也就罷了。只是呂太后與衡、徐二王，以及朱允炆所出三子，都被我們的人扣住了，要如何處置，還要陛下拿主意。」
太孫又猶豫了：「論名份，呂太后還是我祖母，衡、徐二王也是我親叔，三皇子更是我親侄，侄兒便罷了，若我要處置呂太后，只怕有不孝之嫌，世人知道了，也會覺得我不敬祖父的。可若要我對他們從輕發落，我又……」他咬咬牙，「他們當年也是朱允炆的幫凶。」
「那陛下打算怎麼做呢？」
太孫躊躇不定：「我……我不想寬縱了他們，可若是世人非議……」
燕王心中暗暗搖頭，只覺得太孫依舊優柔寡斷，都敢起兵將皇帝拉下馬來了，還顧慮什麼世人非議？呂太后先有縱子謀逆之舉，若不是先帝去得早，她興許連後位都保不住，又不是親祖母，有什麼孝不孝的？若是放縱了她，豈不是愧對慘死的悼仁太子？
只是這些話燕王不會說出口，他直接給出了建議：「衡徐二王不可輕縱，京中曾經傳言，指當年悼仁太子去後，先帝曾有意立他為儲，雖說那時陛下出逃在外，生死不明，但難保不會有別有用心之人認為他才是名正言順的繼位之人，抬舉他與陛下打對台。今日就一概用謀逆罪名收拾了他們，若是陛下心存仁德，就革去他們的王爵，將他們與各自的家眷一併送回鳳陽廣安宮幽禁。能饒了他們的性命，陛下已經是萬世少見的仁君了。」至於幽禁期間，他們會不會生病，會不會死去，那就是後話了，誰也不能擔保他們就不會有生老病死。
太孫聽了，覺得燕王這個建議極好：「王叔說得對，就這麼辦！」
「至於朱允炆的三子，雖然年幼，但他是罪人之子的身份，為免被有心之人利用，也當同樣送往鳳陽。我聽說他生母也跟他在一處，就讓他生母繼續照料他吧。若是日後他長大了能知道忠君，再放他出來做個尋常宗室子弟，若不然，由得他在鳳陽過一輩子也沒什麼不好。」燕王頓了頓，「而呂太后，既然是先帝遺孀，自當留在宮中頤養天年，只是以她所作所為，又有大逆不道之處，若仍舊讓她安享尊位，只怕先帝與我朱家祖宗們都要看不下去了。還是去了她的尊號，為她在宮中辟出一處清靜的宮院，讓她在那裡反省自身的罪過吧。」
這就是將呂太后幽禁在宮中的意思了，將她與衡徐二王分開看押，也有牽制之意。太孫隱隱猜想到燕王的用意，也覺得這樣比較妥當，忙笑著向燕王行了一禮：「多謝王叔建言。」
燕王側身避開，正色道：「陛下，臣既然已經改口了，陛下也當正視自己身份的改變才是。您如今已是一國之君，馬上就要登基為帝了，待臣下不可再如此客氣。」
太孫卻道：「王叔是我長輩，也是我恩人，我怎能在王叔面前擺架子？您再這樣說，我可就無地自容了！」又嘆息：「我真是無用，事事都要王叔為我操心。」
燕王不答反道：「陛下，時間不早了，趁著還有些時間，你進些茶水點心，歇口氣兒，一會兒自有人來侍候你換衣裳。朝會是在巳正三刻（上午十點四十五分），請你提早一刻鐘出發。殿外會有人備下車輦。」
太孫忙應了，燕王又囑咐了幾句話，便離開了。太孫看著他匆匆離去的身影，嘆了口氣。胡四海上前小聲道：「陛下為何嘆氣？早先奴婢還擔心大軍不能順利拿下京城，接著又擔心燕王會有異心，如今瞧燕王殿下言行，處處為陛下著想，陛下還有什麼可感嘆的呢？」
太孫盯了他一眼：「這話你連想都不該想，王叔怎會有異心？可別讓他知道了，不然，王叔生起氣來，我也保不住你！」
胡四海慌忙跪下請罪，絞盡腦汁想著如何讓太孫消氣，忽然想到一件事：「陛下，先時聽底下人說，章家人已經被廣安王安然接入京郊了，想必此時即便不在城中，也離得不遠。章將軍是隨大軍入城的，他長年在外征戰，京中的房舍也早在當年抄家時被抄沒了，若是要接家人回去團圓，只怕連座象樣的宅子都沒有，要不要……賜章將軍一所宅子？」
太孫合掌道：「叫你提醒了我！快快去請宮中總管來見我，大姨父的宅子固然是要賜下去的，但別的也不能少了，還有其他將軍們，也當論功行賞！」
且不說太孫如何見大臣們，又如何對燕王一系的將帥論功行賞，章家人進城後，欣賞了一番太孫與燕王進城時的英姿，便尋了處客棧住下。
若在平時，京城人員控制得極嚴，他們這樣身份來歷不明、沒有官方戶籍路引的人是斷不可能輕易入城的，借著當初卞副使幫忙辦的身份文書，也僅僅能在京城周邊地區找個莊子落腳罷了。但此時正值新舊朝交替，城中剛經歷了建文帝的一番清洗，無數人家被抄沒入罪，無數人家逃走，又有無數人家派了親信家人入城