因為呼籲萬曆皇帝取消礦稅的官員不在少數。但是，作為民間告狀而進了詔獄的紫柏和尚是第一人。紫柏的大名在京師可謂無人不曉，他的被逮因此也成了轟動京師的大事。紫柏的請願書究竟是如何寫的，明朝的官方檔案中沒有記載，而紫柏的文集中亦未收錄。他的請願書可能如李三才的奏本一樣火藥味十足。不然，審訊者不會不顧忌他的大名而進行嚴刑拷問。
紫柏被逮六天後第一次押到刑部過堂，他寫了一首《臘月初五日從錦衣衛過刑部偈》：
大賈闖入福堂來，多少魚龍換骨胎。
恐怖海中重睡穩，翻身驀地一聲雷。
紫柏把自己說成是「大賈」，把審訊室稱作「福堂」，然後又說自己在「恐怖海」中要安然高卧。這首偈詩語涉調侃，又很有一點藐視法堂的英雄氣。由此可見，紫柏不肯與讞審官配合承認有罪。因此，他受到酷刑便是意料中事了。請看他寫的《臘月十一日司審被杖偈》：
三十竹篦償宿債，罪名輕重又何如？
痛為法界誰能薦，一笑相酬有太虛。
坐來嘗苦虱侵膚，支解當年事有無。
可道竹篦能致痛，試將殘指送跏趺。
用竹篦夾手，稱為拶刑。用竹篦將十根指頭夾住，兩頭各套把手，行刑者一邊一個，使勁一拉把手，十根指頭輕者血肉模糊，重者指骨斷裂。行刑者用此酷刑對付一個六十多歲的老人，可見仇恨之深。但紫柏並不屈服，仍然堅持為民請命的意願。
關於這段公案，史載甚少，只說紫柏上書朝廷請求減少礦稅，卻被宦官權貴陷害。至於哪一位太監哪一位權貴害他，卻語焉不詳。
我想，宦官與權貴構害紫柏，必定與紫柏上書請願的內容有直接的聯繫。紫柏久居浙江，進京請求減免礦稅，說的也是浙江礦稅之事，其時朝廷中最有權勢的兩個人正好與此事有牽連。一個是內閣首輔沈一貫，另一個是礦稅總督大太監孫隆。沈一貫是浙江鄞縣人，孫隆雖不是浙江人，卻一直在浙江督收礦稅。紫柏的請願書如果有可能得罪人，這兩個人恐怕都會列為首選。箇中原因不外乎兩個：第一，都是浙江礦稅的當事人；第二，這兩個人的人品都不大好。孫隆負責徵收江蘇、浙江兩地的礦稅，在萬曆二十九年（1601年）的六月初六，因為孫隆在蘇州無理加稅並催討過急，導致民變，他的六位隨從都被當地礦工與稅戶亂棍打死。蘇州既是紫柏的家鄉，又是他出家之地，對此他不會熟視無睹。再說浙江礦稅之事，沈一貫雖是浙江人，卻對浙江過重的礦稅不置一詞。孫隆在浙江橫徵暴斂，亦不見他施以管束。客觀地講，沈一貫算不上奸臣，但明哲保身，在大是大非面前從不敢堅持真理，應是誤國誤民的庸官。紫柏進京告狀，作為浙江人，沈一貫覺得臉上無光。他可能覺得紫柏一個和尚，不守出家人的本分，反而千里迢迢跑到北京來踹他的窩心腳，他的生氣可想而知。此時，若是孫隆之流欲借刀殺人嚴懲紫柏，他即便不附和，也絕不會施以援手。在《徑山達觀可禪師塔銘》中模模糊糊記了一句：「時執政欲死師。」這個執政，就是沈一貫。
在這種情形下，紫柏的悲慘下場便已註定了。偏偏紫柏沒有認清這個形勢，還想著自己為民請命可以得到萬曆皇帝生母李太后的庇護。殊不知吃齋念佛的李太后，早已是獨居深宮，與外界已經隔絕。萬曆皇帝對她封鎖一切消息。所以，她壓根兒就不知道紫柏進京的消息。如此說來，紫柏是明知山有虎，偏向虎山行了。