艦長和副艦長都離開了，章北海將獨自修改艦長的口令，最後取得對「白然選擇」號的艦長控制權。
「他真的很聰明。」當球形艙的門消失後，井上明說。
「古代的智慧。」東方延緒說，她盯著艙門消失的地方，像要把那裡看透似的，「他從兩個世紀前帶來的東西，我們永遠學不會，可他卻能學會我們的。」
然後三人沉默了，靜靜地等待著。五分鐘過去了，對於重置口令的操作，這時間顯然太長了，而即將成為艦長的章北海，是培訓後的特遣隊成員中對戰艦指揮系統操作最熟練的人。又過了五分鐘，兩名副艦長不耐煩地在廊道里浮游起來，只有東方延緒仍靜靜地站立不動。
終於，門又在艙壁上出現了。三人驚奇地發現，球形艙里變黑了，章北海調出了星圖的全息顯示，並屏蔽了圖上所有的標度線，只留下閃亮的星星，以至從門這邊看去，他彷彿懸浮於飛船外的太空中，與他一起懸浮著的還有一塊亮著的操作界面。
「我做完了。」章北海說。
「怎麼用了這麼長時間？」列文不滿地問。
「你是在享受得到『自然選擇』號的快感嗎？」井上明問。
章北海沒有說話，他的眼睛也沒看操作界面，而是遙望著星圖上遠方的星辰，東方延緒注意到，在他注視的方向，有一個綠色光點在閃動。
「要是那樣就太可笑了。」列文接過井上明的話說，「我需要提醒你，艦長仍足東方大校，執行艦長不過是一道防火牆而已，這樣說不好聽，但最接近實情。」
井上明接著說：「而且這種狀態不會持續太長的，對艦隊的調查已經接近尾聲，基本證明了鋼印族並不存在。」
井上明還想說什麼，但被艦長的一聲低低的驚呼打斷了，「哦，天啊。」東方延緒說，兩位副艦長順著她的目光看去，看到了章北海面前的操作界面，因而也看到了「自然選擇」號太空戰艦目前所處的狀態。
戰艦已被設定為無人遙控狀態，因而繞過了四級加速前對乘員深海狀態的檢測，戰艦與外界的通訊也被完全切斷，最後，戰艦完成了進入最高推進功率的絕大部分艦長設定，只需再按動一個按鈕，「自然選擇」號將以最大的加速度駛向星圖上已經設定的目標。
「不，別這樣。」東方延緒說，聲音低得只有自己能聽到，這話是說給她前面呼喚過的那個「天」聽的，以前，她自己並不相信它的存在。而現在，她的祈禱是真誠的。
「你瘋了？」列文喊道，與井上明一起向艙內衝去，但立刻撞在艙壁上，門並沒有出現，只是那一個橢圓形區域的艙壁變得透明了。
「『自然選擇』號將進入『前進四』，全艦人員立刻進入深海狀態。」章北海說，他的聲音冷峻而沉穩，每一個字都長久地浮在空氣中，像立在寒風中的古老鐵錨。
「這不可能！」井上明說。
「你是鋼印族嗎？」東方延緒問，她飛快地使自己冷靜下來。
「你知道我不可能是。」
「ETO？」
「也不是。」
「那你是誰？」
「一個盡責任的軍人，為人類的生存而戰。」
「為什麼這樣做？」
「加速完成後再解釋，再說一遍：全艦人員進入深海狀態。」
「這不可能！」井上明重複道。
章北海轉過頭來，他沒有看兩位副艦長，目光直視東方延緒，這目光立刻使東方想起了太空軍的軍徽，星星和劍在其中都有。
「東方，我說過，如果不得不殺了你，我很抱歉。時間不多了。」他說。
這時，在章北海所在的球形艙內，深海加速液開始出現，它們在失重中形成一個個球體，每個球體上，都有章北海的操作界面和星圖的變形映像。液球飄浮著，開始相互組合成更大的球。兩位副艦長都看著東方延緒。
「照他說的做，全艦進入深海狀態。」艦長輕聲說。
兩位副艦長凝視著她，他們都知道「前進四」時未處於深海保護狀態下的人是什麼下場：身體被超過自身重量一百二十倍的過載緊貼在艙壁上，先迸射出的是血液，超重下攤成極薄的一層，血漬的面積大得不可想像並呈放射狀；然後擠出的是內臟，也很快被壓成薄薄的一層，與被壓成一片的身體一起，構成一幅醜陋的達利風格的畫……他們同時轉身離去，向全艦發布進入深海狀態的命令。
「你是一個合格的艦長。」章北海對著東方延緒點點頭，「這就是成熟。」
「我們要去哪裡？」東方延緒問。
「不管去哪裡，都是一個比留在這裡更負責任的選擇。」
章北海說完，就被深海加速液完全淹沒了，東方延緒只能透過已充滿球形艙的液體看到他模糊的身影。
章北海懸浮在半透明的液體中，想起了他兩個世紀前在海軍服役時深度潛水的經歷。當時他沒有想到海洋中的幾十米深處已經是那麼黑，懸浮在那個世界中，很有後來身處太空的感覺，海洋是太空在地球上的縮影。他試著在液體中呼吸了一下，神經反射使他劇烈地咳嗽起來，咳出的液體和殘留氣體產生的反衝力使他的身體傾斜了，但想像中的窒息並沒有出現。清涼的液體充滿了肺部，其中富含的氧繼續融進他的血液，他能夠像魚一樣自由呼吸了。
章北海看著懸浮在液體中的顯示界面，看到深海加速液依次充滿飛船上各個有人的艙室，這個過程持續了十多分鐘。漸漸地，他的意識開始模糊，呼吸液中開始注入催眠成分，以使飛船上的所有人進入睡眠狀態，避免四級加速時的高壓和相對缺氧對大腦的損害。
章北海感到父親的靈魂從冥冥中降落到飛船上，與他融為一體，他按動了操作界面上那個最後的按鈕，心中默念出那個他用盡一生的努力所追求的指令：
「『自然選擇』，前進四！」
木星軌道上突然出現了一顆小太陽，它強烈的光芒使得行星上大氣層中的磷光黯然失色。拖著這顆小太陽的「自然選擇」號恆星級戰艦緩緩駛出亞洲艦隊的軍港，然後急劇加速，把艦隊中其他戰艦的影子投到木星表面，每個影子的大小都可能容下一個地球。十分鐘後，一個更大的影子投向木星，彷彿給這顆巨行星的表面拉上一塊幕布，這是「自然選擇」號在掠過木衛一。
直到這時，亞洲艦隊統帥部才確認了這個令人難以置信的事實：「自然選擇」
號叛逃了！
歐洲和北美艦隊向亞洲艦隊提出抗議和警告，它們最初認為這可能是亞洲艦隊擅自攔截三體探測器的行動。但很快從「自然選擇」的航向上發現不是這麼回事，它的航向與三體入侵的方向相反。
各個系統向「自然選擇」號的呼叫因得不到回答而漸漸平息下來，追擊和攔截行動開始部署。但統帥部很快發現，目前對叛艦幾乎無事可做。在木星的眾多衛星上，有四顆衛星的火力可以摧毀「自然選擇」號，但這是一個不可能採取的行動，實施叛逃行動的應該只是艦上的極少數甚至一個人，兩千多名在深海狀態中的官兵都是人質。所以，在木衛二上伽馬射線激光武器的基站中，指揮官們只能看著那顆小太陽掠過天空飛向外太空，在它的光芒下，木衛二的廣闊冰原上像是撒滿了燃燒的白磷。
「自然選擇」號依次穿過木星的十六顆大衛星的軌道，在穿越木衛四軌道時已經達到了木星的逃逸速度。從亞洲艦隊基地看去，那顆小太陽漸漸縮小，變成一顆明亮的星星，但在以後長達一個星期的時間裡，這顆星星仍依稀可見，在群星中隱現著亞洲艦隊無盡的傷痛。
由於需要進入深海狀態，追擊艦隊在「自然選擇」號離去後四十五分鐘才起航，木星系統再一次被六個太陽照耀。
在已經停止旋轉的亞洲艦隊司令部里，艦隊司令默默地面對著處於黑夜一面的巨大的木星，在他下方一萬公里的大氣層中，有一片閃電出現，剛剛離去的「自然選擇」號和追擊艦隊的聚變發動機向木星發出了強大的輻射，使大氣電離引發了閃電。這個距離上只能看到被每一次閃電所照亮的周圍大氣的光暈，不同位置的光暈轉瓣即逝，使得木星的這一片區域像滴落著熒光雨點的池塘。
「自然選擇」號在沉默中持續加速到光速的百分之一後，它的聚變燃料的消耗已經越過折返點，憑自己的動力已經不可能返回太陽系，它成為了一艘永遠在外太空流浪的孤舟。
亞洲艦隊司令遙望星空，試圖看到那顆星星，但沒有找到，那個方向上，只有追擊艦隊的聚變發動機發出的六點暗弱的星光。他很快得到報告，「自然選擇」
號已經停止加速。稍後，「自然選擇」號與艦隊的通訊恢複了。以下是通話記錄，由於飛船的位置已在五百萬公里之外，對話有十多秒鐘的時滯。
「自然選擇」號：「『自然選擇』呼叫亞洲艦隊！『自然選擇』呼叫亞洲艦隊……」
亞洲艦隊：「『自然選擇』號