關於豐臣秀吉的侵朝之戰，存在著兩個千古之謎。其一，這究竟是秀吉的個人行為，還是亂世初終、餘波未息的形勢所必然引發的結果？其二，秀吉的最終目的，是不是真如他狂妄的宣稱那樣，不但要吞併朝鮮，還想侵入中國，更進一步染指天竺和「南蠻」（所指應為歐洲列強在東南亞的殖民地，而非其本土）？
桃山時代大名配置
豐臣秀吉滅亡小田原北條氏以後，隨即兵指東北，奧羽諸侯紛紛卸甲歸降，就這樣，延續了百餘年的亂世終於畫上一個休止符。秀吉重新劃分諸大名的領地，為了後事的敘述方便，咱們在這裡先把當時全日本最主要的大名及其領地位置開列一番（天正十八年的格局）——
首先從東北地區算起：蝦夷地是蠣崎慶廣；出羽是秋田實季、戶澤盛安、小野寺義道、最上義光，基本都是原有勢力；陸奧除津輕為信、南部信直、伊達政宗、相馬義胤、岩城貞隆等舊勢力外，還插入一個蒲生氏鄉。氏鄉原名忠三郎賦秀，乃是南近江豪族、日野江城主蒲生賢秀之子。織田信長上洛之際，蒲生氏背六角而降織田，此時的氏鄉還叫鶴千代，年僅十三歲，尚未元服，即被信長相中，不但做了這少年的烏帽子親，還將次女冬姬下嫁。蒲生氏鄉於文武兩道皆有不凡的才能，還是當時的茶道名家，亦深受豐臣秀吉器重——所以把他安排在奧州，實授監視東北諸侯之重責。
關東地區：常陸國分給佐竹義重、來自上野的由良國繁，以及被伊達氏滅亡而由豐臣秀吉扶持復興的奧州大名葦名義廣；下野有舊豪族那須資景、大關高增、成田氏長、宇都宮國綱、佐野房綱等等；上野有沼田的真田信之（真田昌幸之子）；安房是里見義康。
廣袤的關東平原，當然不會就這幾家分封勢力，事實上在討滅小田原北條氏以後，豐臣秀吉便將德川家康轉封到關東地區，家康及其部下擁有上總、下總、武藏、相模、伊豆的全部和上野、信濃的一部分。家康本人的直轄領地多達二百四十二萬石，加上麾下重臣本多忠勝、內藤信成、大久保忠世等人的封地，總石高超過三百五十萬。秀吉的本意，大概是想把家康從他原有的控制穩固的駿遠三、甲信等地驅逐出去吧，但沒想到從此關東地區反倒變成了德川家覬覦天下的本錢。家康將主城定在江戶，也就是戰國中期扇谷上杉氏家宰、名將太田道灌所蓋的那座海邊小城，因此後來他開設幕府，奪取天下以後，德川氏幕府也被稱為江戶幕府。
駿河國內受封的大名有中村一氏；遠江有堀尾吉晴和山內一豐等人；三河封給池田輝政（池田恆興之子）、田中吉政等人——這些都是豐臣秀吉的嫡系。尾張最大的大名是豐臣秀次，乃是秀吉的外甥兼養子，一度成為秀吉的繼承人。
美濃有織田秀信（即三法師）、稻葉重通、貞通兄弟（稻葉一鐵之子）等；飛驒是金森長近；甲斐是加藤光泰——這些都是原出織田氏的豐臣秀吉的部下。信濃封給仙石秀久、真田昌幸等人。仙石秀久出身美濃國人，很早便追隨秀吉，戰功卓著，「賤岳合戰」後受封淡路洲本五萬石。但他在「九州征伐」中舉止失措，大敗虧輸，遂遭改易，並被流放至高野山。「小田原之陣」的時候，秀久在德川家康的保舉下得到寬赦，集結美濃浪人參戰，戰後受封信濃小諸五萬石。
越後仍是上杉家的，當主上杉景勝。越中、能登、加賀的大片領地封給了豐臣秀吉的好友，在賤岳合戰中不戰而走從而使柴田軍全面崩潰的前田利家。此外，這一地區還有不破廣綱、溝口秀勝、丹羽長重（丹羽長秀之子）等諸侯。越前主要封給織田·豐臣兩代的寵臣堀秀政、丹羽長秀另外一個兒子長正，以及蜂屋賴隆、大谷吉繼（吉隆）、豐臣秀勝（織田信長之子，豐臣秀吉的養子）等人；若狹封給秀吉的連襟淺野長政（長吉）。
靠近京都的近江國，地理位置非常重要，因此秀吉主要安排了親信石田三成、京極高次等人。石田三成幼名佐吉，為近江土豪石田正繼的次男，據說他很小的時候就被送進某寺院出家。此時豐臣秀吉還在織田氏麾下做長濱城主，一次出門狩獵，跑得累了，便氣喘吁吁地停留在這家寺廟之中，身為小沙彌的三成為秀吉先後上了三碗茶：第一碗量大而溫，秀吉一飲而盡，覺得甚為解渴；第二碗量較少，熱度也高一點，秀吉幾口喝乾，覺得身體暖融融的，很是愜意；第三碗量很少，溫度很燙，秀吉小口啜飲，心情隨即平靜下來。通過「三碗茶」之事，秀吉覺得這個小沙彌非常有頭腦，便命其還俗，收在身邊做了侍衛，後來主要負責民政事務，算無遺策，可謂是天才的民政家。至於京極高次，他乃是淺井長政的女婿，長政和市姬共生了三個女兒，長女茶茶（淀姬）被秀吉扯入後宮，二女小初嫁給京極高次，三女小督則是德川家康的繼承人秀忠的夫人——因此高次也可以算是秀吉的連襟。
伊賀國封給大和豪族筒井定次（筒井順慶之子）；伊勢封給氏家行廣（氏家卜全之子）、瀧川雄利（瀧川一益之子）、織田信包（織田信長之弟）等人；志摩還是給了本地出身的水軍大將九鬼嘉隆；紀伊留給雜賀眾杉若無心、鈴木重朝等人。
秀吉把大和國交給了親兄弟豐臣秀長；和泉國封給了家臣小出秀政、吉政父子；攝津國給了織田長益（即織田信長之弟、著名的茶人有樂齋）。畿內五國是豐臣秀吉的統治中心，因此分封的諸侯很少，絕大多數領地都由秀吉直轄。
丹波國安置了親信前田玄以等人；丹後仍是細川藤孝、忠興父子；但馬國有川筋眾出身的老臣前野長康等；播磨有家臣木下家定等；因幡有原近江豪族、秀吉大為倚重的宮部繼潤；備前、美作、備中的大片土地給了養子宇喜多秀家。西中國的最大諸侯仍是毛利氏，領有出雲、石見、安藝、周防、長門等國，並備後和四國贊岐的一部分。天正十九年（公元1591年）四月，毛利輝元把主城從安藝國東北部的吉田郡山遷移到西南部海邊的廣島。
淡路配置了親信加藤嘉明、脅坂安治（「賤岳七本槍」中的人物）；阿波給了川筋眾出身的老臣蜂須賀正勝之子家政；贊岐在十河存保戰死後，封給生駒親正、一正父子；伊予較大的諸侯有毛利氏家臣來島通總、安國寺惠瓊，宇喜多氏家臣戶田勝隆，以及「賤岳七本槍」中的福島正則；土佐一國則是長宗我部元親。
九州地區：筑前封給小早川隆景及其養子秀秋（也是豐臣秀吉妻子的外甥）；筑後是毛利元就的九男小早川秀包，以及大友氏名將立花宗茂；豐前封給了豐臣秀吉的軍師、原出播磨的黑田如水（孝高）及其子長政；豐後是大友吉統等人；肥前是鍋島直茂、有馬晴信、大村喜前等人，基本都是當地豪族；肥後如前所述，給了親信加藤親正和小西行長，此外還有個當地豪族相良賴房；日向北部是秋月種長等人，南部及薩摩、大隅仍為島津義弘；對馬給了世代鎮守於此的宗氏，當主為宗義智。
從各地諸侯的配置上可以看得出來，豐臣秀吉的「天下」，基本還是繼承了織田信長的格局，信長在近畿地區鏖戰數年，六角、三好、淺井、朝倉等強力大名都已被掃除乾淨，因此秀吉才可以將這些土地分封給自己的部下和舊日同僚。除此以外，東中國、東四國、北九州都是秀吉親自打下來的，他也可以放心大膽安插親信。至於用外交手段解決的上杉、毛利等豪強，以及壯志未酬便被壓縮回去的島津、長宗我部、伊達等邊遠勢力，秀吉沒有能力將其一口吞下，只好給張所領安堵狀，保證了他們的基本利益不受剝奪。
只有德川家康是個例外，豐臣秀吉絞盡腦汁把他從老根據地里趕出去，可是被迫又封給了更為廣袤富庶的關東平原。沒有辦法，家康在小牧·長久手之戰中打敗了秀吉，人氣飈升到頂點，秀吉當時為了及早從一場可能曠日持久的戰爭中抽出身來，被迫純以外交壓服，而沒機會再打一仗來挽回面子。在這種情況下，他肯定要轉封德川氏，以免家康坐大，但表面上還必須做出重賞家康的姿態，不能讓別人看出來自己想給家康穿小鞋。後人不能責難秀吉將家康轉封關東是給自己家族安排好了掘墓人，他當時並沒有第二條道路可走……
壬辰倭亂
通過諸侯配置情況可以得出結論，豐臣秀吉的統一是很粗略的，國內依舊危機四伏，各方仍有龐大的諸侯勢力虎視眈眈，秀吉本人只是一位諸侯霸主，而不像是一位真正意義上的全日本最高統治者。正因如此，秀吉不得不將很多外樣大名吸納入決策中心，以保證諸侯們的權益。
豐臣政權的最高決策機構是「五大老」（當時的正式稱呼為「御奉行眾」），即德川家康、前田利家、宇喜多秀家、毛利輝元和小早川隆景（隆景死後，由上杉景勝繼任），都是擁有一國甚至數國領地的強橫大名。後來又設置了「三中老」（當時的正式稱呼為「小年寄」）和「五奉行」（當時的正式稱呼為「年寄共」）處理具體事務。「三中老」分別為堀尾吉晴、生駒親正和中村一氏，「五奉行」則是淺野長政、石田三成、前田玄以、長束正家和增田長盛——這些人