李斯屈從之後，胡亥、趙高、李斯要對付的首要目標便是扶蘇。因為扶蘇佔有的政治資源非常豐富。第一他是皇長子；第二他是秦始皇生前確定的喪事主持人，言外之意就是皇位繼承者；第三他在朝中擁有眾多的支持者；第四他與蒙恬擁有重兵，槍杆子裡面是能夠出政權的。
此時的大秦帝國只有兩大軍團：一是長城軍團，二是南越軍團。南越軍團遠在兩廣，遠水不解近渴，根本派不上用場。即使在陳勝、吳廣反秦大起義之時，這支五十萬人的南越軍團也未能北歸，所以，這支軍團是指望不上的。長城軍團則不同，它駐守的河南地，就在大秦帝國的北邊，沿著直道南下，很快即可抵達關中之地。因此，長城軍團一旦兵變，對大秦帝國而言將是致命的。
扶蘇儘管佔有多重優勢，但是，他有兩個明顯弱勢：一是扶蘇對其父秦始皇的病故與真正遺詔的內容毫不知情；二是趙高手中的皇帝符璽可以偽造遺詔。如果扶蘇知道秦始皇已經病故，知道父皇在遺詔里是想傳位給自己，那會怎麼樣？肯定會發生兵變啊！只要扶蘇知道了真相，一定不會俯首聽命。只要扶蘇起兵，政變集團就會陷入極大的被動，乃至功虧一簣。可事實是，扶蘇不知道真相。一句話，信息的不對稱使扶蘇陷入極大的被動。多重優勢被兩個明顯的弱勢擊倒。
在扶蘇毫不知情的情況下，政變集團便偽造了一個專門對付扶蘇的秦始皇「遺詔」。這個「遺詔」的核心是賜死扶蘇。也只有讓扶蘇在這個世界上消失了，他們才能心安。否則，只會惶惶不可終日。
那麼以什麼理由讓扶蘇從這個世界上消失呢？
世界上什麼都缺，唯獨不缺少殺人的理由，欲加之罪，又何患無辭呢？在這場政變中，再也沒有什麼比捏造賜死扶蘇的理由更容易的事了。以趙高為首的政變集團不但給出了理由，而且給出了充分的理由，列了足足四條，每條都冠冕堂皇。
一是守邊無功。
守邊無功，就是說扶蘇與蒙恬不能開疆擴土，數十萬軍隊只有損耗，沒有為國爭來一絲一毫的土地（今扶蘇與將軍蒙恬將師數十萬以屯邊，十有餘年矣，不能進而前，士卒多耗，無尺寸之功。《史記·李斯列傳》）。
本來，大秦帝國對草原民族採取的是防範為主的方略，這才有萬里長城。長城，就是阻隔農業文明與草原文明的一道屏障，就是一種防禦手段。所以，蒙恬儘管有數十萬大軍，但他主要的任務也就是防範，而不是去消滅一個民族，況且，龐大的草原民族也無從消滅。其實，只要能守住北方草原民族的入侵，目的就已經達到了。由此看來，「守邊無功」只不過是一個殺人的借口。
二是誹謗朝政。
政變集團賜給扶蘇的「詔書」上指責扶蘇「反數上書直言誹謗我所為」。你多次上書議論我，對我的行政措施指手畫腳。可見，扶蘇即使被貶到邊地擔任監軍，也一直沒有停止對秦始皇的勸諫。這恰恰是胡亥之流加在他頭上的罪名。其實，扶蘇完全是為了帝國的長遠利益，為了秦始皇的歷史名聲。但是，對待不同政見可以從善如流，也可以誣陷為誹謗。因此，「誹謗朝政」也是一個借口。
三是謀立太子。
胡亥指責扶蘇「以不得罷歸為太子，日夜怨望」，真是顛倒黑白！誰日夜盼望太子之位？扶蘇如果真想當太子，他最好的辦法是閉起嘴來，這樣，也許他早就當上太子了。正是因為扶蘇不刻意以太子為人生目標，所以，他才屢屢上書，即使被貶到邊地也不忘進言。顯然，這一條也是欲加之罪。小人的齷齪之處就在於無恥且光明正大地把自己的齷齪強加於對方，從而證明自己的清白。
四是為人不孝。
胡亥給扶蘇加了「不孝」的罪名，但是，並沒有說明扶蘇如何「不孝」。真正的「孝」是恪守父訓。胡亥連父皇的遺詔都可篡改，還侈談什麼「孝」與「不孝」？叛臣逆子又有什麼資格來談「孝」呢？這是他們最害怕別人定在他們身上的罪名，所以急不可耐地先加在扶蘇身上。扶蘇最終堅守「父讓子死子不得不死」的古訓而拔劍自刎，這恰好證明了扶蘇恪守孝道。
政變集團將矛頭對準扶蘇。看到這份偽造的「遺詔」，扶蘇會怎麼辦呢？扶蘇該怎麼辦呢？扶蘇接到詔書後，如同晴天霹靂，肝膽俱裂，痛心而泣，轉身回到帳中就要拔劍自殺（扶蘇泣，入內舍，欲自殺。《史記·李斯列傳》）。一哭，二入，三自殺。扶蘇的表現是對秦始皇的異常忠誠，但是，這種愚忠愚孝令人失望！扶蘇並非孩童，但是，他卻有如孩童般的單純。他屢屢上書勸諫秦始皇，他不辨詔書真偽，看見賜死詔書就想自殺了事。他根本沒有想過這份詔書是不是假的，更沒有想過這世界上還有人敢於偽造詔書。
扶蘇的單純令人敬重，亦令人吃驚。
詩人愛默生說過：「沒有一件事比偉大更為單純，事實上，單純就是偉大。」單純是偉大，但是，單純亦可以是幼稚，甚至於單純也可以是愚蠢。
如此的政治閱歷，如此的政治判斷，證明扶蘇只是一位「合法」的帝位繼承人，而並不是一位「合適」的政治家，也不是一位「合適」的大秦帝國的二世君王。
秦始皇一生不立皇太子，臨終時又選了一個「合法」但不「合適」的皇位繼承人。這表明秦始皇儘管在兼并六國的過程中頗有識人之明，但是，在選拔帝位繼承人時卻又喪失了這種智慧。能處理好國事者，未必能處理好家事；而對於一位帝王來說，自古家事皆國事。
由於扶蘇對這封假遺詔深信不疑，而且他覺得父皇既然都賜他死了，再請示還有什麼意義呢？隨即自殺（扶蘇為人仁，謂蒙恬曰：「父而賜子死，尚安復請！」即自殺。《史記·李斯列傳》）。
與扶蘇同時被賜死的還有一人，此人的所作所為就與扶蘇大相徑庭。此人是誰？他為什麼敢抗旨不遵呢？