法皇方面有近江守源藏人仲兼 ，帶領約五十騎，堅守著法住寺殿西門，不讓敵人出入。近江源氏山本冠者義高 馳馬過來，告之曰：「各位仍然在此，為誰而戰？法皇與皇上皆已駕幸他處，不在殿中矣。」仲兼道：「既然如此。」便大聲吶喊，帶隊衝進大敵陣中，左砍右斬。等到殺出重圍時，只剩主從八騎。八騎之中，有一個屬於河內日下黨、名叫加賀房 的法師武士，騎著一匹極難駕馭的白葦毛悍馬，言道：「此馬過於粗暴，極難馴服。」源藏人道：「然則改騎我馬可也。」便讓加賀房改騎其白尾栗毛馬，發出吶喊，沖向根井小彌太防守川原坂 的二百騎陣中。結果，八騎中五騎陣亡，只剩主從三騎。加賀房嫌其悍馬難馭，改乘主人之馬，卻也不免在此壯烈犧牲。
源藏人有部下叫信濃次郎藏人仲賴 ，在交戰亂陣中被敵人隔開，不知主人的去向。看到一匹白尾栗毛馬跑了出來，便叫來下人，說道：「此馬看來是源藏人之馬無疑。主公可能已經陣亡。曾有誓約，要死當死在一處，如今卻非分別戰死不可。可悲呀。看到源藏人攻入何處陣地否？」答道：「馳入川原坂敵陣。此馬亦從該陣中跑出來。」仲賴道：「然則汝可回去矣。」並吩咐可向故鄉轉達其臨終情形。旋即匹馬單身，沖入敵陣中，大聲報名道：「敦實親王九代苗裔、信濃守仲重次男 、信濃次郎藏人仲賴是也。行年二十七。凡有自命不凡者請上前來，願接高招。」於是，上躥下跳、左閃右拐，使出蜘蛛手、十文字等絕招。奮勇應戰，殺傷不少。無奈我單敵眾，終告不支，當場斃命。
源藏人仲兼對於此事卻一無所知，正與其兄河內守及隨從一人，主從三騎逃往南方。來到木幡山，巧遇因怕戰爭而離京奔赴宇治的攝政殿 。攝政殿以為木曾餘黨追來，停車問道：「來者何人？」答道：「是仲兼。」「是仲信。」攝政殿喜道：「何其巧合。原以為北國兇徒。來得正好，可就近協助保護之責。」仲兼等唯唯諾諾，護送至宇治富家殿 ，然後奔向河內國。
翌二十日，木曾左馬頭站在六條河原，著人懸掛清點昨日所斬首級，共計六百三十餘人。其中也有明雲大僧正、園城寺長吏圓惠法親王的頭顱。見者莫不落淚。木曾率領軍勢七千餘騎，馬鼻朝東，吶喊三次，震天撼地。京中又騷動起來，以為又有戰事。不過傳言說，此次是慶祝勝利的吶喊。虛驚一場。
故少納言入道信西之子宰相修范 ，前往法皇所住的五條行宮，求道：「有要事上奏法皇，請開門讓進。」但守門武士不準其請。出於無奈，便到一小屋，立即落髮為僧，穿上緇衣，再上前求道：「這般模樣應無大礙矣。請讓進。」總算獲准進門。修范來到法皇御前，面奏昨日受害主要人名及其細節。法皇聽得雙眼潸然，嘆道：「明雲死於非命 ，未嘗料及。此次當是替代應死之我而死。」說著抑不住簌簌淚下。
木曾召集家臣部屬等開會議事，宣示道：「我義仲向一天之君宣戰而大獲全勝。如今不知該當天皇，或當法皇。若想當天皇，必須垂髮穿童裝，不好；若想當法皇，必須光頭披僧衣，可笑。對對，可當關白。」但一直陪在身邊的書記大夫房覺明，卻提醒木曾道：「關白只有大織冠 後代藤原氏始可任之。大人是源氏出身，顯然不妥。」木曾無計奈何，便自封為法皇御廄別當 ，且以丹後國為其領國。對於上皇在出家後稱法皇，幼帝在元服前不能束帶之事，木曾似乎並不甚瞭然，也夠難為情了。此外，還看上前關白松殿 的公主，強娶過來，自詡是松殿的女婿。
同年十一月二十三日，解除了三條中納言朝方 卿以下，大臣、公卿、殿上人共四十九人的官職。平家所解職者是四十三人。此次竟有四十九人之多。其專權惡行已超過了平家。
且說，鎌倉前兵衛佐源賴朝為遏止木曾的暴行，已指派其弟蒲冠者范賴 與九郎冠者義經 ，準備隨時揮軍進京。但兩人聽說法住寺殿已被燒毀，法皇正被幽禁中，天下彷彿黑夜，覺得似乎不是進京戡亂的良機。
兩人想向關東報告法住寺事件，經過尾張國熱田大宮司 家打尖時，供職法皇北面的宮內判官公朝 、藤內左衛門時成 ，也正好趕到尾張國，便將事件的經過曲盡委細地做了報告。九郎義經道：「此事應由宮內判官親下關東。若遣不知詳情之使者，如蒙垂詢，恐有答非所問之慮。」於是公朝乃馳往鎌倉。家中下人怕戰爭，都逃走了，所以只有十五歲的嫡子宮內所公茂相伴同行。
公朝趕到關東，稟報了京中慘狀。兵衛佐大驚道：「鼓判官知康先是進讒挑撥，又在陣前亂髮議論、語無倫次，以致燒毀御所，高僧貴僧 雙雙遇害，真是豈有此理。知康已嚴重違反聖旨，如任其留在朝中，必將再次引起大禍。」便派快馬馳京上奏。鼓判官想為自己辯解，日夜兼程，來到鎌倉。兵衛佐交代道：「絕不見此小子。不可交談。」儘管如此，鼓判官還是不死心，日日現身在兵衛佐的官邸門口。結果丟盡了面子，憮然離開了關東。聽說後來住在稻荷神社 附近，悄悄地度過了後半餘生。
木曾左馬頭派遣使者往見平家，傳話道：「請速來京師，以便聯合陣線，征討東國。」大臣殿宗盛極為興奮。平大納言時忠、新中納言知盛卻不以為然，勸道：「當今雖臨末世，如為義仲所誘而貿然返回京都，萬萬不可。我方十善帝王 保有三種神器，反而應該詔諭木曾曰：『卸甲棄弓，來此降服。』」平家便如此作復，木曾當然不加理會。
松殿入道 請木曾到府邸來，勸說道：「清盛公雖然作惡多端，但亦種下不少稀有大善根，故能保持治世二十餘年。只有惡行，不能治國平天下。日前所解多人官職，皆無非解職不可之過。宜乎各復其原職，幸甚幸甚。」木曾儘管野蠻任性，此一勸誡倒聽進去了，於是恢複了各人原來的職位。
松殿之子藤原師家 晉陞大臣攝政時，年僅十二歲。">，時任中納言中將，由於木曾居中干涉斡旋，晉陞為大臣攝政。當時大臣並無懸缺，只好借用德大寺左大將實定公所兼內大臣之位，使師家順利當上內大臣。口口相傳，乃人之常情，不久新大臣攝政殿便有了「借用大臣」的綽號。
同年十二月十日，法皇離開了五條行宮，移至大膳大夫業忠 的府邸六條西洞院。同月十三日有歲末法會 ，順便行了敘位封官之禮。因為木曾的介入，人人都得到了所求的官位，皆大歡喜。如今平家在西國，兵衛佐在關東。木曾則佔據京畿，有如前漢與後漢之間，王莽篡國十八年 一般。京城四周的關口都緊閉不準通行，因而諸國的年貢進不來，私領的歲收也被擋在關外。京中上下諸人不異少水之魚 。險象環生的一年已暮，不覺迎來了壽永的第三年。