空軍三個主要情報機構是：負責情報/跟蹤/偵察的副參謀長辦公室（Office of Deputy Chief of Staff for Intelligence, Surveilland Reaissance）、空軍第25聯隊（25th Air Force）和國家航天航空情報中心（National Air and Spatelligence ter）。另外，美國空軍特別調查辦公室（Air Force Office of Special Iigation）的職能包括反間諜情報。
1997年初，空軍解散了負責情報的助理參謀長辦公室，將其職能分配指派給負責航天和航空行動的副參謀長辦公室（Office off the Deputy Chief of Staff for Air and Space Operation）直接領導的「情報/跟蹤/偵察處」（Directorate of Intelligence, Surveilland Reaissance）。2005年，空軍重新設置這個崗位，並升格為負責情報的副參謀長，之後重新命名為負責情報/跟蹤/偵察的副參謀長辦公室。
來源：美國空軍（USAF），截至2013年12月。
作為空軍情報、跟蹤和偵察所有部門和活動的監督管理機構，副參謀長辦公室負責管理一個「超過30000名員工的大企業」。如圖4.6所示，2013年，這個副參謀長辦公室下轄五個處和兩個一線外勤行動局。ISR處（ISR指情報、跟蹤、偵察。——譯者）監督ISR可用資源的表現和效益，指導實施計畫與程序提高情報搜集、處理、開發利用和分送ISR數據的能力。ISR戰略/計畫/條例/部隊開發處（Directorate of ISR Strategy, Plans, Doe and Force Development）負責制定開發空軍ISR戰略計畫，以支持國家安全和軍事戰略。ISR資源處（ISR Resources Directorate）代表空軍處理與情報界和國防部委員會相關的政策、人力資源、資金和情報需求等事務。特別計畫處（Special Programs Directorate）負責「行動的管理、監督和整合、研究與開發以及情報界內部的限制訪問項目」。
「空軍情報局外勤局」（Air Fortelligence Agency Field-operating Agency）和空軍第25聯隊是1971年受命成立，該指令是由空軍部長下達，授權要求空軍參謀部重新分配指揮和支持部門職能。為執行這一指令，「空軍情報服務局」（Air Fortelligence Service）於1972年6月27日成立。1988年，該局的地位獲得提升，成為「空軍情報局」（Air Fortelligence Agency）。1991年10月1日，作為空軍情報機構重組的一部分，它成為「空軍情報支援局」（Air Fortelligence Suppency）。
空軍情報支援局於1993年10月1日被撤銷，2001年2月1日作為一個外勤行動局——空軍情報局外勤局——重新啟用。它的總部位於華盛頓特區的阿納卡斯蒂亞-波林聯合基地，共擁有124名僱員。外勤局的任務是「提供情報、特別安全服務和成像情報」，同時分析外國空軍和空軍防禦戰術。該局還特別關注「與非法活動有聯繫或可能對美國造成威脅的外國民用航空相關的機構和設施」。空軍情報局外勤局於2014年10月1日被撤銷。
1991年重組的第二主要部分是「空軍情報司令部」（Air Fortelligenand）的成立，將電子安全指揮部（Eleic Security and）、空軍系統指揮部的外國技術處（Fn Teology Division）、空軍特種行動中心（Air Force Special Activities ter）和空軍情報局的其他一些部門合併為一。最終，空軍成立了一個類似於陸軍情報與安全司令部的機構，將信號情報行動與情報編製和人力情報職能統一綜合在同一個部門。同陸軍情報與安全司令部一樣，空軍情報司令部在距其總部非常遠的地方設立了一個中心，使用自己的偽裝名稱，編製科技情報。除完成負責情報的助理國防部長授權加強情報工作，滿足國會諸多監督委員會以外，空軍情報司令部受命提供「高價值的情報，支持履行作戰職責的戰區指揮官」。這個新的司令部還負責向國家情報機構提供空軍支持。
1993年10月1日，空軍情報機構進行了另一次重組。1993年6月15日授權發布美國空軍計畫行動指令93-8，「重組美國情報機構」，以及詳細的空軍方案計畫93-01，「建立空軍外勤行動局」。根據新的方案，空軍情報司令部成為空軍情報局（Air Fortelligence Agency）。非技術性的人力情報行動移交給國防部人力情報局。另外，空軍情報司令部其他餘下的部門也進行了內部改組。2001年2月1日，空軍情報局作為一個重要的附屬部門重新劃歸「空中作戰司令部」（Air bat and）指揮。
1997年8月，空軍情報局共有超過1.6萬名軍官和文職人員，分散在包括得克薩斯州的凱利空軍基地在內的95個辦公地點。到2006年初，該局人員數量降至12070名。之後，2007年6月15日，空軍情報局成為「空軍情報、跟蹤和偵察局」（Air Fortelligence, Surveilland Reaissance Agency）。除名稱不同外，新機構與原空軍情報局的區別主要有兩個。空軍情報、跟蹤和偵察局，是由一個以信號情報為中心的機構，改組轉變成一個將重中之重落實在地理空間情報、圖像、人力情報和信號情報的機構。另外，與空軍情報局不同，空軍情報、跟蹤和偵察局不屬於空軍作戰司令部的附屬機構，而是直接向空軍負責情報/跟蹤/偵察的副參謀長彙報。到2014年5月，空軍情報、跟蹤和偵察局擁有16511名工作人員，部署在全世界大約75個站點。
2014年10月1日，空軍情報、跟蹤和偵察局被解散，改組為ISR司令部——此舉2006年就已被提出。新成立的空軍第25聯隊，總部也設在聖安東尼奧—拉克蘭聯合基地（Joint Base San Antonio-Lad），吸納了空軍情報、跟蹤和偵察局所屬情報搜集支隊（第480 ISR支隊和第70 ISR支隊），以及空軍作戰司令部的兩個空中偵察部門。空軍作戰司令部現在是空軍第25聯隊的直屬上級司令部。「空軍技術應用中心」（Air Force Teical Applicatioer，原屬於空軍情報、跟蹤和偵察局）和「空軍鎖定目標中心」（Air Force Targetier）也轉歸空軍第25聯隊指揮，並計畫將其改組成鎖定目標和分析支隊。
第480 ISR支隊，擁有5000多名工作人員，總部設在弗吉尼亞州的蘭利-尤斯蒂斯聯合基地，在諸多基地擁有下屬部隊：喬治亞州的戈登堡（第480大隊）、蘭利-尤斯蒂斯（第497大隊）、加利福尼亞州比爾空軍基地（第548大隊）、夏威夷珍珠港（第692大隊）、德國拉姆斯坦空軍基地（第693大隊）和韓國烏山空軍基地（第694大隊）。該支隊的任務是「搜集、處理、發掘利用和分送ISR數據」，這些數據是通過多種空中情報資源獲得的，包括U-2偵察機、RQ-4全球鷹無人機（RQ-4 Global Hawk）、MQ-1捕食者無人機（MQ-1 Predator）、MQ-9收割者無人機（MQ-9 Reaper）和MC-12以及其他飛機。
第70 ISR支隊，總部設在馬里蘭州的米德堡，在許多基地擁有下屬部隊：日本三澤的第373大隊、聖安東尼奧-拉克蘭聯合基地的第543大隊、科羅拉多州彼德森空軍基地的第544大隊以及駐紮在米德堡的第659大隊和第707大隊。第70 ISR支隊是空軍的密碼支隊，在「世界範圍執行實時信息情報搜集和信息保障任務」。它所屬的第373大隊，在日本三澤和阿拉斯加州的埃爾門多夫-理查德森堡聯合基地有執行分隊，向美國作戰指揮官、聯合和特種部隊司令部以及國家情報機構和國防部高層「提供決定性至關重要的作戰情報」。駐紮在米德堡的第659大隊負責指揮管理的情報中隊（第5中隊、第37中隊和第41中隊），代表著美國空軍最初的網路使命部隊，隸屬於美國網路司令部網路使命部隊（Cyber and Cyber Mission）一部分。
第70 ISR支隊所屬的