宗吾的另一研究對象，更是「性靈與磁電」的問題。這個問題，仍是他對於「心理與力學」研究的繼續，也可說是他思想發展的極致。他自從傾向「性惡論」，大膽的提出「面厚心黑」之說，仍是在「人性論」上作繼續不斷的研究，在研究的過程中，也不僅否認了「性善說」，亦同時否認了「性惡說」；至於「性善惡混說」，「性有善有惡說」，以及「性有三品說」，他也完全否認了。以後他發現人的心性，無所謂善，亦無所謂惡，但是卻有一種「力」，此「力」能推能引，與物理的現象並無不同，於是而有「心理與力學」一書之作。時至今日，他更創一假設：人的性靈，從地球的磁電轉變而來。「如果這一假設，將來得到確切的證明，則可有科學與玄學之爭，唯物唯心之爭」，就成為徒然多事了。但他為學力和年齡所限，不能把這一假設，予以確切的證明，這是他無可奈何的事。他曾親自對我說過，他只能用「想當然耳」的說法，寫成性靈與電磁這一文，讓今後的學者或推或證成好了。那篇文章的概要如下：
他以為物質不滅，能力不滅，是科學上的定律。依此理，吾人一死，身體即化為地球上的泥土，同時性靈亦當化為地球中的磁電。如此則肉體性靈，生有自來，死有所去，而物質不滅，能力不滅之說，就可以講得通了。世言人能成仙成佛，或許是用一種修養力，能將磁電凝聚不散的原故。又有說「冤魂不散」者，當是一種嗔恨心，能將磁電凝住；及至冤讎已報，嗔恨心消失，磁電無從凝聚，其鬼即歸消滅。
有了「性靈由磁電轉變而來」這條假設，則靈魂存滅問題，也就可以解答了。吾人一死，身上的物質歸還地球，靈性化為磁電，則靈魂即算消滅；但是吾身雖死，而質尚存，磁電尚存，亦可說是靈魂尚存了。莊子所說：「天地與我並生，萬物與我為一。」或許是這個道理。
禪家最重「了了常知」四字。吾人靜中，此心明明白白。及至事務紛陳，此明明白白之心，即消歸烏有。學力深者，事務紛陳，此心仍可明明白白，是謂「動靜如一」。但是白畫雖明明白白，夜晚夢寐中則復昏迷。學力更深者，夢寐中亦明明白白，是謂「寤寐如一」。學力極深者，死了亦明明白白，是謂「死生如一」。到了死後亦明明白白，則即說是靈魂永存，亦未始不可。
楞嚴經說：「如來從胸卍字，湧出實光，其光昱昱，有千百色，十方微塵，普佛世界，一時剋編。」這種寶光，當即是電光。阿難白佛言：「我見如來，三十二相，勝妙殊絕，形體映徹，猶如琉璃。嘗自思維。此相非是欲愛所生。何以故？欲氣蠹濁，腥臊交遘，膿血雜亂，不能發生勝淨妙明，紫金光聚。」這是說釋迦修養功深，已將血肉之軀，變而為磁電的凝聚體了，故能發出寶光，遍達十方世界。佛氏有天眼通天耳通之說。現在無線電發明，已可證明這種道理。釋迦本身，即是一具無線電台，將來電學進步，或可證明佛經所說，一一不虛，這「性靈由磁電轉變而來」的假設，或亦可以證實了。
老子言道，屢以水為喻；佛氏說法，亦常以水為喻。我們不以空氣為喻，所謂不生不滅，不垢不淨，不增不滅，無古今，無邊際，無內外，種種現相，空氣是備了的。倘再進一步，以中和磁電為喻，尤為確切。若更進一步，假定「人的性靈，由磁電轉變而來」，用以讀佛老之書，覺得處處迎刃而解。
吾人自以為高出萬物，這不過人類自己誇大的話，實則人與物，同是從地球生出來的，身體的元素，無一非地球中的物質。自地球看來，人與物並無區分，彷彿父母生二子，長子曰「人」，次子曰「物」，不過長子聰明，次子患癱病而又聾啞罷了。人身的物質，和地球的物質，都是電子構成的。吾人有靈魂，地球亦有靈魂；地球的靈魂，就是磁電。通常所說的地心吸力，即是磁電吸力的表現。地球的物質變為植物，同時地球的磁電即變為植物的生機。吾人食植物，物質變為吾身的毛髮骨肉，同時磁電即變為吾人的性靈。由泥土沙石，變而為植物。變而為毛髮骨肉，愈變愈高等；同時由地球的磁電，變而為植物的生機，變而為吾人的性靈，也是愈變愈高等。雖經屢變，而本來的性質仍在，所以吾身的元素與地球的元素相同，心理的感應與磁的感應相同。惟是既經屢變，吾身的毛髮骨肉，與地球的泥土沙石不能無異；吾人的性靈，與地球的磁電不能無異。何以故？在地球為死物，在吾身則為活物。所以用力學規律來看察人事，就當活用，不能死用。
老子說：「有物混成，先天地主，寂兮寥兮，獨立而不改，周行而不殆，可以為天下母，吾不知其名，字之曰道，強為之名曰大。」老子所說的「道」，即釋氏所說的「真如」。釋說：「山河大地，日月星辰，內身外器，都是由真如不守自性，變現出來的。」其說與老子正同。真如，空無所有也——實則非空非不空；老子所說的道，也是如此。忽然真如不守自性，變現為中和磁電，由是而變現為氣體，迴旋於太空之中，幾經轉變，而山河大地，日月星辰，就依次生出了。由是而生植物，生動物，生人類。佛氏所說「阿賴耶識」的狀態，與中和磁電的狀態最相似。此二者都是沖漠無聯，萬象森然，也即是寂然不動，感而邃通。我們可以說：真如變現出來，在為中和磁電，在人為阿賴耶識；猶之同一物質，在地球為泥土沙石，在人則為毛髮骨肉。今人每謂人之性靈，與磁電迥不相同；猶之無科學知識的人，見了毛髮骨肉，即說與泥土沙石迥不相同是一樣。中和磁電，是真如最初變現出來的，真如不可得見，我們讀佛老之書，姑以中和磁電，模擬「道」與「真如」的狀態，也可得其彷彿了。
我們假定：「人的性靈，由磁電轉變而來。」則佛的諸多說法，與夫宋儒所謂：「如魚在水，外面水便是肚裡水，魚肚裡的水，與鯉魚肚裡水只是一樣。」明儒所謂：「盈天地皆心也。」等等說法，都可不費煩言而解。中庸說：「喜怒哀樂之未發，謂之中。」六祖說：「不思善，不思惡，正恁麼時，那個是明上座本來面目。」廣成子說：「至道之精，竊竊冥冥，至道之極，昏昏默默。」莊子說：「心不憂樂，德之至也，一而不變，靜之至也。」這都是阿賴耶識的現象，也即是磁電中和的現相。中和磁電發動出來。呈相推相引的作用，而紛紛紜紜的事物就起來了。所以要研究人世事變，當首先造一臆說曰：「人的性靈，由電轉變而來。」但研究磁電，又離不得力學，於是更造一臆說曰：「心理依力學規律而變化。」有了這個臆說，紛紛紜紜的事物，才有軌道可尋；而世界紛歧的學說，也可以匯歸為一。