查士丁尼在首都和行省曾經興建了許多工程，只是規模較小無法持久而已。要是對經得起時間考驗的建築物詳加介紹，也應該對不知名的部分稍加描述。 僅僅在君士坦丁堡和鄰近的郊區，他就修建了25座教堂，將之奉獻給基督、聖母和聖徒，大部分裝飾著黃金和大理石。這些教堂精心選擇不同的地點興建，有的在人煙稠密的廣場，有的在風景優美的樹林，或是位於海岸的邊緣，或是位於能夠俯瞰歐亞大陸的高聳台地，。君士坦丁堡的聖使徒教堂和以弗所的聖約翰教堂，外表看來取法於相似的模式，圓頂仿照聖索菲亞教堂的頂樓，不過聖壇刻意被安排放在圓頂正下方，位於4個寬廣柱廊的交會處，更能精確呈現希臘十字架的形象。耶路撒冷的聖母可能會因為安身於一座由她的皇家信徒建造，位於一個既沒有適用的地面，也無法為建築師供應材料的艱難之地的教堂，而感到心滿意足。教堂位於一個平台上，是把深谷的一部分填上土方，直到與山頂同高。在附近採石場把石塊鑿成規定的形狀，每一塊石磚裝在一輛由40頭健壯的牛才拉得動的大車上，拓寬道路以運送最重的建材。黎巴嫩供應高聳入雲的雪松作為教堂的棟樑，同時人們恰好發現紅色大理石的礦脈可以製造美麗的石柱，其中有兩根用來支撐門廊，估計尺寸在全世界都首屈一指。
皇帝出於虔誠的慷慨施捨遍及整個聖地，如果查士丁尼為男女僧侶興建和修復很多修道院，就理性而言可以給予譴責，那麼他為救助疲憊的朝聖者，開鑿水井和設立醫院，這種慈善行為一定會受到稱讚。分裂主義盛行的埃及被排斥在皇家的恩典之外；敘利亞和阿非利加則獲得若干賑濟，可以紓解戰爭和地震給人民帶來的災難；迦太基和安條克能從一片焦土中恢複生機，必然尊重仁慈的恩主。 教會時曆書上列名的每位聖徒，幾乎都獲得了興建教堂的榮譽，帝國每一座城市都享有實質性的好處，像是興建橋樑、醫院和供水渠道。然而這位國君的慷慨有其嚴厲的一面，絕不會縱容臣民沉溺於浴場和劇院的奢華享受。
就在查士丁尼致力於公眾服務的時候，他也未曾忘懷維持自己的尊嚴和舒適。拜占庭皇宮被大火摧毀，修復以後顯得煥然一新，更加富麗堂皇。有些人認為從它的前廳或大堂就可以一窺全貌，這個前廳就其大門或屋頂的形式，可以稱為凱爾瑟廳或銅廳。寬廣的正方形基座上面架著圓形屋頂，下面用很多石柱支撐，地面和牆壁上鑲嵌著各種顏色的大理石，如拉科尼亞的綠玉色、弗里吉亞的火紅色和白色，裡面還顯現出深藍色的紋理。圓頂和周圍有馬賽克拼成的圖畫，表現出阿非利加和義大利作戰凱旋的光榮事迹。在普洛蓬提斯海對面的亞洲海岸，離東邊的卡爾西頓不遠，建造有豪華的赫拉烏姆宮殿和花園，供查士丁尼特別是狄奧多拉避暑之用。當代的詩人對於自然和藝術的結合、林木、噴泉和海浪的和諧，這些前所未見的美景真是讚不絕口。然而，伴隨宮廷前來的大批侍從人員都抱怨居住十分不便。就是山林女神也因受到波菲利奧的騷擾而驚慌不已，這條極其有名的鯨魚寬10肘，長30肘，為害君士坦丁堡海域達半個世紀以後，終於擱淺在桑格里斯河口。
查士丁尼倍增歐洲和亞洲的防衛力量，不過這種怯懦和無效的準備工作重複進行，把帝國的弱點暴露在一位哲學家的慧眼之中。 從貝爾格萊德到黑海，從薩沃河的匯流處到多瑙河河口，有80多處守備的據點連成一道防線，沿著這條巨川的河岸向前延伸。單獨的瞭望塔被改建為寬大的城堡，在原來空虛無人的城市，工程人員按照地形的需要，將城牆加以縮小或擴大，用遷移的僑民和派遣的守備部隊充實人口數量。在圖拉真過去建橋的遺址上 ，現在建起了一座堅固的堡壘，並且受到嚴密的防衛，有幾處軍事駐地已經越過了多瑙河，用來展現羅馬的威名。但是這種做法適得其反，不能達成懾人的效果。蠻族每年入侵時，帶著藐視的神情穿越這些無法發揮作用的防衛工事，帶著掠奪的戰利品歸去。邊疆的居民不能依賴正規的防務獲得庇護，被迫保持毫不鬆弛的警戒，用自己的力量防守分離的居留地。位置偏僻的古老城市在各方面加強工事，查士丁尼新設立的基地雖然建造時間短暫，卻仍想要獲得固若金湯和人煙稠密的美譽。
虛榮心極重的君王把自己的出生地視為「至福之所」，加以百般照顧和尊敬。在「查士丁尼特區」的稱號之下，名不見經傳的小村落陶里西烏姆，成為大主教和統領的所在地，管轄的區域包括伊利里亞7個戰事頻仍的行省。 後來龍興之地以訛傳訛被稱為朱斯廷迪爾，位於索菲亞以南20英里，現在是土耳其一個行政區的首府。 皇帝為了衣錦榮歸，很快在鄉親面前建造起一所主座教堂、一座宮殿和一條供水渠道，以及許多公眾和私人的建築物，使得這座皇家城市更為宏大。同時也修築起堅固的城牆，縱觀查士丁尼在位期間，多次阻擋住匈奴人和斯拉夫人無攻城能力的襲擊。達契亞、伊庇魯斯、色薩利、馬其頓和色雷斯所屬各行省，建立無數的城堡，看上去滿布整片國土，能夠遲滯蠻族的行動，使得南下牧馬大肆剽掠的願望落空。皇帝曾經整建或修復了600多座此種類型的守備據點，絕大部分的據點都是方形或圓形，中間僅有一座石塊或磚頭砌成的高塔，四周圍繞一道城牆或壕溝，在最危急的時候，對鄰近村莊的農人和牲口提供相當的保護。 雖然這些軍事工程已經耗盡國家的財源，但還是無法讓查士丁尼和歐洲的臣民感到放心，不再憂慮蠻族的進犯。
安基阿盧斯的溫泉位於色雷斯，非常安全，可以作為療養的聖地；帖撒洛尼卡富饒的牧場受到西徐亞人騎兵部隊的蹂躪；坦佩風景優美的谷地，離多瑙河有300英里遠，不斷傳來殺伐的聲音使人驚惶不已。 只要是不設防的地點，無論距離多遠或多麼偏僻，都無法享受和平的生活。溫泉關 的隘道看上去像是可以保護希臘的安全，但是縱觀歷史常常讓人失望，查士丁尼倒是盡最大努力來加強。他修建了一道堅固的邊牆，從海岸的水際穿過森林和山谷，抵達遙遠的色薩利山區一直修到絕頂，佔領所有可用的通道，還派遣一支2000士兵的守備部隊，替代原來倉促召集的農夫，沿著修建的防壁駐紮，並設置穀倉和貯水池供應官兵的需要。也許這麼說有「馬後炮」之嫌，這種準備工作只能激起士兵畏戰的心理，修建舒適的堡壘不過便於部隊的後撤罷了。科林斯被地震摧毀的城牆，以及雅典和普拉蒂亞倒塌的堡壘，都被很仔細地加以修復，蠻族為可想見的曠日持久且痛苦的圍城戰所勸退。科林斯地峽在強化了防禦力量以後，伯羅奔尼撒那些沒有城牆的城鎮也得到掩護。
歐洲的終端位置還有另外一個半島，通過色雷斯·切森尼蘇斯，大概花3天行程就能到達海邊，與對面的亞洲海岸形成赫勒斯滂海峽。半島這一部分有11個人口眾多的市鎮，到處都是高聳的森林、美好的草原和耕種的農田。過去有一位斯巴達將領，曾在長達37個斯塔迪亞或弗隆 的地峽上面設防，時間是查士丁尼統治之前900年。 那是一個崇尚自由和英勇的時代，非常簡陋的防壁或許也可以使其免遭突然的襲擊。普羅科皮烏斯對古代的作戰優勢並不清楚，所以他讚許這道城牆，說它不僅構建結實，而且有兩道胸牆，兩邊的護壁一直延伸到大海。但如果不是每個城市，尤其是加利波利和塞斯圖斯，都有特別的防護措施來保障安全，那麼這道城牆的強度仍不足以防衛切森尼蘇斯整個地區。他們用強調的口吻把它稱為「長城」，這項工程就興建的目的而言是一種恥辱，只是執行的成效使它獲得讚譽。
首都的富裕會影響到鄰近的地域，君士坦丁堡城區真是得天獨厚，自然的美景中裝點著元老院議員和富有市民豪華的花園和別墅。這種財富對大膽和貪婪的蠻族產生了莫大的吸引力，最高貴的羅馬人處在和平的怠惰環境，成為西徐亞人的階下囚。他們的君王從皇宮裡看到烽煙四起，大火即將蔓延到皇家城市的城門。阿納斯塔修斯被迫要建立最後的邊疆，距離皇宮已經不到40英里。他的長城從普洛蓬提斯海到黑海長達60英里，等於是正式宣告現有的武力已不足恃。在大難臨頭的緊急狀況下，明智的查士丁尼用不屈不撓的精神，增建堡壘和工事，構成新的防線。