當8月2日，約翰·馬丁教授宣布成功驗證人類第一個人工核實驗的時候，孫元起早已經結束在紐約的活動，來到了聞名遐邇的耶魯大學。
近代中美高等教育交往史，可以追溯到19世紀30年代，而耶魯在其中首開先河。在19世紀到中國淘金的洋人中，美國公理會傳教士、後來當了美國駐華公使，回國後擔任耶魯漢學教授的美國人衛三畏是其中的一個，他1833年來華，1877年返美，在中國呆了40多年，其著作《中國總論》被美國各大學採用作中國史課本，幾乎達一個世紀之久，是美國人研究中國的必備書，前後幾次再版，影響了幾代美國人的中國史觀；另外一個是被稱為「在中國創辦西塾之第一人」的布朗，他於1832年從耶魯大學畢業後，到當時屬我國廣東省的澳門，在那裡一所由英國傳教士創辦的學校——瑪禮遜學校中擔任校長。1847年，布朗返美時，將容閎等3名中國優秀學生帶往美國求學。1850年，容閎考取耶魯大學。1854年，耶魯大學向容閎頒發學士學位，成為在西方獲得該學位的第一位中國人。
除容閎外，詹天佑、馬寅初、晏陽初、孔祥熙、高尚蔭、顏福慶、李繼侗、楊石先、施汝為、陳嘉、王家楫、唐耀、楊遵儀、應開識等一大批中國的傑出人才也先後在耶魯大學學習。目前，中國學生是耶魯最大的外國留學生團體，以至於現任校長理查德·萊文不無感慨地說：「失去中國學生，耶魯將黯然失色。」
在耶魯300周年校慶的一份宣傳冊中有這樣一段話：「200年來，耶魯大學一直與中國保持著友好的關係，這種深厚的感情、悠久的歷史，在中美文化交往中發揮了獨特的作用。由耶魯和中國共同建立的教育事業和學術成果，發揮了巨大的作用和凝聚力，它不僅豐富了耶魯大學的全面發展，而且改變了無數校友的命運與前途。耶魯與中國的關係，不僅是該校有史以來最早的國際性接觸，在耶魯大學將跨入第四個世紀的時刻，仍然至為重要。」
因為之前，孫元起從來沒有到過耶魯大學，只在影視作品中覷過幾眼，不說對於耶魯大學，就是其所在的紐黑文市也陌生得緊。所以，孫元起對耶魯大學校友會的麥克·唐納森先生表示，自己對於耶魯「很熟悉」，並不需要耶魯大學迎接，而且自己的行程不太確定，自己到達紐黑文市之後，會與校方聯繫的。
就這樣，孫元起先在紐約的時候，就大致了解了一下耶魯的情況，又提前到達紐黑文市，以「需要休息」為名，熟悉了周邊的環境，總不至於到時候鬧出大笑話來。
在耶魯及其周邊走了兩天，孫元起有了些底氣，才發了份電報給耶魯大學，表示自己已經抵達了紐黑文，希望能夠與校方接洽。
很快，麥克·唐納森先生陪著幾個人來到了孫元起下榻的旅社。
唐納森先生很熱情地向孫元起介紹了幾位來客：「約翰遜先生，這位是耶魯大學校友會副會長，梅斯·傑拉德先生。」
「你好，見到你非常高興，尊敬的梅斯·傑拉德先生。」孫元起很熱情地說道——至少要裝作很熱情，然後握手。
「我也是。」這位傑拉德先生的衣著非常正式，有一種英倫紳士的派頭。
「這位是校長助理賈斯汀·霍夫先生。」
嗯，這是一位三十歲左右的年青人，一看就是年輕有為，並且受過良好的教育。也是問候，握手。
「這一位是我們學校物理學教授約翰·艾克斯先生，你們應該見過。」唐納森先生介紹最後一位客人。
我見過？我見過才是有鬼呢！現在整個的耶魯大學，我就認識你們這幾位而已，而且還都是剛認識不久的！孫元起腹誹道，可嘴裡不那麼說：「是的，我見過您，艾克斯教授，您的課程非常棒。」
艾克斯教授眨了眨藍色的眼睛，一臉困惑：「約翰遜教授，您聽過我的課么？」想了那麼幾秒，然後撓了撓凌亂而花白的頭髮：「我實在記不清了，你們知道，在我眼裡，所有的東亞人都長著一個模樣，黑眼睛，黑頭髮，黃皮膚……什麼中國人、日本人，沒什麼區別的。」
這見面的事情就算揭過去了。
大家坐定以後，孫元起避免他們提到一些令自己措手不及的問題，開始主動發問：「我很高興重新回到紐黑文，回到我的母校耶魯。但是由於行程緊促——我前不久，剛接到加拿大麥吉爾大學的電報，希望我能在九月初到該校出任講座教授，我答應了他們。在此之前，我還要到MIT一趟——所以，我想我可能只有兩周左右的時間。我想聽聽你們的安排，或者說意見？」
年青的校長助理，賈斯汀·霍夫先生臉上帶著矜持的微笑：「首先，歡迎約翰遜教授回到母校學習交流，您所取得的成績，驗證了我們的校訓『光明與真理』。你是母校的光榮。至於您說的安排，學校和校友會大致草擬了一份日程表，如果有時間，我們可以就此進行討論與修改，以便於您的行動。」
說完，從隨身攜帶的文件夾中抽出五份裝訂好的日程表，自己留下一份，然後很恭敬地分發給在座的各位。
「如果大家沒有意見的話，就現在討論，怎麼樣？」孫元起現在閑著也是閑著，倒不如先安排好日程，然後趁著空閑準備幾篇論文、繼續編寫未竟的教科書，還要搜羅一些大、中、小學的教材，等以後回國用的上。
大家都沒有反對孫元起的提議。不過，從各個人拿到日程表的反應可以看出，他們似乎對於裡面的內容了如指掌；只有孫元起，打開日程表仔細的閱讀。一旁，霍夫先生詳細介紹每項活動的具體情況：
「約翰遜教授，你是不是需要休息一下？……不需要？那好吧，所有的安排就從明天開始。」
「明天上午，主要是把你的學籍檔案整理一下，重新頒發給你學位證書，到時候會有……下午，主要遊覽校園，活動安排有……
「後天上午，校友會安排了一個面向全校師生的演講。你知道一位年青有為的校友，會給在校的學弟們樹立一個良好的榜樣，鞭策他們在學校和社會上更好地服務……」
「從7月25日開始，會有一個長達兩周的研討會，當然，時間長度可以由你自由掌握和調整。研討會具體事宜，會由艾克斯教授與您你洽談……」
「最後一天，校友會有一個歡送晚宴，希望你能夠參加……」
「大致安排就是這些，您有什麼疑問么？」
孫元起看了一回日程表，覺得張弛有度，給自己留下足夠的時間，並不會太過疲倦，便點點頭：「霍夫先生，您的安排非常完美，我沒有任何疑問。」頓了一下，轉過頭對艾克斯教授說：「艾克斯老師，如果可以的話，您能向我介紹一下有關研討會的細節嗎？」
「好的，約翰遜教授。」年近六旬的艾克斯教授很有「達者為師」的胸懷，所以對於面前只有二十多歲的孫元起給予了足夠的尊重：「我們從最近的學術期刊上發現，你對於物理、化學等自然科學的研究，走在世界的最前列，所以本次研討會的成員主要是耶魯大學自然科學各系的教員、研究生，以及部分優秀的本科生，希望你能夠用兩周左右的時間，向他們介紹最新的科學發展情況。研討會採用開放式討論的形式，每次由你提前選定課題和提綱，大家回去準備兩天，然後在課上討論。當然，研討會由你主講。每次大概兩到三個小時。——如果可以的話，我今天就想得到第一次討論的課題。」
孫元起望著直爽的艾克斯，覺得這位老先生真是一位純粹的學者，當下起身，從隨聲的書包中取出前幾日在美國化學會演講時準備的提綱，遞給他：「這是提綱，應該夠兩次以上討論使用，如果要確定課題的話，第一次叫『原子結構』，第二次叫『化學反應原理』。」
艾克斯點點頭，鄭重地收好講稿。
這樣，本次見面已經到了尾聲，一直沒有說話的梅斯·傑拉德先生突然說道：「約翰遜教授，您在紐黑文市的花銷將由耶魯大學校友會負責。研討會的薪金，將按每小時100美元的標準支付。」
哦！原來這位是買單的。
按照中國人的習慣，此時應該說：「哎呀，怎麼能讓你破費呢？多不好意思！」不過孫元起從舊金山大學開始的時候，就開始由各個單位負責食宿；等到了紐約，美國化學會除了負責食宿花銷，並在演講結束以後，按照時間付給了一筆不菲的費用。現在，耶魯不過循例而已，孫元起還有什麼好說的呢？所以，只需要說一句「謝謝」便好。
之後，一切事情都很順利：第二天，也就是7月23日，耶魯大學頒給孫元起理學碩士學位證書，換句話說，孫元起搖身一變，成了耶魯根正苗紅的畢業生。7月25日，孫元起在耶魯大學的第一場研討會ecticutHall在順利舉行。ecticutHall建於1750年，坐落於OldCampus中，是耶魯大學最古老一幢建築，具有典型的喬治亞風格。現在，一個中國人在這個講堂里，面