在海上航行了半個月，終於到達了本次航程的終點：舊金山，也稱三藩市、聖弗朗西斯科。
在下船的時候，有美國的海關人員檢查。見是金髮碧眼的，手一揮，便放行了；如果是黃皮膚、黑眼睛的，則全都帶到另外一間屋，要細細審查。孫元起有美國公使館的證明，又有耶魯、MIT、美國化學會的邀請信件，自然不懼怕他。那海關人員看見比自己還高些的孫元起一臉輕鬆地走到他面前，上下掃視一眼，又看見手裡捏著幾份英文證明之類的。本來想說什麼，最終什麼也沒說，揮揮手，把孫元起放行了。
拖著行李，剛走出碼頭，就見外面圍著一群接人的，舉著各種寫著名字的牌子。咦，那麼怎麼有自己的名字？一個大紙牌，上面寫著「YorkJohnson」，下面是歪歪扭扭的中文「孫元起」，牌子下面圍著幾個人，其中一個赫然是盧瑟福。
盧瑟福和幾個人一邊聊天，一邊盯著碼頭的出口。就見有一個人沖著這邊兒揮手，定眼看時，不是孫元起是誰？看見孫元起穿著西服、襯衫，打著領帶，盧瑟福瞪得眼珠子都快掉出來。
這群人中就盧瑟福見過孫元起，見盧瑟福這副吃驚的模樣，都順著他的視線往前看，卻見一個約略一米八的英俊小夥子走了過來，穿著西服襯衫，打著領帶，皮膚白皙，嗯，髮型蠻奇特的。神情間有些憂鬱，還有一股書卷氣，像是一位在校的大學生。如果不是面部輪廓出賣了他，絕對不會有人懷疑他是來自美國的某所高校。
待走近了，盧瑟福使勁揉揉眼睛，才試探著問：「請問，你是York么？」
「是的，盧瑟福先生。」孫元起笑了出來，伸出右手，「非常高興再次見到你！」
盧瑟福頓時跳起來，一把抱住孫元起：「York，真是你啊！你的變化是如此的大，以至於我都不認識了！」
孫元起和盧瑟福熱烈擁抱之後，才解釋道：「所謂『入鄉隨俗』，現在到了美國，少不得要做一些改變。對了，你怎麼來了舊金山？」
「我接到你的電報，知道你六月份要到美國，從遠東到美國每月只有一兩班船，想來你乘坐就是六月中旬的這一艘——去年我搭乘的就是這一班呢。」盧瑟福說，「正好麥吉爾大學快放暑假了，我也沒什麼事兒，便來了。」
「謝謝你！」孫元起怕冷落了他的同伴，便提醒他說：「你還沒有介紹你的朋友呢。」
盧瑟福拍拍頭：「我一高興，差點忘了！這些都是我剛剛認識的，我們都有一個共同的工作，那便是接你。與其我說，不如大家自我介紹吧？」
最先介紹的是一位四十歲的中年人，看樣子就是標準的美國學者：「這位是約翰·馬丁，來自加大伯克利分校，是位著名的化學教授，同時也是美國化學會西部分會的副會長。我叫戴維·林特，舊金山大學的化學教授，美國化學會西部分會秘書。」
約翰·馬丁大約五十歲，有些拙於言辭，聽了戴維的介紹，連忙擺手：「我只是一名普通的化學老師……」
孫元起主動和他們握了握手。在和馬丁教授握手的時候，馬丁教授還有些吃驚：「你便是寫《化學原理》的YorkJohnson么？真是令人不敢相信的年青！」
「《化學原理》？」孫元起有些迷惑。
盧瑟福在一邊解釋道：「就是你給我的《從原子、原子結構到元素、元素周期表、分子及化學反應本質》，名字實在太長，所以再版的時候，只好改名《化學原理》。」
戴維很有學者風度，握手的時候大致介紹了他們的目的和計畫：「約翰遜先生，上月底的時候，美國化學會接到您的電報，知道你應邀於本月來訪，特於本月初致電我們西部分會，希望安排接待事宜。我們西部分會對於先生的到來，感到十分的榮幸。拜讀先生大作的會員，強烈要求學會能夠安排先生一場演講，讓先生能夠給我們介紹一下您對化學原理的認識，希望先生能夠撥冗俯允。」
孫元起有些無奈，自己對於化學認識也就局限於研究生以前所學，而自己的專長物理似乎不為人所重：「好的，那是我的榮幸！」
接下來的是耶魯大學的一位年青人，也不能說年青，估計有三十多歲：「你好，約翰遜先生，我是耶魯大學校友會的麥克·唐納森，歡迎你從遙遠的遠東來到美利堅，來到耶魯大學。」
孫元起一鞠躬：「感謝『母校』！感謝唐納森先生！」
最後兩位，想必是來自MIT的，是一位四五十歲的中年，帶著個十七八歲的少女，只是不知道是他的女兒還是學生。中年人自我介紹道：「很高興見到你，約翰遜先生。我是MIT理學院的梅克斯·羅西，這是我的女兒艾琳娜·羅西。」
「見到你們很榮幸，羅西先生和美麗的羅西小姐。」孫元起和他們一一握手。
那位十七八歲的少女眼睛裡充滿了好奇，但初次見面的陌生還是阻礙了問一些奇怪的問題：「見到你很高興，約翰遜先生。」
相互交談了一會兒，不外乎天氣、旅途之類無關痛癢的，又商量了一下接下來幾天的行程安排。按照計畫，孫元起在舊金山先休息一日，然後明天到舊金山大學講演一次，後天到距此不遠的加大伯克利分校休息，隨後一天再講演一次。這樣，就結束西部的旅程，乘坐火車到達東部紐約的美國化學會，並訪問康涅狄格州的耶魯大學和馬薩諸塞州的MIT。
計議已定，大家往外走，準備搭人力車。這時候，已經稍稍熟識的艾琳娜終於按捺不住自己的好奇心：「約翰遜先生，你真的是中國人么？」
「是的，我確信我是中國人！」孫元起從來沒有在這種問題上迷惑過。
「可是，你和他們看上去完全不一樣呀！」順著艾琳娜的手指，可以看見碼頭上來來往往扛著包裹的華人力夫，街邊等著拉客的華人車夫，街邊陰暗處蜷縮的華人乞丐——他們都拖著辮子，這一點很容易區別於其他的民族，「看！他們皮膚黧黑，身材矮小，拖著辮子，穿著長袍；而你，皮膚白皙，身材高大，短頭髮，西服、襯衫、皮鞋、領帶……完全不一樣！」
自鴉片戰爭以來，美國資產階級從中國誘騙走了大批的華工。這些華工在美國墾荒、修路、開礦，擔負著極為繁重的勞動，促進了美國的繁榮。在不少大城市形成了「唐人街」之類的華人聚居區，其中尤以舊金山華人最多。同治、光緒年間，美國發生經濟危機，美國資產階級為了擺脫困境，開始煽動排華。光緒二十年（1894），美國迫使清廷訂立了《限禁來美華工保護寓美華人條約》，對赴美華工作了種種苛刻的限制。美國各州也發布了各種排華法令，迫害華工、華僑的罪行愈演愈烈，使得華人求職就業受到極大限制，很多華人的店鋪被迫關門，使得華人生活日趨困苦。這些，作為理科生的孫元起自然不知道。當看到這群為了溫飽而艱苦勞作的同胞，就好像當初在大柵欄看見那一巷子難民一般，心中劇震。
羅西先生覺得女兒的話使得客人有一些難堪，便呵斥道：「艾拉，胡說什麼呢！……對不起，約翰遜先生，艾琳娜她年輕不諳事，請您能夠原諒。」
孫元起搖搖頭：「羅西先生，不用道歉的，羅西小姐說得都是實話。但即便如此，我依然是中國人！」說話的時候，心裡甚至有些後悔，為什麼在輪船上輕易剪去頭髮：雖然在其他列強的國度里，這個辮子被視為豬尾巴；可是在這些流落他鄉的華人眼中，同樣拖著一根辮子，又何嘗不是一種對自己國家和民族的肯定與認同呢？
當晚，孫元起住在舊金山大學的一棟別墅裡面，準備第二天的演講。
第二天，孫元起出現在大家面前的時候，奇怪的髮型已經不見了——昨晚，他找了個理髮師，把自己剪得狗啃一般的頭髮打理成標準的寸頭，而且他穿著長衫，而不是西服。雖然大家都覺得很驚訝，尊重他人的習慣是一個紳士應守的禮節，所以，也沒有人說什麼。
六月中旬的時候，美國的大學還沒有放假。孫元起在盧瑟福和戴維的陪同下走進會堂，看見周圍坐了不少的老師，更多的是學生。在舊金山，除了舊金山大學之外，還有舊金山州立大學等高校，不過化學教育的水平自然比不上加大伯克利分校。本來，孫元起不太清楚面對的對象，準備了面向普通學生、大學教授兩種方案。現在看來，昨晚的準備是有效用的。
來自本校化學系的戴維·林特教授自然是本次演講的主持人。他走上講堂：「今天，我們很榮幸邀請到來自遠東的著名化學家揚克·約翰遜教授來給我們介紹他的最新研究成果。約翰遜教授年輕的時候——當然他現在也非常非常的年青，足以讓在座的各位嫉妒——在美國留學，之後回到中國，創辦了IPRT，並發表了一系列有重大影響力的論文，在世界範圍內引起極大的反響，被譽為遠東自然科學研究第一人。最近，他應美國化學會、MIT、耶魯大學等學術單位的邀請，前來講學。在路過聖弗朗西斯科的時候，我們攔住了他，然後就