雖然形勢非常樂觀，但是呂大防依然還是非常小心謹慎的向前推進，並且讓投石機以南城門樓為中心，向兩側依次投下燃燒彈，以便將威脅通過城門洞宋軍的遼國弓箭手全部清除，降低宋軍靠近城門洞的風險。
尤其是遼軍在城門洞城門內側對宋軍進行阻擊的時候，呂大防甚至直接讓三門火炮對準城門洞內進行射擊，炮彈通過了城門洞後直接在城內爆炸，集中在城門內側密集的遼軍頓時損失慘重，受到了非常大的打擊。
錦州城內的遼軍所受到的打擊不僅僅是軍事上的重創，更重要的還是在於火炮的威脅——像投石機、神臂弩等武器這是遼軍對宋軍攻城時認識最為深刻的武器，相應的也有一定的解決辦法，但是對於火炮則完全超越了他們的認知，而且像燃燒彈、弩炮等武器他們也是頭一次見到，說到應對之法是完全沒有。
除了對火炮多少有些不是很適應之外，宋軍將領這次對錦州的攻城戰堪稱是宋軍的經典攻城典範。隨著呂大防和他的手下們不斷調整武器火力配備，各種攻城兵器相互配合之下，南門的戰鬥很快便要打破僵持的狀態，進攻城門的宋軍已經開始推進到城內了。就在這個時候呂大防終於叫副將將無心交給他的煙花號令點燃，向城內特種部隊發出攻擊信號。
城內的特種部隊在上午的攻城戰打響的時候便以小隊的方式集合起來，他們分成數個據點躲藏在城南的民居當中，在看到城外的信號後，他們立刻衝出自己的隱蔽點，然後對街上正在不停忙碌的遼軍大肆攻擊——像這種冷兵器巷戰他們是非常熟悉的，儘管在進城的時候無法攜帶長矛弓箭一類的兵器，但手持鋼刀的他們在近身作戰方面曾經受到過嚴格的訓練，突然襲擊之下就把對城內毫無防備的遼軍給打糟了。
當城內特種部隊在就近消滅前往支援南門的小隊遼兵後，他們很快便趕到了南門，針對南門城內側聚集起的大堆遼兵，他們將手中的手榴彈一次性扔到了正專心對付湧進城內宋軍的遼兵頭上。兩天前他們開始陸續化裝進入錦州城的時候，他們身上就攜帶了不少手榴彈，儘管手榴彈的體積並不是很大，但為了避免暴露自己被城門的遼軍發現，每個人只帶了一兩枚，像這樣的打法他們早就在西夏和大宋的戰場上試過很多次了，這次做起來也是非常順手。
從天而降的手榴彈給城內的遼軍當頭一棒，五百多枚手榴彈在南門城口這塊並不大的地方所造成的殺傷力是非常驚人的，一片一片的遼軍如同割麥子一樣還不知道怎麼回事便糊裡糊塗的被消滅了。而特種部隊趁著遼軍還沒有反應過來的當口，對這群遼兵進行了一次衝鋒，再給遼兵以巨大的殺傷後，整個南門城口的遼兵便在城內城外的宋軍夾擊之下開始崩潰了。
此時特種部隊也沒有戀戰，在看到遼軍防線崩潰後，他們便立即在一聲呼嘯聲中向後撤退了——他們身上的穿著有的是遼國百姓的服裝，有的是剛才在街頭偷襲遼兵後從屍體上拔下的遼兵服裝，他們唯一區別敵我的標誌便是手臂上幫著的白布帶子，不過向錦州城內攻擊的宋軍可不知道他們在城內的友軍長得什麼樣，為了避免誤傷，這支特種部隊在進城潛伏後便立刻籌謀了對策——一旦南門城口的遼兵戰線有崩潰的跡象後便立刻朝城內撤退。
特種部隊在撤出南門戰場後，便聚集在事先安排好的集合地點，在聚齊了大部分人後也沒有浪費時間，他們便立刻趕往城內的遼軍主將辦公的衙門——在戰場上正面與大軍相抗衡從來不是他們的作戰思想，生擒主將才是他們最重要的任務。不過在今天看來，想要完成這件任務並不是一件容易的事情——錦州守將已經開始想著逃脫了，當特種部隊成員趕到衙門後卻發現裡面已經是人去屋空，他們還是來完了一步，無奈之下便將衙門內部殘留的遼兵全部關押起來，守好衙門的大門和院落，換下自己的衣服後便等著城外的宋軍來接收。
攻佔錦州城前後不過花了一天的時間便順利完成，下午的時候宋軍大部隊進城後，城中的遼兵基本上就沒有什麼反抗的舉動了。剩下在城中的遼兵多是傷重者，凡是能夠跑的基本上都隨守將從北門逃竄了，就算無心在北門設伏沒有抓到錦州城守將，呂大防也並不擔心——這場戰鬥他們贏得太輕鬆了一些，原本呂大防在接到任務的時候說明只要進攻錦州引動遼國統治高層注意即可，能不能攻下錦州城對大宋來說並不重要，因為不僅是錦州，就是來州在距離上也超過了大宋的實際控制範圍。
大宋攻擊錦州暴露了跨海登陸作戰部隊已經深入遼國的事實，在軍事將領看來這種舉動完全是多餘的，況且錦州太遠了，這樣一來自己這十萬出頭的孤軍能夠在遼國的土地上生存多長時間就很難說了。攻打錦州能夠在一天之內結束戰鬥，這為呂大防謀划下一步的作戰計畫贏得了時間上的優勢，也使得宋軍的行動更加從容一些。
就在呂大防率軍匯合了城內的特種部隊開始對城內殘餘的遼軍進行清繳的時候，在城外三十里處一個叫伏龍溝的地方，無心率領兩千多特種部隊在這裡伏擊了錦州守將的殘餘部隊，這一仗跑了幾個遼軍雖然沒有盡數殲滅敵人，但非常幸運的活捉了遼軍錦州守將耶律拔，並且將其周圍的五千殘兵大部分殲滅。由於伏龍溝周邊都是森林，樹木茂密加上特種部隊對這一帶的地形並不熟悉，沒有辦法的情況下為了避免損失只有放棄了追繳其他殘軍的誘人想法。
跨海登陸作戰部隊對錦州城內的清繳還是依照來州的標準，對生活在這裡的遼國貴族財產盡數沒收，並且接管了對宋軍來說最為重要的糧倉和軍械倉庫。對於一支身處敵人腹地的孤軍來說，沒有什麼比補給更為重要的物資了，而宋軍佔領錦州後，錦州城內倉庫的「藏品」之豐厚還是讓宋軍倒吸了一口涼氣，接著便是喜出望外。
由於錦州是遼國通往東京道的必經之地，遼國東京道由於民族眾多，各族部落星羅棋布的遍布在整個東京道，更因為這些部落之間征戰不休，甚至有些部落對契丹人的統治地位也構成了相當大的威脅，這就迫使遼國在錦州建立了一個相當大的儲備倉庫，對駐守在東京道的部隊進行中轉補給。
光是糧食宋軍便獲得了十三萬石之多，而遼軍軍械庫中的藏品在宋軍眼中就很差強人意了，不過其中的箭支還可以拿來一用，並且宋軍還發現這個倉庫中有很多裝備是以前大宋的制式裝備，很可能是遼國買來後專門用來對付東京道的游牧民族所做存儲。
根據大宋統治高層所定下的章程，凡是大宋所攻下的城池，必須對城池內的非漢人富戶進行清繳，沒收其全部財產，而城池內屬於遼國政府的一切財物或者其他物資也都一律沒收。這個命令其實就是針對於跨海登陸作戰部隊所定下來的，而且主要針對的就是來州，因為大宋統治高層沒有想到在缺少傳統大型攻城裝備的跨海登陸作戰部隊能夠攻下除了來州以外的城池。
相對於來州，宋軍在錦州的收穫才是最為豐厚的——來州許氏一家獨大，城內很少有契丹貴族能夠有他們這樣的身家，在商業上的敵對態度使得當地的契丹人只有淪為為許家打工的角色，宋軍攻下了來州之後在這些契丹貴族身上沒有多少油水可撈，只是在那個來州知州的家中收穫還算過得去——許氏對來州的地方官吏可沒有少孝敬，因為遼國也有大宋的地方官吏輪換制度，所以宋軍也只能夠逮住這一任的地方官吏來放血。
錦州和來州不同，這裡生活的主要是少數民族和契丹貴族，城中的漢人雖然多，但富貴之家卻很少，這就給了宋軍一個動手的絕佳理由，連官倉到民倉，宋軍忙活了一天收穫頗豐——僅僅是黃金就不下兩萬兩，白銀也有四五十萬兩，弄得呂大防還以為錦州周圍是不是有個金銀礦呢。這些現成的黃白之物在宋軍的收穫中還算是少的，更多的是東京道的各種特產，藥物、動物皮毛數不勝數——遼國不斷提升稅率以滿足其對抗磨古斯聯軍和其內部契丹貴族的驕奢淫逸，使得遼國對東京道的游牧民族進行了非常嚴酷的剝削，錦州作為必經之地，其東京道的財賦稅收都要經過這裡，能夠獲得這麼多的戰利品也讓宋軍格外興奮。
由於錦州港口太小，無法停泊大船，呂大防在集中了戰利品進行統計後，金銀銅錢等直接被運上船返回大宋交差，而剩下數量難以計算的藥物、動物皮毛等物則用大車運回來州，在那裡還有大船停泊，用大船往大宋運輸這些物資最為方便。
呂大防現在心中也還是非常猶豫是就地進行防守，還是向大定府繼續進軍以便更加深刻的刺激遼國統治高層。最穩妥的方式就是就地防守，現在契丹人應該還不知道來州已經落到了大宋的手裡，進攻的矛頭肯定都集中在錦州，到時候呂大防可以選擇在錦州跟契丹人幹上一架，然後從容的突圍跑到來州去再繼續跟契丹人周旋——只要回到了來州，跨海登陸作戰部隊就安全了，有了來州這個可以停泊大型船隻的港口，宋軍可以從容的決定是堅守還是後撤回大宋。
正在呂大防有些猶豫不決的時候，無心則向他提供了另外一種選擇——就地進行破壞！