5月14日，第一次四方聯合會議結束後，聯合司令部正是掛牌成立。
會議上，裴承毅對各國將領的職權範圍做了調整。伊朗陸軍參謀長哈桑中將仍然擔任副總司令，敘利亞陸軍副參謀長塔林中將則由最先安排的參謀長改任常務副司令，伊拉克副總參謀長巴達林中將出任參謀長，而伊朗革命衛隊參謀長邁迪德中將、敘利亞空軍副參謀長雷迪亞中將、伊拉克革命衛隊副總司令蘭瑟姥中將與共和國的陸軍中將懷志剛、空軍中將賈寶國、海軍中將梁國翔、天軍中將盧定宇共同組成「聯合參謀執行委員會」，負責具體執行聯合司令部的作戰命令。
雖然伊朗與敘利亞將領對裴承毅故意提高伊拉克的地位有點不滿，但是主要安排都在計畫之中，加上「聯合參謀執行委員會」7名成員中的4人來自共和國，等於聯合司令部的大權全部掌握在裴承毅的手中，所以伊朗與敘利亞將軍也不好直接反對。不管怎麼說，與共和國合作，就得聽從共和國的指揮。
安排好這些事情，裴承毅著手解決細節問題。
按理說，裴承毅首先要做的就是確保伊朗、敘利亞與伊拉克軍隊會聽從聯合司令部的調遣指揮。因為李存勛已經打了包票，保證不會出現預料之外的情況，所以裴承毅沒有在這件事情上花多少功夫。雖然不清楚李存勛用什麼辦法讓伊朗、敘利亞與伊拉克的將軍俯首帖耳，但是裴承毅有理由相信，對於神通廣大的軍情局來說，搞清楚一些軍人的私人問題絕對不是什麼難事。
正是如此，在安排聯合司的人員時，裴承毅基本上沒有考慮其他國家的參謀。
數日之內，裴承毅就給楊少勇、胡荊安、龍宏恩與杜俊勇（天軍上校，專門負責戰略情報與戰區通信工作）安排了工作，並且由4位上校軍官帶頭，加上來自四大軍種與兩大獨立兵種的17名少校級高級參謀組成了「聯合參謀會」，為了便於指揮，裴承毅安排東方聞擔任了該參謀會的「會長」。也就是說，裴承毅下達的作戰指令都將通過參謀會下達給前線作戰部隊。說得再明確一點，這個由22名高級參謀組成的參謀會才是聯合司令部里最有實權的機構，懷志剛、賈寶國、梁國翔與盧定宇等4名中將只是出來鎮鎮場子，免得讓伊朗、敘利亞與伊拉克的將軍認為接受校官指揮是奇恥大辱。
從這一系列的安排中也能看得出來，裴承毅正在培養「嫡系軍官」。
雖然袁晨皓能夠成名，與裴承毅的栽培有很大的關係，甚至可以說，如果不是裴承毅在印度戰爭前堅持為前線指揮部設一名副司令，恐怕袁晨皓根本沒有出頭的機會。但是從某種意義上講，袁晨皓並非裴承毅的嫡系軍官。在他認識裴承毅之前，已經是總參謀部的高級參謀，而且得到了項鋌輝的信任與重用。由此可見，因為同樣是由項鋌輝提拔的，所以袁晨皓與裴承毅是朋友關係，而不是上下級關係。
站在裴承毅的立場上，不管他今後想幹什麼，都得賠償一批嫡系軍官。
東方聞上了年紀，而且是文職出身，就算能夠晉陞為將領，也只有象徵意義。更重要的是，裴承毅的工作、乃至日常生活都需要一個對他了如指掌的秘書，而東方聞無疑是最好的選擇。如此一來，裴承毅就得另外栽培幾名有發展潛力的高級軍官，而楊少勇、胡荊安與龍宏恩等人肯定是最佳選擇。事實上，按照共和國軍隊的晉陞體系，這場戰爭結束後，三位上校至少都會晉陞為準將，如果表現突出，還有可能像當年的袁晨皓，越級晉陞為少將，從而成為有影響力的將領。
當然，除了參謀軍官，裴承毅還得與另外一批軍人搞好關係。
5月21日，裴承毅在聯合司令部召開了網路視頻會議，參會人員中，除了懷志剛、梁國翔、賈寶國、盧定宇等四名中將之外，還有凌雲霄中將、羅少鵬中將、李繼先中將、杜子岐中將、江晚承中將、蹇柄彪中將、商雪韻中將、王學平中將、傅衛民中將與李東石中將等10名戰鬥單位的指揮官，以及海軍司令華劍鋒、空軍司令雷靖鳴、天軍司令齊鴻飛、陸戰隊司令湯成龍、南亞戰區艦隊司令張雪峰少將、南亞戰區航空兵司令梅樂馳少將、南亞戰區陸戰隊司令劉銳少將。
顯然，這是一次高級將領會議。
按照軍情局的安排，除了跟隨袁晨皓前往伊朗組建東線指揮部的人員之外，所有南亞戰區司令部的留守人員都編入了聯合司令部，接受裴承毅的指揮。也就是說，像張雪峰、梅樂馳與劉銳這樣的將軍，都得聽命於裴承毅。
軍兵種方面，李存勛早就跟林嘯雷打了招呼。戰爭期間，除了需要元首批准才能調動的戰略部隊之外，裴承毅可以按照作戰需要調動共和國的全部軍事力量，各軍兵種司令部無條件的配合聯合司令部。也就是說，裴承毅可以繞過總參謀部，甚至不用請示林嘯雷就能向各軍兵種司令部下達命令。
四位協助裴承毅的中將早就與李存勛談過，而且與裴承毅的關係都不錯。
關鍵在10個戰鬥單位的指揮官身上。
雖然「戰鬥單位」是陸軍搞的地面作戰單位，但是了解共和國軍隊的人都知道，這是項鋌輝在離開總參謀部之前留給陸軍的「遺產」。說直接點，這就是項鋌輝為了維護陸軍在共和國軍隊中的「老大哥」地位搞出來的東西。
當年，項鋌輝大力推行「聯合指揮機制」就讓人覺得，他想利用「聯合指揮」這個噱頭來確保陸軍的統治地位。不管怎麼說，共和國是一個必須重視、而且得高度重視陸權的大國，不管發展到什麼程度，陸權都關係到共和國的生死存亡，所以陸軍在共和國國防力量中的地位是不可動搖的。問題是，隨著共和國由地區強國轉變為世界大國，陸軍的地位肯定會受到海軍、空軍、乃至陸戰隊的挑戰，而隨著技術進步，還會受到天軍的挑戰。在此情況之下，如何確保陸軍的地位，肯定是任何一位陸軍司令都得考慮的問題。
毋庸置疑，繼續推崇「陸軍獨大主義」肯定行不通。事實上，彭茂邦力排眾議，讓特種部隊出身的項鋌輝接替他擔任總參謀長，就是希望由項鋌輝來限制陸軍的許可權，最終形成一種最能維護共和國國家利益的軍事體制。問題是，在項鋌輝擔任總參謀長的15年間，不可能什麼事情都落實到位。
受第三次軍事改革的影響，項鋌輝在離任前，必須給陸軍留下一條活路。
正是在這個大背景下，項鋌輝對陸軍的編製體系進行了大刀闊斧般的改革，「戰鬥單位」應運而生。
作為建立在「聯合指揮機制」下的地面作戰單位，「戰鬥單位」不但具有指揮地面部隊作戰的能力，實際上也是一個小型的多兵種合成作戰系統。也就是說，在實戰中，戰鬥單位肯定能夠指揮包括航空兵、陸戰隊等在內的眾多作戰單位作戰，甚至能夠指揮海軍的支援部隊作戰。正是如此，10個戰鬥單位的指揮官都是陸軍中將，而在前線指揮官中，一般都是少將，比如戰區航空兵司令官就是空軍少將、航母戰鬥群的指揮官最多是海軍准將。這種高人一等的軍銜，已經賦予戰鬥單位指揮官很大的特權。別的不說，為了讓來自空降部隊的李東石成為戰鬥單位指揮官，項鋌輝在離開總參謀部的前一天簽署了他的人事晉陞令，並且親自為李東石授銜。
可以說，在戰場上，戰鬥單位指揮官就是一個方向上的最高戰術指揮官。
作為陸軍改革的參與者與策劃者之一，裴承毅不可能不知道這10個戰鬥單位指揮官的地位有多高。雖然像凌雲霄、江晚承與商雪韻這樣的將軍已經上了年紀，最多在退役前晉陞為陸軍上將，但是像羅少鵬、王學平、傅衛民與李東石這樣的年輕將領，肯定有可能在成為上將之後獲得更高的地位，特別是李東石，這個來自空降153旅、從普通士兵一步一步爬上來的將軍已經創造了奇蹟，而且是自裴承毅之後，少壯派軍人的典型代表，今後的成就很有可能不在裴承毅之下。
總而言之，裴承毅得在這10位指揮官身上多花點精力。
雖然按照李存勛的說法，戰爭初期，最多投入4個戰鬥單位，即在伊朗投入2個戰鬥單位，在敘利亞與伊拉克各投入1個戰鬥單位，如果沒有絕對必要，要盡量避免投入更多的地面作戰力量。但是裴承毅心裡非常清楚，就算受後勤保障限制，共和國不可能像印度戰爭那樣動員幾十萬地面部隊與美軍在中東地區打一場大規模地面戰爭，隨著戰局發展，最終投入的戰鬥單位很有可能不是4個。如果戰局變得對共和國不利，又不能及時撤軍，恐怕10個戰鬥單位都得用上。
事實上，軍情局的一些做法已經證明了裴承毅的擔憂。
按照劉曉賓提供的資料，共和國與伊拉克當局的談判遲遲沒有得出結果，主要就是雙方在提供給共和國的軍事基地數量、以及是否需要由共和國軍隊接管伊拉克的國家交通設施上存在分歧，而導致這一分歧的根本原因就是共和國希望伊拉克當局全面配合，提供至少能夠駐紮6個戰鬥單位的軍事基地，並且根據戰爭需求調整交通運力，確保軍事物資與作戰部隊