這份文檔在前言介紹了「超弦理論」產生的緣由之後，並沒有繼續闡述超弦理論和超級系色的關係，而是直接切入了「超級系色」和「末日幻境」的概念：
超級系色，是一台超級生物計算機。
構成整個「末日幻境」的系統由三大部分組成：中樞部分的「超級系色」，環繞在中樞邊緣的LCL液，以及作為客戶端的圓柱形容器。池塘也好，導管也好，僅僅是用來控制LCL的流動。
這是一個出乎所有人意料之外的偶然傑作。誰也沒有想到，最初當作超級生物計算機的「超級系色」和LCL結合起來時，竟然會構成一個近乎完善的虛擬現實。
LCL嚴格來說，可以被視為一種生命形態，它是「活」的，是注射K系列藥劑之後發生變化的患者。初步推測，這是因為線粒體無法取得最終勝利的緣故，因為K系列藥劑在將原人格意識封鎖在大腦中的同時，也讓線粒體暫時無法侵佔大腦。迫於這種異常的狀態，肉體為了適應這種情況，不得不以一種劇烈的方式改變了自己的形態。
在這個過程中，發生了太多無法完全觀測的因子層面的互動，因此實際情況要更加複雜。
這是一種變異還是一種進化，直至如今都無法找到絕對性的理據，因為LCL形態已經完全超出了研究者的想像，在這種狀態下，人體的基礎因子結構發生了巨大的變化，最明顯的特徵是——曾經以個體存在的人類患者，完全失去了個性，只剩下近乎同質化的共性，因此，不同患者所形成的LCL液能夠以一種無比契合的方式融為一體。若將原本形態的人類形容成裝滿水的杯子，現在他們失去了杯子，只剩下水混合在一起，而他們的人格意識就在這片黃色的LCL液中飄蕩，但是，他們再也分辨不出哪裡才是自己的身體了，甚至，他們已經完全失去了身體的概念。
暫時無法清楚LCL中的人格意識究竟處於何種狀態，他們看到了什麼，聽到什麼，又感覺到了什麼，在長時間的觀測中，沒有發現這些人格意識能夠控制LCL進而影響外界的情況，也許，這是因為LCL再也不是屬於他們單獨一人的東西了。
至於包括大腦在內的整個身體轉變為失去個性的LCL液後，原本封鎖在大腦中的人格意識和新生人格意識會產生怎樣的交集，同樣無法進行觀測，但是研究人員一致認為，所有的人格意識，無論是原生的，還是新生的，都在LCL液中游曳，直到它們遇到彼此，之後產生社會化行為——交流、抗爭、交朋友或成為仇敵，一切都有可能。
為了能夠觀測這些人格意識的狀態，研究人員將它們接入了超級生物計算機「超級系色」，因此，以某種意義上來說，LCL液同樣是「客戶」。然而，令人意想不到的是，當兩者接觸之中，進一步的劇烈變化產生了。雖然暫時無法弄清到底發生了什麼事情，但是，看上去似乎是以「超級系色」中的程序為骨架，以接入人格意識為血肉，雙方以一種十分精巧的模式結合在一起，形成了一個近乎真實的世界。
在這個被稱為「末日幻境」的世界中，「超級系色」的程式不再是唯一的規則，也許仍舊是處於核心的規則，但也只能算是最重要的其中之一，而並非唯一。人格意識就像是長在龐大樹根上的藤蔓或青苔，以「意識」形態構成了世界的各種規則——人的意識是一種十分奇妙的東西，由意識和程式結合形成的規則不僅具備「客觀因素」，同樣具備「主觀因素」，當人們認為有重力，地球的重力加速度是個定值，於是，這個虛擬現實的重力被一定程度上「補完」了，當某個意識認為有相對論和量子力學，甚至可能具備相關的知識，因此，相對論和量子力學可以在世界中被推導出來。
諸如這些在現實中被研究出來的理論物理，只要LCL液中的人格意識存在其概念，幾乎都可以演化出來。
除此之外，人類的意識總會產生一些奇思妙想，哪怕它毫無理論根據，然而，在這個由主觀意識和客觀程式完美結合的虛擬世界裡，這些奇思妙想同樣開始影響世界的規則——一些在現實中並不存在，或者沒有道理的東西，開始出現在「末日幻境」之中。
「末日幻境」的存在變得非常複雜，讓所有參與研究的人都摸不著頭腦，但他們至少還控制著中樞「超級系色」，通過這台充當世界核心的超級生物計算機，他們可以對接入末日幻境中的「人」進行數據上觀測。雖然沒有十分直觀的影像，但是通過在巨量數據中尋找那些「有用」的數據，再根據這些數據對比LCL液在這個過程中所產生變化的數據，進而展開更近一步的解密和研究。
最終，在某次實驗後，安德醫生提出一個設想，並試圖讓所有人根據這個設想展開新的研究計畫：
「末日幻境」中的一切活動並非常規意義上的人類活動，而是包括了不同人格意識的相互作用和影響，程式和意識之間的相互作用和影響，乃至於各種因此之間所發生的作用和影響在內的各種活動的「倒影」。在這個「末日幻境」中，接入者所看到的所接觸到的東西，並非真實的東西，僅僅是一種富有暗示意義的「幻覺」而已。
這讓「末日幻境」的變化格外複雜，甚至連「情緒」都會讓整個虛擬世界產生意想不到的東西，這種東西在「末日幻境」中很可能會變成能夠被接入者目視，並接觸到的「實體」。
儘管只是一個設想，但安德醫生所提到的這些，似乎能夠解釋當前找出的一部分數據，於是，在「嘗試一下」也不錯的想法下，實驗計畫開始了。
在安德醫生的領導下，大家製造了「劇本」，這個「劇本」在理論上，能夠通過「超級系色」影響整個「末日幻境」。
在這個理論中，通過「超級系色」執行「劇本」，能夠對「末日幻境」中的任何人格意識都產生影響，之後，這種人格意識層面上的變化，反饋會他們現實中的「身體」，「身體」在意識的影響下發生變化，而這種變化又倒影回「末日幻境」之中。如此一來，現實和虛擬現實的深層交互形成了。
而所謂的「人類補完計畫」才在這一刻被從理論中釋放出來。
當然，也有人並不認為這個計畫有成功的可能性，以各種方式對其證偽，因為它有一個巨大的缺陷，那就是——安德醫生的理論必須正確——但是，該如何證明他的理論，以及經由這個理論誕生的計畫是正確的，至少是部分正確的呢？
單純舉例LCL液的變化沒有意義，或者說，沒有一錘定音的意義。因為LCL狀態的患者雖然在某種意義上是「活」的，但已經不能算是常規意義上的「人類」，必須要有一個符合常規意義，以及具備「個性」的人充當觀測中介——他既是觀測外界的主體，也充當被觀測的主體。
這必須是一個真正能夠同時存在於「現實」和「末日幻境」中的人類。研究者們進行了多次人體實驗，但是幾乎沒有一個具備常規特徵的人類能夠活著走出接入箱——他們最終變成了LCL液的一部分，無論他們曾經的肉體和意志有多麼強健，無論他們是否感染了「病毒」。
「末日幻境」和LCL液的侵蝕性和同化性超乎想像的強大。
這種情況導致特殊個體「高川」變得極為突兀，同樣是接入「末日幻境」中實驗體，在其他人紛紛失敗的時候，他仍舊存活了下來。當然，在大部分情況下，他的身體一直處於一種極為糟糕的狀態下，似乎隨時會變成LCL液，但偏偏在懸崖邊緣被某種力量扯住了，幾乎在接入「末日幻境」的時間裡，「高川」一直處於這種曖昧的狀態。這種情況讓研究人員感到提心弔膽，但「高川」仍舊活了下來，唯一可惜的是，當他第一次離開末日幻境的時候，似乎失去了大量的記憶，研究人員推斷，這是因為在「末日幻境」中重構了人格的關係。
這種情況在一定程度上實踐了安德醫生的一部分計畫——可以通過「劇本」製造完美的人格。但是，因為「高川」的失憶，他們無法獲得更多的來自「高川」主觀觀測的資料，僅僅能夠通過對其進行外部監測收割數據。
另一方面，身為末日症候群患者的「高川」的肉體並沒有得到恢複，反而變得十分混亂糟糕，漸漸地，僅僅是調理就足以讓人傷透腦筋。這讓安德醫生的「意識」影響「肉體」，藉此製造出「完美肉體」的理論受挫。
就在這時，安德醫生告訴諸人，在「高川」體內存在某種其他患者所不具備的因素，導致他本身就具備非比尋常的彈性和可塑性，那種進入「末日幻境」時的曖昧狀態是一種比單純處於現實中時的狀態更「好」的狀態，而「高川」之所以能夠活下來，是因為他長時間使用了用LCL液特製的調整液，他體內所存在的「不明因素」在調整液的作用下被激活。
為了證明這一點，或者說，出於毫無頭緒，姑且一試的想法，在安德醫生的推動下，在「高川」的身體崩潰時，或者說，突然進入「曖昧狀態」的時候，往他體內注射了基於LCL液改造的調製液，再一次將其