凡是看過《槍炮、病菌與鋼鐵》這本書的人大概都知道，在歐洲人殖民美洲的過程中，來自舊大陸的病菌給新大陸的印第安人造成了多麼恐怖的毀滅——死於天花的美洲土著，遠比死於火槍的土著人多得多！
但另一方面，此時的歐洲殖民者本身，也飽受瘟疫的禍害——當時歐洲的人均壽命不超過三十五年，每次橫跨大西洋的遠航死亡率高達十分之一，沒有下水道的城市裡糞尿遍地、臭氣熏天、疫病滋生，兒童夭折率居高不下，市民家裡沒有牙膏牙刷，偶爾來個牙齦出血都可能感染髮炎導致死亡。而基督教會又不提倡信徒洗澡的，絕大部分歐洲人身上隨便搓搓就是一堆臭泥，現代人待在他們身邊都能熏暈過去……如此不衛生的生存環境，自然導致了瘟疫的反覆發作，經常是一場瘟疫就要死上幾萬到十幾萬人，虧得那年頭的歐洲人生育率高，正所謂越窮越生，不僅扛過了死神的反覆收割，還有餘力向全世界發動擴張。
總之，即使是這年頭歐洲人在美洲建立的早期殖民城鎮，也經常是爆發一場瘟疫就死掉一半的人。
因此，當五百多穿越者來到曼哈頓島之後，首先帶給美洲印第安原住民的「禮物」，並不是穿越者們贈送給德拉瓦部落的鐵器、布匹、塑料小首飾和碳酸飲料，而是來自二十一世紀的各種細菌與病毒……
幸好，北美的這批穿越者普遍節操較高，面對印第安人鄰居部落之中爆發的疫情，他們並沒有袖手旁觀，更沒有幸災樂禍甚至落井下石（華美當局如此熱心的一個重要原因，是有非常多的穿越者小夥子娶了德拉瓦部落的印第安姑娘，哪怕只是看在老婆孩子的份上，也得對岳丈家裡照顧一二），而是派出醫療隊，竭力救治患病的土著，傳授給印第安人各種先進的醫療衛生觀念……總算是讓他們渡過了這場危機。
接下來，隨著全球各地的移民不斷進入華美共和國，在帶來了全世界各地的實用技藝、特有農作物品種和異國牲畜之餘，也帶來了全世界各地的疾病……在這個年代，凡是能夠活到成年的人，都對故鄉的各種疾病擁有了極強的免疫力，但在遙遠異國的疾病面前，卻往往表現得非常脆弱。所以，在華美共和國這個移民國家，各類傳染病的發病率是很高的，即使有著穿越者們超越時代的醫療衛生觀念，還有陸續「發明」出來的各種消炎藥品，頻繁爆發的流行病依然造成了大量人口——尤其是嬰幼兒——的死亡。
舉例來說，來自歐洲的移民來到北美之後，經常會感染上一些在亞洲常見，卻很少出現在歐洲的疾病；而東亞移民也很容易染上歐洲和西方特有的疾病——由於他們在故鄉很少接觸這些疾病，體內的免疫能力有限，每次都會造成死亡。至於印第安原住民則最為倒霉，無論在歐洲還是亞洲的病菌面前，都毫無免疫力。而作為美洲代表，他們能夠「貢獻」給全人類的恐怖疾病，比較著名的卻只有梅毒一項而已——與其他烈性瘟疫相比，區區梅毒實在是上不得檯面，不僅傳播渠道狹窄，而且癥狀很容易被看出來……
面對在自己國土上每天都在召開的全球病菌交流會，饒是華美共和國已經極其重視對傳染病的防治，一經發現病患，立刻隔離收治，絕不手軟，甚至就連病人住過的房屋都會燒毀，可還是每年都有小範圍的流行性疾病爆發，造成成百上千的傷亡……但好歹一直沒有釀成全國性的慘禍，也算是不幸中的大幸了。
因此，在此次大規模引進東方移民的時候，早已成了驚弓之鳥的華美共和國衛生部門，便強烈要求全體新移民必須在山東本地完成檢疫凈化工作，決不能再讓這些「移動病原體」污染了北美大地——否則的話，那些在舊大陸飽受病菌考驗，抗病能力比較強的歐洲裔和亞裔國民倒也罷了，免疫系統相對「嬌弱」的華美印第安裔國民和那些附庸於共和國的印第安部落，可就要遭受滅頂之災了。
——雖然在得到了中央的跨位面援助之後，華美共和國已經在籌辦全民疫苗接種事宜，但畢竟剛剛開始推行不久，已經接種疫苗的人口比例還不足十分之一……就算如今有著現代世界的藥物可用，但是給這麼多人治療傳染病的龐大花費，還有因為採取隔離防疫而造成的經濟損失，顯然還是能避就避為好。
相反，位於南美的東岸共和國，倒是來者不拒。登州軍抓來的難民和俘虜，只是隨便洗了個澡換了身衣服，就被直接丟到了後世阿根廷的潘帕斯大草原上開墾邊疆——東岸共和國倒不是對自己的醫療衛生系統有信心（事實上，他們的醫療衛生系統並不比華美共和國更先進，甚至還要稍微差一點），而是根本沒把南美的印第安土著當做人來看待……當然，嚴格來說，也沒怎麼把這些山東移民當成人來看待……
跟華美共和國首先把新移民集中到首都，經過審核與培訓之後，才發往各個屯墾農場和廠礦作坊的做法不同，東岸共和國不讓新移民經過人口稠密的首都東方港和開發較好的繁華市鎮，而是直接【隨意門】的出口安置在了最荒涼的蠻荒邊疆，移民們一到地頭就動手開荒。
這樣一來，就可以最大限度地避免這些「移動病原體」跟東岸國民接觸，從而在各個主要聚居地誘發瘟疫。至於國境周邊的印第安土著……東岸共和國當局還巴不得他們死得越多越好呢！
——北美和南美的兩個穿越者集團，在對待歐洲移民的宗旨上相差無幾，都是「限制、融合和使用」。但在對待美洲印第安人原住民的態度上，卻是一個天一個地：在華美共和國，以德拉瓦部族為代表的印第安人也是構成國家的主要人口之一，而且由於多年相處和通婚，早就已經高度漢化和融入社會，普遍習慣了穿越者的生產生活方式，政府用起來比東亞移民還順手，自然也把他們當做自己人來看待。
當然，跟華美共和國為敵鏖戰的印第安部落也很多，但那又是另一回事了——印第安人其實是類似「歐洲人」、「亞洲人」這樣的統稱，各個印第安部落的成員可從來不會把其他部落的人當做同胞來看待，不同部落之間的廝殺同樣極端殘酷血腥，時常發動滅族規模的大屠殺，彼此之間的仇怨不比跟殖民者更少。
而在南美的東岸共和國，這個窮兵黷武的軍國主義國家，卻是另外一種狀況——在登陸初期，軍方力量尚未成型的時候，這個穿越者政權一度接納過大約兩千名前來投奔的印第安人，把他們納入國民範疇之中。但隨著外部軍事威脅的加大，在進入軍國主義時代之後，東岸共和國就全面糾正了之前的「錯誤政策」，總體上一直都是寧可引入歐洲移民和非洲黑人來開發荒地，也要把印第安原住民當做需要清除的對象。
按照東岸軍方強硬派的理論，在這個物競天擇、叢林法則和社會達爾文理論盛行的鐵血年代，各個民族的鬥爭從來都是無所不用其極，在南美的土地上，他們這些穿越者身為外來的強盜，不殺光這片土地原來的主人，還能心安理得地住下去嗎？甚至妄想融合吸收這些原住民？這簡直是作死無極限！
因此，作為外來政權的東岸共和國，可以吸收明朝人、日本人、歐洲人甚至阿拉伯人成為正式國民，但唯獨不能吸收印第安人，為的就是他們頭上頂著的「原住民」光環——在東岸共和國的軍方看來，代表他們天然享有對這片土地的一切權益，即便是他們的混血後裔也比純血外來人更有權力佔有這片土地，這也是後世南美國家種族隔閡的重要原因之一，自己這些穿越者絕對不能重蹈覆轍，給子孫後代留下麻煩。
在這樣殘忍無情的執政理念之下，東岸共和國對待土著原住民的態度，自然是極為兇殘和不人道的。大航海時代的西方殖民者，為了追求商業利益，可能還會留下原住民的一條性命，而到了更加兇殘的東岸共和國手裡，印第安土著的下場不是被殺就是流放海外，以此來給移民騰出生存空間——移民們渾身沾滿著印第安人前所未見的病毒，一手持劍一手持犁，肆意地用火槍和病菌屠殺著原本過著與世隔絕生活的印第安土著，搶走他們的土地和家園，奴役他們的身體與心靈，然後用壓榨得來的財富滋養自己的國民，擴展自己民族和國家的生存空間，簡直就是最恐怖的毀滅者與大惡魔。
所以，在華盟的總部會議上，當華美共和國的一位代表嚴肅地提出，如果讓未經檢疫的山東流民大規模進入美洲，很可能會導致安置地四周疫病蔓延、危害美洲原住民健康的時候，東岸共和國方面的代表反而大喜，巴不得潘帕斯草原的印第安土著無聲無息地死於病魔之手。接下來，在偶然得知了王秋、李維一行人在中世紀歐洲一邊救人一邊殺人，到處廣撒瘟疫毀滅世界的「偉業」之後，幾位殺人如麻的東岸共和國陸軍將領更是見獵心喜，甚至開始討論著要針對印第安土著展開細菌戰，比如設法在印第安村落附近投放病毒和細菌來污染水源，往聚居地釋放帶菌昆蟲等等……但考慮到這些做法實在太刷下限，而且瘟疫一旦被釋放出來，就很難控制，說不定最後還會禍害到穿越者頭上，所以最後還是打消了這個危險的想法。
再接下來，海參崴、台灣和海南島都屬