南燁的科學城從興建那天起便是仿照塢堡作為防禦之用。城中不光糧草眾多，還有不少守城器具，又豈是可以輕易攻破的？看著城下黑壓壓的數萬兵馬和各種攻城器具，南燁絲毫不亂。因為每一種攻城器械，城中都有守城器械與之相對。
西涼軍用雲梯、飛梯攀爬城牆，南燁士卒便用撞車、叉竿將梯子推倒。西涼軍用衝車、撞車來撞城門，城上士卒便用滾木、礌石將其砸壞。西涼軍用巢車登高向城中放箭，守城士卒便用床弩射殺敵軍。至於那些蟻附攻城的士卒就更好對付，居高臨下一陣箭雨便能殺傷無數。
在眾多守城器械當中給南燁印象最深的是一種叫做夜叉擂的滾木。這種守城武器是用直徑1尺，長1丈多的濕榆木為滾柱，滾柱上密釘「逆須釘」，釘頭露出木面5寸，就像一個特大號的狼牙棒。在滾木兩端安有直徑2尺的輪子系以鐵索，連接在城頭絞車上。當敵兵聚集城腳時，便將此物重重砸下，無數西涼兵便被碾壓而死，想要還手都無從下手。使用一次之後還可以用鐵索絞車拉回重複利用，當真犀利無比。
在火器發明以前，守城士兵藉助各種器械佔有很大優勢，即便攻城方同樣器械優良也要有五倍到十倍的兵力才有希望強攻城池。董卓知道南燁有三千士卒，便派來了五萬大軍就是這個道理。可是城中守軍一下子變成了兩萬精兵，董卓這五萬兵可就不夠看了。
董卓和他麾下眾將不瞎也不傻，只攻了一陣便發現四面城防滴水不漏，幾千士卒葬身城下，哀號慘叫響成一片。再看城上士卒個個精神抖擻，戰法嫻熟，哪裡是尋常百姓？分明都是百戰精兵。關鍵是城中的箭矢無數，守城器械充足，根本不像一天之內倉促準備，倒像是早就準備好了各種器械等著人來攻城。
「奉先，城中士卒為何如此之多？」董卓忍不住問呂佈道。
呂布被問的無言以對。他向城牆上望去，就南燁所在這一面城牆，守軍便足有五千餘人。若是加上那些上上下下搬運滾木礌石和操作器械的士卒恐怕有萬人之多。一面城牆一萬人，四面城牆便是四萬，別說五萬西涼兵，便是再加洛陽城中五萬大軍也攻不下這科學城來。
華雄見呂布面帶愧色勸董卓道：「主公此時責備將軍亦是無用。今日天色已晚，不如暫且收兵商議對策，明日飽餐戰飯再來攻城。」
董卓也沒有更好的辦法，便下令鳴金收兵。戰後檢點人數，只攻城片刻工夫便折損了六千餘人。與董卓相比，守城的南燁基本上可以算是沒有損失，傷者亡者加在一起才有數百人，而且還是傷者多，亡者少。
雖說傷亡不大，可南燁還是十分心疼。這一戰他是從頭看到尾，每一個死去的士卒都是一條鮮活的生命，就算看慣了生死，南燁還是做不到漠視生命。他下令將陣亡士卒安葬，並使用強記技能記下了每一個亡者的名字，有家屬的發下撫恤，儘力安排好每一個士卒的身後事。
董卓的士卒可就沒有那麼幸運了，傷的不重還能趁著夜色爬回營去。重傷的就只能躺在城下的死人堆里等待死亡的降臨。這年頭可沒有什麼日內瓦公約，也沒有紅十字會救援。董卓才不會冒險來城下搶救傷員，在他眼裡一旦士卒傷殘不能再上戰場就變成了廢物，不要也罷。
南燁雖說對待敵方俘虜、傷員一直態度溫和，可是那是在戰爭結束確定勝局的時候。交戰期間他可不會去同情敵人。古代戰爭打掃戰場的都是戰勝方，因為屍體上的兵器、鎧甲都是錢，甚至屍體上插著的箭矢都要拔下來二次利用。所以城上守軍是不會讓敵軍來城下收屍的，直到戰爭結束的一刻。
聽著城外那些重傷員的呻吟，南燁十分不忍，便命趙雲領著一隊射手去將城下重傷不治的西涼兵一一射殺。此時瞬間死亡對於那些重傷者來說已然成了一種仁慈，否則他們只能在痛苦中慢慢失血過多而死。
南燁在城中忙著處理戰後工作。董卓則是在與眾將議事。帥帳中的董卓沉著一張胖臉就像一隻沙皮狗一樣，而他麾下眾將也沒一個開口，尤其是呂布更是面有愧色低頭不語。
董卓見眾將皆不開口，便問道：「今日一戰錯估了南燁城中兵力，我軍傷亡不小。諸君可有破城良策？還是該就此收兵？」
呂布此時可不敢再誇海口主戰，依然沉默不語。華雄雖然看出此戰勝負已然明朗，心中認為應該撤軍，可是卻不敢開口言敗，生怕激怒董卓。
眾將之中就數李傕、郭汜跟隨董卓日久，深知董卓性情。一番察言觀色之後，李傕道：「主公，今日雖敗卻非戰之過。皆因我等錯估了城中兵力，分散重兵四面攻城才有此敗。依我之見明日攻城不妨佯攻三面，專攻一面。科學城小，一面城牆排不下許多兵馬，只要將一面兵馬耗盡攻入城中，我軍勝矣。若此計不成再收兵不遲。」
董卓損失慘重確實心有不甘，若是沒有妙策他再不甘心也只能撤兵。如今見李傕出了一計，且不論這計策是好是壞，有理沒理，董卓都好像是抓住了救命稻草，決心明天再賭一把。於是對眾將道：「稚然言之有理。不知明日有誰願率兵主攻？」
呂布新投董卓，本打算借著今日之戰立些功勞，也在董卓和眾將面前顯顯本事。沒想到寸功未立不說，還被南燁劈頭蓋臉罵了一頓，又錯估了城中兵馬導致戰敗，這讓呂布心中別提多憋屈，真是啞巴吃黃連，有苦難言。
此時聽董卓點將，呂布起身行禮道：「布願領兵為先鋒再戰南燁！」
李傕、郭汜跟著起身道：「我等願統飛熊軍助奉先一臂之力。」
董卓見今日雖敗，麾下眾將卻氣勢不減也很欣慰，露出了一點笑容道：「好！明日一戰便仰仗諸君齊心協力斬殺南燁。」
次日天明，董卓命麾下士卒飽餐戰飯直接攻城，再也不搞什麼城下叫陣了，他估計軍中除了李儒恐怕也沒人能說的過南燁。戰鬥在一開始便進入了白熱化階段。
南燁麾下眾將也不是吃素的，剛一接觸便發現董卓集結兵力主攻一面。說來也巧，呂布選擇的進攻方向正是張遼、高順鎮守的東門，也不知道是不是他故意為之。
交戰剛剛開始的時候還是士卒與士卒的較量，這與昨天相差不大，差別只在於進攻強度的不同。昨日四面圍攻，董卓損失了六千餘人，今日單攻一面，在與昨日相仿的時間裡董卓便損失了五千餘人，張遼、高順也損失了近千人，可見戰局激烈到了無以復加的程度。
如此緊張的局勢下南燁自然帶領親衛來助二將守城。只見城下的護城河已經被董卓用壕橋基本填平失去了作用，雲梯也幾乎排成一排向城牆上搭來。城上的撞車顧得上左邊顧不上右邊，終於有雲梯搭上了城牆。西涼兵第一次站上了科學城的城頭，與守城士卒展開了肉搏。
南燁記得昨天董卓的士卒可是連城牆的邊都沒摸到，城中士卒都是被流失所傷，沒想到今日董卓竟然如此拚命強攻一面，好像士卒生命如同草芥一般。南燁一邊命人從三面調兵來援，一邊讓典韋、周倉率領親衛上前助戰，無論如何不能讓西涼兵有機會登城。