中途島海戰拉開序幕後，基本上和歷史上中途島海戰沒有兩樣，美軍勝在早有準備，日軍勝在艦載機飛行員的作戰經驗豐富，兩軍這一交手，開始的時候竟然打了個旗鼓相當。
日軍偷襲中途島的第一波攻擊機群帶隊指揮官投完炸彈準備返航的時候，不得不向南雲忠一報告需要第二次轟炸，這個時候是早上7點鐘；僅僅5分鐘後，從中途島起飛的10架美軍魚雷轟炸機就抵達了日軍機動編隊的上空，開始攻擊，同樣沒有見功，10架魚雷轟炸機被日軍機動編隊擔任空中警戒的零式戰鬥機擊毀7架，只有3架成功脫逃。
友永丈市大尉的報告，加上中途島飛來的美軍轟炸機的拚死攻擊，讓南雲忠一相信中途島美軍仍然有強大戰鬥力。於是，南雲忠一下令赤城號、加賀號航母甲板上已經裝載好準備攻擊美軍航母編隊的魚雷的戰機推入機庫，改裝高爆炸彈，準備對中途島進行第二波轟擊。
赤城號、加賀號甲板上的日軍忙碌開了！
實際上，這個時候200海里外的美軍第16特混艦隊的企業號航母、大黃蜂號航母起飛的117架戰機已經升空，向日軍機動編隊撲來了。
南雲忠一不明就裡，依然站在旗艦的指揮台邊，兩眼直盯著中途島方向，準備一旦赤城號、加賀號上的艦載機完成換裝高爆彈作業，就下令起飛對中途島實施第二波攻擊。
從偷襲海參崴到偷襲珍珠港再到攻佔東南亞，日本海軍聯合艦隊用偷襲戰法賺了個盆滿缽溢。直到珊瑚海之戰，日軍才開始品嘗到艦載機對攻的可怕苦果。南雲忠一和山本五十六一樣，急於消滅美軍太平洋艦隊的航母編隊，但是他現在還沒有接到由潛艇組成的先遣偵察編隊和偵察機發現美軍航母編隊的報告，完全可以放手對中途島實施第二波攻擊，等友永丈市大尉率領的第一波攻擊編隊返回母艦後，可以立即裝載魚雷，執行對可能出現的美軍航母編隊攻擊任務。
南雲忠一此時自以為勝券在握，異常冷靜，面色嚴峻，裝的就像個決勝千里的名將一樣。
距離南雲忠一下令赤城號、加賀號甲板上的艦載機寫下魚雷、改裝高爆航空炸彈僅僅過了24分鐘，7點半，從重型巡洋艦利根號推遲半小時起飛的一架偵察機終於在距離中途島240海里的大洋上發現了10艘美國軍艦。南雲忠一聞警不亂，當即命令該偵察機繼續查明敵人艦隊是否擁有航空母艦，同時命令暫停對魚雷機的換彈。
赤城號、加賀號上的日軍被南雲忠一的朝令夕改弄得異常忙亂，但是這些一心為天皇陛下建功立業的日軍官兵沒有怨言，而是馬上執行司令官的命令，暫時停止了對魚雷機換裝高爆炸彈的工作。
此時此刻，沒人能洞悉南雲忠一的心情，不知道他是心存焦慮呢，還是真的像他表現出來的那樣淡然若水，反正是機動編隊都在等候他的命令呢！
偵察機還沒有發回準確的報告，空襲警報卻再一次響起。從中途島上起飛的第二波40多架美軍轟炸機撲了過來，其中就有美軍的空中堡壘B17轟炸機。南雲忠一果斷命令擔任空中警戒的零號戰鬥機消滅美軍轟炸機。
炸彈在爆炸，日軍為航母護航的防空火力在猛烈開火，日軍航母在做規避動作，戰場上的氣氛一下子緊張起來。
美軍轟炸機沒有戰鬥機護航，空中堡壘B17又不能俯衝轟炸，日軍的零式戰鬥機在此時放眼全世界仍然是先進的。激戰結果是美軍40多架轟炸機竟沒有一枚魚雷或一顆炸彈擊中任何一艘日艦，被零式戰鬥機擊退。
眼看著美軍轟炸機的炸彈在海面上墜落、爆炸，南雲忠一隻是偶爾皺一下眉頭，並沒有多話。直到美軍轟炸機群被零式戰鬥機擊退，南雲忠一的臉上才浮現出了一絲笑容。
喜事總是一樁接一樁的，剛剛擊退美軍中途島飛來的岸基轟炸機群，8點15分，南雲忠一就接到了偵察機的報告，美軍艦隊里確實有航母的存在。
攻擊中途島最重要的目的就是尋殲美軍航母編隊。這一接到發現美軍航母的報告，南雲忠一當即下令各艦停止給艦載機裝高爆炸彈，飛機送回機庫重新改裝魚雷。
公平的說，到此為止，南雲忠一的指揮沒有什麼錯誤。問題是他這樣一會兒換魚雷、一會兒換炸彈，把航母上的日軍弄混亂了，小鬼子們為了爭取時間，把從飛機上卸下的炸彈直接堆放到了甲板上。想想吧，萬一此時美軍轟炸機趕到，只要能命中甲板，那會是一種什麼結果？
上帝欲使其滅亡，必先使其瘋狂！這句話用在航母對決上，應該改一下，那就是上帝欲使其滅亡，必先使其混亂！
日軍的混亂還在持續。這個時候，攻擊中途島的第一波飛機回來了，急需降落，擔任空中警戒的戰鬥機也需要馬上降落加油！
南雲忠一犯難了，他如果命令第二波攻擊編隊起飛去轟炸美軍航母的話，飛機跑道就會被佔用，從中途島完成任務回來的飛機就得全部掉進水裡。這個損失太大，日本海軍已經承受不起了，他們太缺乏補充飛機了。而且，第二波攻擊編隊尚未完成換裝魚雷作業，就是起飛，也沒有戰鬥機護航。
第二航空母艦戰隊司令山口海軍少將是個狠貨，為了目的不計後果，他向南雲忠一建議「立即命令攻擊部隊起飛」。
這是明顯要放棄從中途島回來的油箱空空的飛機了，南雲忠一當然不能答應，他決定把攻擊時間推遲，首先收回空襲中途島和攔截美軍轟炸機的飛機，然後重新組織部隊以進攻美軍特混艦隊。
日軍從中途島返航的飛機在南雲忠一的命令下開始相繼降落了。
一直忙乎到了9點18分，日軍機動編隊的艦載機才全部完成作業，掩護艦隊的零式戰鬥機開始起飛。
不等零式戰鬥機完成起飛，警報拉響了，一隊由美軍大黃蜂號起飛的15架「毀滅者」式魚雷轟炸機向日軍機動艦隊撲了過來。可惜的是，他們依然沒有戰鬥機護航，被日軍零式戰鬥機和艦炮火力攔截。勇敢的美國小夥子們在無線電中吶喊著，駕機朝日艦撞了上去，展開了悲壯的自殺式攻擊。一團團火球在空中綻放，30名美軍飛行員連帶他們駕駛的15架魚雷轟炸機，除一人逃生外，全部把生命溶進了燃燒的太平洋！
緊接著，從企業號、約克城號起飛的28架美軍戰機也趕到了，向蒼龍號和飛龍號展開攻擊。這一次，美軍戰機同樣沒有討到好，投了那麼多魚雷，竟然沒有一發命中日艦，還被擊落了20架魚雷轟炸機。
太平洋在燃燒，勇敢的美國陸海軍航空兵的生命在燃燒！
從另一個角度講，這種結果是美軍陸海軍航空兵缺乏實戰經驗造成的。如果是馮達飛率領的我軍轟炸機編隊能夠遠涉重洋飛抵日軍航母上空，以馮達飛、戴維等人的技戰能力，那會以絕對低空掠行姿態貼著日艦飛行，僅用機載機槍就能把甲板上的炸彈打爆。
不管怎麼說，南雲忠一的機動編隊已經被美軍艦載機群咬住了，厄運就要到了。可悲的是，南雲忠一老鬼子沒有意識到這一點，仍然站立在指揮台前，面無表情，命令艦隊以30節的航速向北航行，以避開可能再來攻擊的美軍轟炸機，準備全力進攻美軍特混艦隊。
日艦編隊一向北航行，就轉到了迎風的方向，正是最利於美軍轟炸機群順風撲擊的絕佳境地。而且，日軍準備起飛攻擊美軍航母編隊的102架飛機全部整整齊齊地排列在甲板上，等待起飛，甲板上同時堆放著炸彈、魚雷。
要是美軍的後續艦載機群這個時候不出現，日軍的艦載攻擊機編隊放飛後，等著倒霉的就是美軍航母了。日軍飛行員的技戰水平明顯比美軍高一大截，一旦他們飛臨美軍航母編隊上空，後果可想而知。
但是，美軍是有計畫的伏擊，日軍的好運到頭了。
克拉倫斯·麥克拉斯基少校率領的從企業號起飛的33架無畏式俯衝轟炸機出現了。這個時候，正是加滿油的日軍第一架戰鬥機從航母上起飛的時候，克拉倫斯·麥克拉斯基少校當即在喉部送話器里喊了聲「上帝保佑美國」，就命令分成兩個中隊分別向赤城號、加賀號航母發起攻擊。緊隨克拉倫斯·麥克拉斯基少校編隊之後的，是從約克鎮號航空母艦上起飛的17架「無畏」式俯衝轟炸機編隊，它們撲向了蒼龍號航空母艦。
一架架轟炸機俯衝了下來，日軍機動編隊防空警報發出刺耳的哀鳴聲，護航的巡洋艦、驅逐艦都在開火。
晚了，晚了，一切都毀在了南雲忠一的先收回從中途島返航的飛機、然後再組織編隊攻擊美軍航母編隊的命令上。
炸彈落在了赤城號、加賀號、蒼龍號的甲板上，爆炸聲響起來的時候，甲板上的日機就像斷線的風箏一樣，直往海里摔落。
如果僅僅是美軍的炸彈，可能日軍的這三艘航母還有救。問題上甲板上到處都是日軍自己的炸彈、魚雷，那都是裝好了引信的，遇到美軍炸彈攻擊，就像熱戀的情人一樣，擁抱在了一起，發生了大殉爆。
僅僅是短短的5分鐘時