民國四年（1915年）秋季，畢業的時候，李藻麟因為飛行科和學科考試成績優異，升任少校航空連長。時值袁世凱準備派其心腹陳宧（二庵）出任四川將軍，並統帥一支勁旅入川，以鎮壓西南反帝制勢力。最初，擬派賈德耀所屬第15混成旅隨陳入川，但賈德耀索要15萬元開拔費，袁世凱認為要價太高；而第16混成旅馮玉祥只要10萬元，遂改派馮旅入川。
同時，令派李藻麟率領所屬航空連隨軍出征，以壯軍威，李藻麟的航空連受馮玉祥節制，可見，李藻麟和中國王以及中國參戰軍的之間那可是源遠流長，這老馮的第十六混成旅日後就是王庚組建參戰軍的基本老底子呀！
當時，李藻麟的航空連配備法式飛機三架。啟運時，飛機均拆卸裝箱，由京漢鐵路運抵武漢，然後裝船，逆水而上到達重慶，再由旱路運抵成都，歷時一個月。機場修建竣工後，飛機組裝調試，經過試飛，又進行了一次隆重的飛行校閱儀式。四川將軍陳宧、參謀長張聯棻、旅長馮玉祥等均親臨現場觀看飛行表演。四川人親眼目睹飛機翱翔於藍天，實始於此時。
在航空連以後的飛行中，曾發生過一次嚴重的安全事故，一天，李藻麟正駕機飛行，發動機突然發生故障，飛機失控，迅速下落。在這千鈞一髮之際，李藻麟竭盡全力控制下落方向，使飛機一頭栽到一棵大樹上，由於樹榦挺拔、枝葉繁茂，竟將飛機托住，奇蹟般形成一次「軟著陸」避免了機毀人亡。
事後檢修過程中，最棘手的是發現汽缸出現細小裂縫，機械師對此無能為力。李藻麟決定求助於成都金垠作坊的老師傅，也就是小爐匠，李藻麟覺得他們經驗豐富、或許能解決問題。一位老師傅真是不負重託，他用極細的銀絲把汽缸裂縫填實，然後焊接打磨。經過這樣處理之後，發動機的工作效果居然完好如初。對機翼的修復，李藻麟們採取製作油布雨傘的辦法，纏一層布、塗一層油，一共纏了三層布、塗了三遍油，這架飛機終於再次飛上藍天。
未幾，帝制失敗，陳宧決定撤軍北歸，這馮玉祥要李藻麟留在他的隊伍中，當然是為了把航空連這稀罕的飛機給留做十六混成旅的家底，而李藻麟那時因為對馮有點看法，沒有同意，因為陳宧最後決定撤軍時，曾召集一次高級軍官擴大會議，李藻麟雖然只是一名少校連長，但航空連是一個直屬獨立單位，因此得以列席會議。
在會上，陳宧講話後，請諸將領發表意見，馮玉祥是關鍵人物，是實力派，握有兵權，地位又高，按理最有資格發言。但馮卻坐在那裡閉目養神，一語不發，看到他的這種情況，別人誰都不好發言，致使會議長時間冷場，陷陳宧於十分尷尬的境地。究竟是同意撤軍還是不同意？或是另有高見？理應明確表態才是，怎麼能一聲不吭呢？
因此馮大炮當時給李藻麟的感覺是：在關鍵時刻，故意給長官出難題，看長官的好看；如此對待長官，未免太過；與一個心胸不夠寬厚坦蕩的人相處，恐難處好。因此，當馮提出要李藻麟留在他的部隊中時，李藻麟英明果斷的拒絕了，這一點也是日後中國王對李藻麟青睞信任有加的重要原因之一，小李子到底是有眼光的主，一眼就看出了老馮腦後的反骨，這不容易啊！
李藻麟在民國五年（1916年）秋季回到北京，回京後即向參謀本部報到，並將飛機如數交差。當時，正值陸軍大學第五期招生，參謀本部徵得李藻麟的同意，保送李藻麟去報名投考。由此，李藻麟考入陸軍大學第五期肄業。
這陸軍大學在北京西直門內大街崇元觀衚衕，學制三年不奇怪，學員均帶薪學習也不奇怪，奇怪的是，陸大要等每期學員畢業後，再招下一期，因此在校學員永遠只有一屆。學員均須具有中級軍官學校畢業資歷，並具有三年以上的實際工作經歷。這下子可好，日本陸軍大學校每年能有5、60學員畢業，而中國的陸軍大學三年才畢業一期，而且人數不過7、80人，日本陸軍大學校每期畢業生前六名被稱為優等，第一名稱為首席，都獲賜天皇軍刀。
而中國陸軍大學則在每期畢業時進行的參謀旅行演戲結束後，由教官推舉10名優等畢業生作為推薦生，如果不是被中國參戰軍橫插一手把李藻麟這個陸大第5期的優秀學員給提前弄回了參戰軍航空隊的話，在王庚前世，李藻麟同學1919年畢業時名列前10名優秀學員的名單之中學，當然，咱們3年出70多陸大畢業生的功夫，夠日本三期出150—180陸大畢業生了，當時中日雙方陸軍人才培養的基礎和規模差異可見一斑。
在李藻麟的第五期的同學中，有一位特殊學員，就是楊毓珣。楊毓珣字琪山，曾任張作霖、張學良的副官長。他是世家子弟，伯父和父親均是袁世凱的心腹智囊。他的伯父楊士驤，曾繼袁世凱出任山東巡撫和直隸總督；父親楊士琦曾任左丞。
1914年，袁世凱廢除臨時約法，另行制定新約法，總統—獨攬全國軍政大權，特任命徐世昌為國務卿，國務卿下設左丞和右丞。其父楊士琦為左丞，錢能訓為右丞。而楊毓珣本人又是袁三小姐之夫、袁世凱的女婿。
這楊毓珣被保送入陸軍大學第四期，其時袁世凱尚在世，但由於他不是中級軍官學校畢業，即使擁有這樣顯赫的人際關係，楊也僅是旁聽生，儘管各科考試合格，也不能算作陸軍大學畢業，而是只承認他具有中等軍官學校畢業的資格。為了取得陸軍大學正式畢業資格，楊毓珣又參加了第五期學習。可見，那時辦事制度還是相當嚴格的。