方時俊就是寧時俊。時人對於姓氏的看重為後人所不解。得以改回本性，方時俊竟然設香案請了祖宗靈位，禱告天地，啟稟祖先。雖然不能回福建祖籍行其事，但也搞的隆重無比，寧時俊為了變回方時俊，竟然在祭祖儀式上大哭一場。
方伯謙在甲午海戰中臨陣逃脫被李鴻章處死，方家私下認為純屬冤情。但北洋艦隊全軍覆沒總要有人負責，比起那些英勇戰死的同僚，逃回軍港的方伯謙受到嚴厲處分也不應該抱怨什麼。但方氏家族為此蒙羞是不爭的事實，如果不是因為伯父出事，已經獲得秀才功名的方時俊絕不會離開家鄉遊歷四方，進而「機緣巧合」落草蒙山，成為了龍謙手下的一名什長，從而脫胎換骨，步步高升，由蒙山軍參謀長而山東軍司令官，一直到新中華的海軍總司令。
在很多同僚看來方時俊出任海軍司令有些被閑置的意味，但方時俊毫無怨言甚至滿懷信心地上任了，既為雪洗家族的恥辱，也為心中那份豪情夢想。
方時俊無疑是龍謙最核心班底的成員。在自1898-1906八年漫長的歲月中，方時俊有無數次機會可以與龍謙深入地交流，或者叫聆聽龍謙的「教誨」。如果有人理解龍謙抱有的真正夢想，方時俊絕對是其中之一。
龍謙從來就沒有將奪取天下看成是多麼艱難多麼偉大的事情，但奪取天下後要做的事才是他感興趣並願意跟親信班子反覆「嘮叨」的內容：建設一支雄冠全球的偉大軍隊，它不只是一支裝備精良、訓練有素的陸軍，還包括同樣強大的海軍和空軍！縱橫決盪將列強統統踩在腳下，武功超越強漢盛唐，為後世打造一個強大無比的中國，用軍隊的利劍為國人帶來土地、資源以及無盡的財富；建設一個經濟強大人民富裕的國家，讓百姓過上文明富裕有尊嚴的生活；建設一個科技領先的國家，將來不再是中國人跑到美國、英國、日本去留學，而是外國人以留學中國為榮，就像唐代的長安，來求學的外國人擠滿了城市甚至期盼著獲得中國國籍永久居住在中國；改變中國人蒙昧已久的心靈，讓這個古老民族真正煥發青春，民眾有著很高的文化程度，知法守法，文明而有秩序，最關鍵的是民眾有極高的愛國熱情，以奉獻國家為榮，以為國征戰為榮。所有為國捐軀的烈士都受到國民永久的崇敬！所有烈士的家庭都受到國家無微不至的關心照顧。
這是一個童話式的夢想。所有聆聽龍謙描述的人都不會鄙視這個夢想，但所有人都表示了懷疑，包括一直無條件崇拜龍謙的方時俊。
但夢想的第一步已經實現了，蒙山軍用十年的時光從一支只有數百人馬躲在蒙山苟延殘喘的殘軍打造了一個新中國，國內的公開敵對勢力要麼被消滅了，要麼轉入了地下。擱在十年前跟著龍謙奇襲毛陽鎮從而返回蒙山的「元老們」誰能想到十年後他們成為主政一方的大員？誰能想到因北洋艦隊覆滅而蒙羞的方氏家族後人能夠成為海軍總司令？還有什麼理由懷疑龍謙的那個「崇高理想」不能實現？
何況龍謙承認，實現那個理想不一定是我們即可完成的偉業，或許需要幾代人不懈的努力，我們要做的就是給民眾指明還有這樣一條道路，引領著民眾朝這個偉大的目標迅跑。
方時俊在軍委會成立後即進入了他海軍總司令的角色。
幹什麼都存在一個方法問題，這是方時俊從龍謙那裡學來的「秘訣」之一。龍謙率第五鎮主力南下後，方時俊主持山東軍務，是山東事實上的第一人，曾對他的親信說過方法的重要性，當時那個人受命組建新部隊，方時俊贈詩曰，「平生所學寧堪贈，獨此區區是秘方。」
重振海軍談何容易。方時俊第一步要做的不是向龍謙要經費，更不是要海軍衙門，而是籌建海軍司令部的班底，方時俊的做法是從中央軍區司令部及總參挑選了一批人。
中央軍區司令葉延冰難以拒絕老長官的要求，儘管他點名的軍官都是葉延冰器重的人才。總參謀長司徒均曾長期擔任方時俊的副手，也與葉延冰有著一樣的感受，更對海軍司令部的籌建極為支持，抽調的人選都是最好的，因為海軍的高技術特性，總參特意選調了文化素質高的參謀給方時俊。軍令如山，儘管那些參謀們不願意離開已經熟悉的陸軍，但還是打起背包到了臨時設在鐵獅子衚衕的海軍司令部報了道。
依靠這些人，方時俊成立了海軍司令部最早的幾個業務組：資料、艦船、船廠、武器、訓練以及院校組，開始對海軍僅有的一點家底進行調查與規劃。
方時俊認為，蒙山軍毫無海軍基礎，如果不充分利用滿清留下的這點家底是不行的，更是極大的浪費。好在清廷去年秋天滿清西逃保定，有關檔案資料並未銷毀，算是完整地被蒙山軍接收，方時俊可以從中獲得自己想要的信息。
隨後，方時俊留下資料組埋首於故紙堆中檢索有關資料，帶著艦船、船廠、武器等幾個組的負責人前往天津、上海、福建以及廣東轉了一大圈，實地查看了海軍艦隊、海軍船廠以及數地船政學堂的情況，在當地駐軍的幫助下會見了包括薩鎮冰、嚴復、劉冠雄等海軍元老。
他甚至沒有時間回已經闊別十餘年的老家看一看，春節前返回北京，給龍謙打一份關於海軍建設的綜合性報告。
方時俊的報告就是要錢、要人、要政策。綜合起來有下面幾條：一、鑒於國內海軍人才極為匱乏，對於滿清政府留下的海軍人才，不管其曾有何種反對我軍之罪惡，一概予以赦免，絕不追究，包括皇室成員。只要其願意為海軍效力，海軍全部招入並授予相應的官職；二、目前情況下，為加速建設海軍，官兵待遇應高於陸軍，應以軍令形式予以明確；三、速從軍校中選擇至少五百人留學英美日等海軍強國，今年即行派遣，從明年起，留學人員數量不少於一千人；四、籌建海軍相關學校培育人才，高薪招募海軍強國教官前來任教；五、發行海軍債券為海軍募集專門資金；六、財政應從速投入資金建設上海等地的海軍船廠，從國外購置相關設備，以建設民用運輸船隻為前導，積蓄技術力量；七、務必保證海軍現有艦船訓練及維護資金。
兩天後，龍謙召集海軍建設專題會議，逐條討論了方時俊所列七條。龍謙最後總結道，「時俊所列七條均為海軍建設之要務，海軍司令部的工作是有成效的，至少知道從何處著手了。關於派遣學員出國留學的思路是對的，這是一條捷徑。據我所知，清廷曾與美國海軍有造船、訓練的約定，我看可以將因戰爭所中斷的合作接續起來，這條沒有問題。啟用滿清所留的海軍人才更沒障礙，我給你全權，用誰都可以，只要他願意為我所用。海軍官兵的待遇高於陸軍，不宜公開寫入條例，這樣容易引起軍種之間不必要的競爭，至於海軍司令部所列的特別於陸軍的地方，可以用津貼的形式來解決。興辦海軍大學、船政學院等軍校也可行，但要注意與教育部的溝通，因為教育部有設立五十所大學及專門學校的規劃，對於造船專業肯定在其中，不要造成資源的浪費。我的意思，目前我們的人才儲備、技術力量以及資金等條件尚不具備興辦海軍船廠的條件，應當從民用船隻的建造入手儲備技術和人才，所以時俊報告里所列的加強上海等地船廠的建設是對的，但這些船廠暫時不歸海軍管理，以民用商管的形式經營為宜。海軍可以派駐代表，學習管理，探索軍民混用的模式，將來條件具備了，再上專門的海軍船廠。海軍的資金保證是必須的，發行海軍債券可以研究。時俊沒有馬上向列強購軍艦是正確的，這涉及到海軍建設的大戰略，如果我們走了彎路，不僅浪費了有限的資金，更可惜的是浪費了時間。」龍謙講到這裡停頓了很長時間，似在思考著重大問題，「你們首先要做的是調查研究，收集資料，將近五十年來著名的海戰戰例研究透，搞清楚軍艦的類型、各自承擔的作用以及技術的發展，我以為，海軍大噸位軍艦的作用在下降，現在趨之若鶩的大噸位船舶、大口徑火炮會隨著航空及潛艇的技術進步而變化，海軍是進攻型的軍種，建造海軍不只是為了保衛海防，而是消滅敵人於海上，這就帶來了兩個問題，一是消滅敵人的艦隊，二是阻斷敵人的海上交通。前者會因為飛機的出現而出現戰術及戰略上的重大變化，後者因潛水艇的進步也出現全新的變化。海軍要研究這種變化，打個比方，這就像萬米競跑，對手領先我們五千米了，必須抓緊起步追趕，一刻都不能耽擱。但更要注意方法，你傻乎乎地順著人家的路追趕就難的多，如果找到一條捷徑就好了。飛機、潛水艇就是捷徑，今後的海軍建設，要將這兩種新武器列入重點，而不是總想著建巡洋艦、戰列艦，那種東西既費錢又費時，如果落後於時代，就是一堆廢鐵，我們底子薄，又不能像英國和日本先發展海軍，不能像英國一樣採取海洋立國的戰略，陸海空並重說起來容易，做起來就難了，我們很長時間都處於經濟緊張的局面，不可能大批建造類似無畏艦那樣的大軍艦，要注意這個冷酷的現實……」
在肯定了方時俊前期工作後，龍謙提出了自己的要求，「要格外注意潛艇和飛機。航空方面