軍委會組建後，龍謙高強度地推進建國前的系列工作。
10月16日，龍謙與返回北京的王士珍長談後，以軍委會名義委任王士珍出任北京市副市長。這是北洋系統的高官正式出任政府公職的第一例。作為交換條件，王士珍提出的允許滿清朝廷主要成員回京的建議得到龍謙批准。經秘書處研究，撥出原恭王府安置清室成員。商定暫按每年60萬銀元的額度作為清室的「奉養費」。但軍委會隨即對清室回京做出了五條規定：1、暫不接觸新聞媒體；2、安全由北京衛戍區負責；3、原有宮女太監自由選擇離去或者留下，遣散人員可由政府給予安置費，所留人員的費用在給予清室的安置費中列支，政府不另行支付該項費用；4、皇室成員願意為新政權效力的給予安排；5、清室成員嚴格執行退位聲明的承諾，不做任何反對新政權的言行。
由於清室在保定過的極為清苦，大批宮女僕役逃亡，急需得到安置，王士珍根據與龍謙談話的要點前往保定與清室洽談。對於旗人所領錢糧，蒙山軍進京即已終止，王士珍估算北京的旗人約為二十萬，以月費兩石計，月份需銀四十萬兩。但這個要求被龍謙斷然拒絕，旗人需自謀生路，新政府既不歧視之，更不會將他們養起來。
是日，軍委會委任宋教仁為軍委會宣傳局副局長，段祺瑞為政務局副局長，譚人鳳為湖南民政長。
楊度作為晚清政改的活躍分子，曾熱衷於立憲運動。被宣傳局招錄，職務為籌備二處副處長，該處的任務是起草憲法草案。
是日，龍謙聽曹敏忠代表總政治部對青軍聯現狀的彙報。目前情況，南方軍和山東軍青軍聯組織發展運行較好，北方軍稍差。南方軍青軍聯成員比例最高，約7%，山東軍為6%，北方軍不到3%。而且各部隊比例不近相同，其中以第一、第六師最高。青軍聯成員中，普通士兵約佔其成員的45%，連排級軍官為43%。成員主要集中於下層。
龍謙對青軍聯的現狀基本滿意。指示總政治部要抽出精力整頓及發展該組織，修訂章程，加入效忠國家的內容，在組織建設方面，特別要提高基層官兵的比例，力爭將普通士兵中青軍聯成員的比例提高到20%以上。要規範該組織的運作，制定和完善必要的條例，比如繳納會費，以體現組織觀念。至於權利，青軍聯成員在相同條件下優先提升，優先送入軍校深造。要適當從軍費中列支該組織的活動經費，比如訂閱書報，要給予大力支持。要保證每一個支部都訂閱一份軍內報紙，讓士兵們了解和掌握國家大事。說到報紙，龍謙指示總政宣傳局立即以《蒙山軍通訊》為班底組織出版《國防軍日報》，作為軍隊的報紙，免費提供官兵閱讀。《蒙山軍通訊》的前身是《第五鎮通訊》，起兵反清後將名字改為了《蒙山軍通訊》，現在是周報，有時候會加印。但龍謙指示要改為日報，特別是加強對官兵愛國主義的宣傳。
龍謙特別指示總政治部要設立青軍聯勳章，並統計上報反清起兵以來青軍聯成員立功名單，以確定受勛人員。青軍聯勳章至少分三級，可以設為金質、銀質及銅質三等。金質勳章只授予極少數立下大功的成員，特別是陣亡成員。具體辦法由總政參照現有的勳章獎章制度制訂。
曹敏忠詳細記錄了龍謙的指示。青軍聯原先是一個以效忠龍謙為綱領的軍內小組織，曾遭到包括司徒均在內的少數高級軍官的質疑。但更多的高級軍官都是其成員，但一般不參加其活動。現在龍謙似乎要將該組織擴大並進一步正規化了。假如明確規定青軍聯成員有優先提升權，會誘導更多的官兵加入這個組織的。
10月17日，龍謙正式委任許公持為北京警察廳長，以28旅83、84團約500官兵及原北京巡警組建的北京警察廳正式成立，接管了北京治安。之所以挑選該兩團成員改任治安警察是因為該兩團在進京後招募了大批新兵，北京居民子弟佔了多數。
同日，蒙山軍總參謀長司徒均率總參機關進京，就任軍委會軍務局長。
18日上午11時，龍謙在中海南岸的勤政殿舉行高級將領授勛儀式，授予魯山、王明遠、寧時俊、司徒均、封國柱、葉延冰六人一級卓越勳章並獎金十萬銀洋。授予石大壽、宋晉國、范德平、吳念、鄧清華、藍心治、胡宗玉、連樹鵬、張玉林、鄭雙慶、姜義柳、曹敏忠、瞿鴻翔、熊勛、程二虎、蔣存先、許公持、韓子英、貢開辰、張振明、丁小富、商鳳春、江雲、梁華達、遲春先、王之峰、杜三立、田書榜、晉瑞功等二十九名將領二級卓越勳章並獎勵銀洋五萬元。以表彰他們在創建壯大蒙山軍所建立的功勛。
因王明遠、封國柱、宋晉國、藍心治、吳念等尚在外地，龍謙只做了宣布。
獲得一級卓越勳章的六人是的的確確的蒙山軍元老，除司徒均外，資歷與職務都是蒙山軍建軍以來最深最高的，寧時俊是龍謙最早的參謀長，魯山、王明遠、封國柱、葉延冰是最早的連長。以司徒均加入蒙山軍後在歷次戰役戰鬥的貢獻、軍隊正規化及軍事教育等方面的功績，獲得最高等級的勳章大家也無話可說。
在場的將軍們不約而同地想起兩個人：周毅和馮侖。如果沒有新寧之變，局面將徹底不同。周毅無疑是最高勳章的獲得者，馮侖的資歷也夠，不過就是職務低了些。或許獲得最高勳章的人數不是六個而是八個了。
好在新寧之變並未牽連更多的人。在勤政殿受勛的將軍們很多是周毅的直屬部下，但龍謙顯然並未計較這點。特別是北方軍的將領們，自1903年冬，他們就離開主力獨自闖蕩天下了，原先的隸屬關係已經很淡了。
這份名單是蒙山軍核心團隊的一次大亮相。奠定了後來實施軍銜制的基礎。無數的人分析過這份名單，發現恰恰是早早離開主力到關外開創局面的北方軍系統最據優勢。在獲得二級卓越勳章29名將領中，北方軍系統的佔了10人，如果將長期主持關外情報業務的田書榜算入，竟高達11人。而龍謙親統的南方軍也不過11人而已。山東軍最少，只有3人，其餘如宋晉國、王之峰、江雲、曹敏忠等應當算作總部軍官，不屬於任何一個系統。考慮到蒙山軍開國之戰的三個方面軍兵力大致相等的事實，說明了一個問題，龍謙在確定授勛名單時更多地考慮了資歷而不是職務與戰功。否則，張振明、貢開辰、許公持、遲春先、晉瑞功等人就不應當獲得卓越勳章了。他們在開國之戰的功勞無論如何不如德州血戰立下大功的薛曉才、高虎子兩位旅長。
這份名單也彰示了蒙山軍這個軍事集團的派系分野。獨立發展壯大的北方軍已自成體系，足以與以蒙山軍正統自居的南方軍抗衡了。計算業已公布的陸軍整編方案，北方軍的勢力更為驚人。而在開國之戰中立下大功的山東軍則處於絕對的劣勢。北方軍諸將當然服膺龍謙的領導，因為龍謙是這支部隊的創建者。但當龍謙離開後，中樞就無人可以制約這個體系了。共和國成立後諸多變故的發生，追溯到勤政殿授勛就找到了源頭。
授勛儀式後，龍謙對他的將軍們講了話。
「將軍們，」龍謙神情肅穆，「勳章象徵著榮譽，獎金是對大家跟隨我龍謙南征北戰十年來的獎賞，都是你們應該得的。特別是北方軍及南方軍的袍澤們，拋別自己的妻兒父老，為我們這個團體、為我們這個國家浴血奮戰，我龍謙感謝你們，我代表新中國感謝你們！
在這個莊嚴的時刻，我們不應該忘記無數為了新中國的成立犧牲的戰友們。在二級卓越勳章的名單中，還應當有兩個人，他們就是犧牲在錦州以及德州的盛光和段寶昌兩位旅長，他們是真正的英雄，讓我們永遠記住他們的英名。勳章和獎金也有他們的一份，隨後由總政治部頒發給他們的家屬。
今天的授勛儀式，只授予有正式軍職的將領。其實，大批的文職人員也應該授勛，我跟方聲遠等人商議過了，但他們堅辭不領，認為他們只是為大家做了後勤方面的事。但是，我們應該清楚，沒有他們的運籌帷幄，我們是不能夠連戰連捷，取得今天的勝利的。對於文職系統的有功人員，我將另行制定相關的政策，給予有功人員以榮譽上及物質上的獎勵，他們同樣是國家的功臣，同樣應當受到獎賞！
在新中國即將成立的時刻，我將榮譽頒給你們，但也要提醒你們，榮譽只代表著過去，不代表你的未來。而且，國家草創，明面上的、隱藏著的敵人不知有多少，他們不願意看到蒙山軍所建立的新中國的誕生，他們躲在暗影里謀劃著顛覆我們的新政權，顛覆乃至消滅我們這支光榮的軍隊，你們必須提高警惕，隨時與一切的敵人做殊死的鬥爭。
將軍們，蒙山軍建軍十年了，走過了艱苦、光榮的歷程，但後面的路還很長，戰鬥更艱苦，更偉大。我要你們牢記榮譽，帶好兵，打好仗，保衛並建設我們的新中國。還要你們保持戰爭年代的那股子勁，那股子拚命精神，去爭取更大的勝利，爭取更大的光榮！
將軍們，蒙山軍已經成為歷史，蒙山軍已化身為國防軍。軍隊將進一步擴編，進一步正