咨議局的風波過去了，新成立的江南咨議局，得到了皇帝朱由檢的高度重視，並親自派來最信任的太監王承恩，趕在成立的當天咨議局的當天出現，宣布了一道旨意。
什麼意思呢？省一級的咨議局成員，賜舉人出身，府一級的咨議局成員，可納捐為監生，縣一級的咨議局成員，則賜進士出身。這道旨意下來後，別說整個江南了，整個大明都啞口無言。皇帝這是要幹啥啊？如此的一意孤行？更為意外的是，整個大明官場，集體失聲。
這是一次真正意義上動搖大明讀書人絕對地位的事件，商人在這個事件發生後，社會地位得到了極大的提升。這個舉動，說明了朱由檢在長期依賴文臣治理天下，卻毫無一點成效的前提下，做出了一個大膽的嘗試。如果沒有陳燮這個人物的出現，朱由檢是不會這麼做，也不敢這麼做。陳燮這個人物，帶給朱由檢的不僅僅是一個穩定的大局，還有大明朝萬世不易的希望。看見這個希望之後，朱由檢自然敢於下注，要做一個千古一帝。
崇禎十六年底，朱由檢面臨的國內局勢，已經發生了巨大的轉變。天災還在肆虐，但是得到了有利的財政支持後，賑濟的工作在進行，大明的百姓只要有口吃的，就不會造反。軍事方面，孫傳庭已經完成了驅趕的任務，逃亡木邦的張獻忠、羅汝才等輩，兵力不足五千人，輜重丟的一乾二淨，根本就成不了氣候了。這時候只要大明自己不犯錯，那就沒有太大的問題。朱由檢做出了一個決定，馬祥麟為雲南總兵，鎮守邊境，以防張獻忠殺回頭。其餘各部，陸續返回京師，自百戰精兵中挑選25歲以下精銳，充入新軍之中，取代過去的京營。原先帶兵的勛貴，必將慢慢的退出軍隊中，成為大明朝真正意義上混吃等死之輩。
這個時候，朱由檢把朱慈烺送到陳燮身邊的目的，才算是圖窮匕見。大明官場已經徹底的看清楚了，這不是一代皇帝的意思，而是要把這個意思貫徹到兩代甚至更多代皇帝的心中。大明朝的變革，迎來了一個由不得你變還是不變的時代。一個以陳燮為未來大明外朝中堅核心的構圖，清晰的擺在每一個人的面前。皇帝或者會短壽，但是陳燮在傢伙，現在看上去也就是三十不到的樣子，怎麼看都是能活很久的貨色。
一邊在高度肯定咨議局，一邊朱由檢又頒布了一道詔令，讓內閣重新審議考成法，把咨議局監督作為一個打分標準，結合京查一起，新編出一個考成法來，交給皇帝審議。什意思呢？就是讓內閣領銜，把考成法拿出來，京查之外，搞一個咨議局監督打分的機制，作為官員是否能得到升遷的標準。這一招真是太狠了，對於官員來說，真是無法忍受的一件事情。被同類監督就算了，那些咨議局算得什麼？就在百官躍躍欲試，摩拳擦掌的準備著，只要有人站出來挑頭，就跟著一起上的時候。江南傳來了另外一股風暴，立刻把大家的吸引力抓住了，新的考成法這個東西，居然不是主要話題了。
這顧風暴是怎麼回事呢？起因還是《明報》這份媒體引發的，十月底，一篇文章在明報的頭版刊發。名曰：格物致知，實踐是檢驗真理的唯一標準。這篇文章，署名為陳燮，也就是說陳燮擼袖子赤膊上陣了。
文章的內容就一個，什麼才是格物致知的正確解釋，給出的答案很簡單，實踐是檢驗真理的唯一標準。格物致知的最初意思，不是什麼後來大儒們解釋的那種，而是另外一個意思。通過格物，解釋這個世界上看見的一切事情的道理，這才叫格物致知。那麼，怎麼才能得出這個結論呢？單純的空想，根本就不解決問題，甚至會發生歪曲聖人言論的現象，並且嚴重的誤導後人。世間萬物，表象背後，都有其必然的道理，通過格物，去找這個道理，掌握其中的道理和規律，這才叫格物致知。
這篇文章出現之後，整個文人階層出離憤怒了。以前陳燮在其他領域搞風搞雨，大家忍一忍也就算了。這一次，是在他們自以為絕對統治的領域來指手畫腳了。居然敢於顛覆聖人，敢於顛覆先賢，這個怎麼忍？
南京國子監、太學，這兩個地方數百學生在報紙刊登的當天，就站了出來，堵在陳燮的家門口。一定要陳燮給個說法，他們高呼「為往聖繼絕學」「聖人先賢不容褻瀆」的口號，浩浩蕩蕩的在陳家大門外一百多米外帶著，死活都不肯走。甚至有人直接在原地豎一塊牌子，上書：不道歉，寧餓死。言下之意，就是要用絕食的方式，抗爭陳燮這個三省總督的不當言行。他們倒是不敢繼續往前走了，因為士兵在路上列隊，刺刀對著他們，大有再往前走，就捅過去的意思。
消息跟長了翅膀似得飛到了京師，這個事情給朱由檢帶來了不小的震動。看見奏報之後，立刻把自己關在書房裡，尋思這個事情，想了大概一個時辰，朱由檢得出了一個結論，陳燮是在替他分擔火力，但是他新的考成法推行不順利，所以才這麼干。問題是，這個事情雖然吸引了火力，一旦陳燮在這個事情上失敗了，被天下的文人集火給滅了，朱由檢的新政策，不也要跟著受到牽連么？一旦這些文臣得勢，他們是不會放過任何一個曾經的對手。包括皇帝在內，千萬不要小看了這些文人的狠毒。
朱由檢不認為陳燮不會看不到這點，但是他為啥還要這麼做呢？難道，他有翻盤的妙手？陳燮有翻盤的手段么？朱由檢不知道，只知道他必須立刻召見內閣成員，商議這一份奏報的處理方式。尤其是在朝廷之上，絕對不能因此引發一場新的地震。
實際上這個時候，京師的官員們，都是一個態度，那就是觀望。看看皇帝的反應，看看內閣大臣們的反應。聰明人都在官場上呢，明朝考進士難度比你媽考清華北大都難，庶吉士就更加的難了。這些人智商絕對高，在官場里歷練之後，個個都是人精。
一干內閣成員匯聚在文華殿，朱由檢把來自江南的奏報往桌子上一擺道：「大家都說說吧。」結果大家都一個表情，趁著臉不說話。這一下朱由檢奇怪了，難道今天太陽沒出來？抬頭看看外面，陽光燦爛的午後，這不正常啊。
很正常，一點都不奇怪。很簡單的道理，從南京到京師，快馬跑死不停飛奔，以明朝的驛站體系，最慢十天能到。也就是說，現在看見的是十天之前發生的事情。那麼事情就簡單了，陳燮是如何應對的，江南讀書人是怎麼抗爭的，最終結果是什麼，早就出來了，甚至已經在路上了。既然如此，那為何不等塵埃落定再說話呢？
這就是交通不便帶來的問題啊，要是有個電報，就是多花點銀子的事情嘛。
那麼，在江南到底發生了什麼事情呢？陳燮有沒有讓他的軍隊，用刺刀來解決這個讀書人呢？還是陳燮認錯了？這個可能性，大家決定呵呵呵。所以呢，現在說什麼都不妥當，等結果好了。朱由檢沒想到這個，正在納悶的時候，楊廷麟站出來。
「陛下，此事暫時先放一放吧，最遲數日，下一步的奏報就會來到京師。」一言點醒夢中人，朱由檢明白了，都比鬼都精明的貨，在等下一步的奏報呢。這麼大的事情，地方官員肯定要連續奏報了。現在奏報沒到，說什麼都言之過早。
「既然如此，那就先放一放吧，還是抓緊把新考成法的編寫提上日程吧。」朱由檢立刻轉移話題，既然陳燮創造了這麼一個機會，當然要抓住了。別說楊廷麟了，在場的幾個內閣大臣，一個一個的心裡別提多膩歪了。就這事情，要不是陳燮在江南搞出那麼大的動靜來，京師沒準就得翻天。現在朱由檢再次強調這個事情，醞釀多日的爆發，給陳燮焦黃了。
在場的哪一個不是飽讀詩書？哪一個在文化的問題上回服氣別人？陳燮要是搞別的就算了，天高皇帝遠的，大家可以當看不見。現在是拿先賢的「格物致知」來開刀，就算是楊廷麟也想表示「哥不能忍」啊！
「陛下，此事還是等一等吧。」周延儒不得不站出來，提出了自己的看法。還是等江南風波平息了再說吧，大家都沒這個心思呢。朱由檢聽到這個話，看看是周延儒出來說的，知道內閣已經達成了一致。既然如此，那就等吧，誰讓自己對陳燮有信心呢？這事情吧，對於大明讀書人來說太重要了，因為跟真理有關。