崇禎十四年三月，神衛軍團由重慶出發，經桐梓抵達貴陽府。同時，天策軍團由湖廣南部的辰州出發，幾乎與神衛軍團同時抵達貴陽。
韋悅翔忙著接管貴州全省的防務，楚文山則率領天策軍團繼續前進，經曲靖，最終抵達昆明，開始接管整個雲南的防務。
最終，楚文山派兵經玉溪抵達紅河，並順流而下，打通了與驍衛軍、龍虎軍團的聯繫。
自此，整個西南三省，皆被荊州軍接管，荊州遂開始在西南三省各府各縣進行改制。至於多如牛毛的土司，除了極個別主動要求編戶齊民外，林純鴻下令暫時不必理會。
幾乎與西南三省同時，湖廣南部、兩廣、福建、浙江、江西都開始了改制。唯有南直隸，林純鴻有意給復社、東林黨折騰的時間，下令暫緩。
為了這一天的到來，荊州已經做好了充分的準備：幾乎所有的弓兵隊長，都出自於本土本鄉；幾乎所有的部門長官及屬吏，都在荊州進行了培訓、實習……
尤其是湖廣南部和四川，荊州滲透多年，幾乎已經到了林純鴻一聲令下，改制便應聲完成的地步。
史可法看著荊州在廣闊的區域內順風順水，再看看安慶、廬州的舉步維艱，這不得不他讓萌生退意。就連一心折騰虎丘書堂的瞿式耜、張溥，見到培養出來的小吏幾乎有一半跑到浙江、江西乃至西南求職，也心灰意懶。
直到現在，瞿式耜和張溥才想起黃宗羲當初的勸諫：改制之事，還不如交給林純鴻去做。
正當史可法、瞿式耜和張溥聚在一起，商議如何體面地退出改制一事時，堵胤錫忽然從廬州趕到虎丘，向三人展示了黃宗羲、顧炎武的邀請函。
「設立諫官制度？亭林先生和南雷先生在荊州發出邀請？」
堵胤錫帶來的信息量太豐富，讓史可法三人的腦子一時有點短路。
堵胤錫並沒有詳細解釋的意思，只是從袖中掏出一份辭呈，遞給史可法，道：「今日至虎丘，主要是想辭去署理安廬弓兵一職，另外，還想向三位辭行，不才近日準備接受亭林先生和南雷先生的邀請，至荊州商議設立諫官制度。」
堵胤錫乃史可法麾下第一可用之人，見堵胤錫準備跑到荊州去，史可法心裡泛酸，道：「區區一諫官制度，值得仲緘千里迢迢地跑到荊州去？朝廷有都察院，已有顧問、勸諫之功能，林純鴻又重新折騰一套，估計也沒安什麼好心！」
瞿式耜、張溥表示贊同，都勸阻堵胤錫前往荊州。
堵胤錫道：「暫且不論林純鴻有何禍心，單單看林純鴻設立諫官制度，就黎民蒼生、對朝廷都有好處。既然有好處，不才就想去試試。更何況，林純鴻開了荊州以外的人參與制度設計的口子，若不抓住機會施加我們的影響，豈不可惜？」
堵胤錫的話，讓瞿式耜、張溥和史可法感到羞愧。當初，設立大明銀行時，林純鴻也開了口子，放任天下人討論，只可惜他們當初鼠目寸光，沒有堅持到底，致使現在大明銀行一直被林純鴻所把持，就連朝廷都難以插手。
瞿式耜習慣於將林純鴻往壞處想，這次也不例外，繼續勸阻道：「朝廷已有都察院，諫官也是有的，林純鴻另立一套，無非就是想重複大明銀行、工部的那一套，搶奪中樞都察之權，仲緘前往荊州，正好為林純鴻張目。還望仲緘不要被林純鴻蒙蔽了雙眼。」
瞿式耜的勸諫之辭，倒提醒了張溥，張溥靈光一閃，忽然問道：「都察之權有什麼好搶的？搶過來在自己身邊留一群批評、勸諫的人？」
張溥的話，讓瞿式耜和史可法陡然明白過來，對哦，搶奪都察權就是往自己身上套繩索的事，有什麼好爭的？
史可法道：「如此看來，林純鴻只抓住諫官這點，絲毫不提監督之類的，就是為了享受提建議的好處，而去除監督之類的套索。」
堵胤錫默然。
與史可法三人習慣於從陰謀看待林純鴻不同，堵胤錫習慣於從做事的角度看林純鴻。這固然有受馬世奇影響的因素，也與他本人看問題全面、深刻有關。
這次，史可法在安廬改制舉步維艱，堵胤錫慢慢發現，史可法能在安廬巡撫位置上安坐，得益於士大夫階層的支持，現在要用士大夫的授權去反對士大夫，這事要是做得成，還真叫有鬼。
反觀林純鴻，起家時就親自謀取利潤，後來又繆力支持工商，從海上、陸上徵收了大量的稅收，也就是說，逐漸壯大的海商及各地工坊主是他的力量源泉之一。再算上荊州新貴、荊州軍將士的支持，林純鴻去反對鄉村豪紳，自然如泰山壓頂，將豪紳們碾得一點渣都不剩。
堵胤錫發現這點後，細細琢磨林純鴻的各項政策，陡然發現，林純鴻幾乎每時每刻都在推動士大夫接納他，支持他，這從朱之瑜、馬世奇等人成為荊州的核心就可以看出。
另外，林純鴻在江南多次掀起論戰，目的也在於此。
既然有了這個想法，堵胤錫得知林純鴻欲設置諫官後，一眼發現了林純鴻的真正用意：將大部分開明的士大夫納入荊州體系中！
堵胤錫陡然興奮起來，既然士大夫能以一個整體進入荊州體系，就是讓林純鴻主導大明有何不可？
當前，就應該趁諫官制度未定，竭力讓士大夫獲取更大的權力！
……
正當史可法三人勸阻堵胤錫前往荊州時，黃顧二人的邀請函送至張溥、瞿式耜手中。
史可法三人面面相覷，不知林純鴻在唱哪一齣戲。
堵胤錫提醒道：「莫非林純鴻想把所有在野的名士納入諫官體系？」
四人商討一陣，瞿式耜、張溥最終拿不下臉面，拒絕了黃顧二人的邀請。堵胤錫則一葉扁舟，徑直向西，往荊州趕去。
相比較江南士大夫的扭扭捏捏，不情不願，鄭芝龍聽聞林純鴻欲設立諫官制度後，一眼看出了林純鴻有可能分享顧問權，根本不等任何邀請，只發函知會了林純鴻一聲，便派出了以鄭鴻逵為代表的龐大陣容前往荊州，參與制度設計。
自大明銀行設立之後，鄭芝龍的想法就變得非常簡單，只要林純鴻想乾的事，一定要參合一腳，不僅沒有什麼損失，反而能收穫意外的好處。如大東洋商號、福建改制，都是最明顯的例子。
林純鴻大喜，令姜淑讓將鄭鴻逵一行隆重迎入荊州，施以極高的禮遇。
鄭鴻逵的到來，至少表明，海商團體開始自發地爭取權力，這與林純鴻精心呵護下的海商顯然不同。
同時，鄭鴻逵一行極大地擴大了參與人員的範圍，不再局限於荊州內部及一幫名士。
鄭芝龍高調參與，無疑刺激了洪齊雲一幫人，就連老西的代表范毓賓也坐不住了。雙方接觸之後，組成了更為龐大的代表團，前往荊州，參與諫官制度的設立。
一時間，各路名士、商賈紛紛彙集至荊州，致使荊州客棧爆滿、人滿為患。
人員眾多，林純鴻令張道涵轉而對制度設計的程序進行設計，並公之於眾。首先成立特別工作小組，由林純鴻擔任組長，成員包括張道涵、朱之瑜、李崇德、彭新、黃宗羲、顧炎武、鄭鴻逵、洪齊雲等。
然後由中書府、監察府和黃顧二人擬定三份方案，由特別工作小組結合三份方案，擬定一份新的方案，再交由眾人討論。
由於參與人員過多，張道涵令所有人按照籍貫分組，分為兩京十三省及海外組十六組，由各組分組討論，將意見匯總至特別工作小組。
特別工作小組根據大家的意見進行修改後，然後再交由與會人員表決，若同意人數超過六成，諫官制度設計便大功告成。
荊州鬧出偌大聲勢，朝廷自然不會不知。
反應最為強烈的，自然非都察院莫屬，幾乎所有御史齊上陣，奏請朝廷阻止林純鴻胡作非為。
所有奏章，都被朱由檢留中。
朱由檢顯然比這幫御史清醒，知道林純鴻想做的事情，他根本阻止不了，與其受辱，還不如靜觀其變。
這裡面，態度最值得玩味的要數楊嗣昌、陳奇瑜一幫人。楊嗣昌至今未置一詞，就當不知道這件事一般。
楊嗣昌當然看出，林純鴻折騰諫官一出，有完善行政、監察的意圖，也有搶奪朝廷中樞之權的意圖。不過，設立諫官的本質還是往自己身上套索，單單憑這一點，楊嗣昌、朱由檢就有點樂觀其成的意思。
可是，荊州把聲勢鬧得越來越大，名士、商賈紛紛跑到荊州，搞得荊州倒像是中樞似的，這讓楊嗣昌、朱由檢覺得臉上無光。
楊嗣昌想來想去，建議朱由檢以巡視地方的名義派出欽差，至荊州對整個諫官制度設計進行干預，若有機會，順勢搶過主導權。
朱由檢應同，遂下旨，以李紹翼為欽差，巡視湖廣。