再說皇宮之中，崇禎得知了張雷進入了松山與清軍展開激戰的消息之後，整個人的心情頓時都好了一大半，這段日子以來的緊張和焦慮在這個時候瞬間就緩解了許多，今年發生的事情實在是太多了，張雷已經是他唯一的寄託了。從開年開始，他根本就沒有聽到過什麼好消息。
比如二月初七日，總兵官左良玉，總督陝西三邊侍郎鄭崇儉等大敗張獻忠於太平縣之瑪瑙山。當時義軍分為三路，西路張獻忠據楚蜀界、東路革里眼、南路曹威、過天星等。楊嗣昌駐襄陽，而令左良玉專剿張獻忠。左良玉率軍與張獻忠戰於枸平關（陝西興安縣西），獻忠敗。左良玉請從漢陽西鄉入蜀追之。楊嗣昌令左良玉別派偏將追剿，左良玉不從。時張獻忠移軍至九滾坪，見瑪瑙山險峻，將據之。左良玉軍至山下，而張獻忠已佔據山巔，左良玉乃分兵三路，約聞鼓而上，鏖戰久之，張獻忠軍敗。左良玉兵折掃地王曹威，白馬鄧天王等義軍首領十六人。張獻忠妻妾被擒，張獻忠逃入興、歸山中。不久又入興安、房縣境，官軍畏懼山險不攻，張獻忠潛伏密林中，賄山民買鹽米，山民成為義軍耳目，張獻忠收得散士，聲勢復振。
比如五月十三日，蘇、松、湖等府的吳江、歸安等地晝夜傾盆大雨，水勢驟發，霎時洶湧，不分堤岸，屋宇傾倒。而米價騰踴，斗米至銀三四錢，富家多閉糶，民食草木根皮俱盡，拋妻子死者相枕。強橫之徒三五成群，鼓噪就食，街坊罷市，鄉村閉戶人情洶洶。
再比如七月，張獻忠西走白羊山與羅汝才會合。此時曹威、過天星欲渡江。為明官兵所阻。張獻忠至，與之會合。張獻忠雖累敗，然氣猶盛，立馬江邊，有不前者，輒斬之，官兵乃退。張獻忠渡江後，屯駐萬頃山，此時楊嗣昌才自夷陵朔舟而上。而張獻忠勢力已盛，連續攻下大昌、開縣，北攻劍州，將入漢中。又攻綿州、瀘州。至開縣。楊嗣昌在重慶，召賀人龍、左良玉來援，兩人都不來。
轉眼之間半年過去了，在這半年時間，原本大好的形勢急轉直下，大半個大明朝江山再一次落入敵軍之手，唯一能夠聽到的勝利的消息就是來自於張雷了。崇禎不由得十分絕望。對於張雷他又愛又恨，愛的是他每一次都能夠給自己帶來那麼大的驚喜，恨的是張雷實在是太出色了，他害怕自己以後就把持不住張雷了。有的時候他甚至在想，如果當初沒有將張雷趕走，而是讓他繼續輔佐自己，現在是不是已經肅清了各地的叛亂進入了重建的工作？當然這僅僅是如果，從他將張雷趕走的那一刻開始這如果就已經不存在了。等待崇禎的只有後果和結果。
張雷並不知道中原發生了什麼事情，他也沒有必要知道，因為知道了也無可奈何，他還是在和清兵打，因為有先進的武器，因此以松山城作為中轉站之後，飛機再一次飛到了錦州的上空。皇太極和葉布舒兩人都極為恐懼。因為他們發覺自己錯了，這天上飛的東西不僅僅能夠從那大船之中飛到松山城，還能夠飛到錦州來，經過這兩個地方之後。他們已經沒有心情去再試試這怪傢伙到底能夠飛行多遠的距離了，於是在無可奈何之中，皇太極下令退兵，駐守瀋陽，等待機會再一次進攻。而張雷是不可能打到瀋陽去的，飛行能力就不允許，於是也只好作罷，所有士兵進駐錦州，將所有的飛機以及燃料炮彈等留下之後，沒了用武之地的太平一號由秦洛峰開回太平島。
得知張雷將韃子兵趕回了瀋陽，崇禎萬分高興，下了詔書想要張雷回來幫他打農民軍，張雷當場拒絕，理由是如果自己走了的話清兵肯定會再一次進攻錦州，與其等錦州被清軍攻陷之後再奪回來，還不如直接駐守在錦州遏制清軍，至於國內戰爭就讓崇禎另外指派其他的人。現在已經是危急時刻，崇禎也不能跟張雷發脾氣，於是只能是忍了張雷，命他駐守錦州，保護北方安全。
八月，楊嗣昌出師入蜀，其時監軍萬元吉先入蜀，令蜀將把守巴、巫等險要之地。秦將賀人龍、李國奇、楚將張應元、汪之鳳、張奏凱專任追擊。應元等與義軍戰於夔州，營於土地嶺，人龍逗留不會師。張獻忠得知楚軍多為新募之兵，乃率大軍攻應元與之鳳，應元突圍，之鳳死於山下。張獻忠乃與羅汝才進軍觀音岩，據險以守。
九月初六日，明軍兵敗於觀音岩。當時萬元吉駐守巫山，邵捷春駐於大昌，互相聲援。後捷春用其部將之言，認為大昌上、中、下馬渡，水淺地平，難以把守，乃兵分三處，各派三四百人以守，義軍突至，先破上馬渡。元吉急令諸將匯於潭家嶺、七篝坎、乾溪等處，又派張奏凱兵屯凈壁。捷春派羅洪政、沈應龍二將助之。而張獻忠已攻破凈壁，趨大昌，遂攻陷大昌。
李自成從鄖、均進入河南。起初李自成被圍於魚腹山中（四川奉節縣東），時義軍中人多出降於官軍，李自成欲自盡，為養子雙喜勸止。李自成部下劉宗敏殺己妻對李自成說，要誓死從君。軍中壯士聞之，也多殺妻子誓從李自成。李自成乃盡焚輜重，輕騎入河南。
崇禎自從張雷說要駐守北方之後雖然有些不悅，但是從心底來說他對張雷還是感謝的，雖然沒有幫他到中原來打戰，但是至少也讓他沒有了後顧之憂不是？
張雷之所以不選擇南下除了防範清軍之外，還有一個不得不說的事情就是，他的兵實在是太少了，少到沒有能力去支持兩線作戰，所以他選擇了阻擊北方的滿清韃子，而將中原留給了其他的將士。而有了張雷在這裡坐鎮，滿清韃子也確實十分聽話，堅決不越雷池一步，張雷除了主持北方的生產生活還有防禦等等的重建之外，他還在設計一種能夠用於在陸地上面能夠對對手進行碾壓性的武器，那就是坦克，只要有了坦克，士兵過少的問題就解決了。
他留在了錦州，結果這一留，就留出了大問題，他實在是太高估明軍的作戰能力和低估了官員的貪污能力了。
轉眼之間到了崇禎十四年，整個大明上下沒有了一個能管用的人，失去了信用和糧餉供給的各路軍隊跟著起義軍一起燒殺搶掠無所不用其極，特別是在天下蝗災並起的時候，更是一發不可收拾，李自成打破開封城，張獻忠敗左良玉破襄陽城殺襄王，導致熊文燦被處死，身染重病不能抗的楊嗣昌內憂外患一起逼迫下自殺，崇禎皇帝親手斷送了大好河山的最後一絲希望！
完全沒有可用之人可阻之力，張獻忠在南方一發不可收拾，克湖廣之後，再次興兵進犯鳳陽，這一次不管史可法怎麼籌措都無法阻擋其二十萬大軍兵鋒，張獻忠破穎州焚壽州，下六安州，狂攻廬州七日，更分兵占舒城奪廬江，最後合併一處全力攻巢縣！
兩年之間，張雷辛苦建立並留下的城防設施被貪得無厭的官員一掃而空，巢縣知縣通過當年張雷留下的暗線送出求援信號，然後組織全城軍民拚死抗擊，殺的血流漂杵。
這個情況讓張雷既是憤恨又是無奈，他實在是想不到還有什麼語言能夠形容自己現在的心情了，在得知巢縣被攻擊之後，張雷立即下定了決心，自己帶著人馬南下救援，而將所有的飛機都留下，任命羅德曼為總指揮，代替他進行防禦工作。張雷知道清兵並不是懼怕自己，而是懼怕對於他們來說十分神秘而且殺傷力巨大的飛機，將飛機留在錦州能夠有效地對清軍進行威懾。
安排好整個工作之後，張雷並沒有馬上離開，因為他剛剛接到報告，天字型大小戰船已經快要到達這裡了，帶來的是最新式的單兵裝備，這些都是太平島上面的實驗室精心研究準備的結果。張雷的理念早已經滲透到了太平島關於最新科技的方方面面。他認為雖然現在三眼銃對於其他的軍隊來說戰鬥力是十分強悍的，但是它的缺點也不言而喻，因此絕對不能夠停止研發的腳步，再加上剛剛研究出來的硝化甘油和雷管，在臨走之前張雷把接下來的工作全部教給了方以智，讓他代替自己來做。方以智也確實是個人才，經過艱苦的實驗，他終於製作出了硝化甘油炸藥，並且能夠運用於實戰。
眼看天下不可收拾，得知張雷即將再一次南下征戰，盧象升上書崇禎請求跟隨張雷驅除賊寇，楊嗣昌死後朝廷再無人可以掣肘，崇禎遂再次加封盧象升全國兵馬總督，借其手命張雷為湖廣、四川、江西、鳳陽、廬州五地副督，總領平張獻忠匪患事宜。