令，一人，超品；左右僕射各一人，正二品；參知政事，若干，正三品。
屬官：左丞，一人，正四品上；右丞一人，正四品下；左司郎中一人，從五品上；右司郎中一人，從五品下；左司員外郎一人，從六品上；右司員外郎一人，從六品下。
屬吏：各房都事，從七品上；主事，正八品上；令史，正九品下；書令吏，從九品下……
職掌：熙寧新官制，以尚書省總領百官，原中書門下之事權多移於此。尚書省為外朝領袖，代理最高之行政、立法、司法諸權。政事堂為最高決策機構。尚書令不除大臣，待儲君監國之用。左右僕射為宰相，參知政事為副相，由諸部寺長官兼任，其中六部尚書必兼參知政事。左右丞掌行政監督之職，分管諸部寺監司事務。左右司郎中、員外郎分掌各房具體事務。都事掌點檢諸房事務；主事分押各房文字。
知樞密院事，資深者稱樞密使，正二品，位左右僕射後；同知院事，資深者稱樞密副使，資淺者稱簽書院事、同簽書院事，若干，正三品，位參知政事後。
屬官：都承旨，一人，正五品上；副都承旨，一至二人，從五品上；各司、各房知事，正六品上；同知事，從六品上。檢詳官，正七品上；計議官，正八品上；編修官，正八品下……
屬司：沿海制置使司，北面房，河西房，在京房，廣西房，東南房，編修所，審官司，職方館，檢閱司，侍衛司，知雜房……以上諸屬司隸都承旨。另設兩個獨立屬司：樞密會議，武經閣。
職掌：熙寧新官制，樞密院與尚書省對掌文武大柄，為最高軍政機關。掌軍國機務，兵防、邊備、戎馬之政令。同時亦是皇帝之最高軍事參議機構。知樞密院事，掌樞密院事，軍國大事，得列席政事堂會議；同知樞密院事，掌副樞密院事。都承旨，掌承宣旨命，通領院務。各房主官不再稱承旨官，改稱知事，掌各房事務。檢詳官、計議官為慎政官員。編修官，宋制本不入銜，新官制其職掌為專門編修如《武經總要》等軍事書籍，以及頒布之軍政令，條例等。沿海制置使司，掌沿海防務，海軍軍政；北面房掌臨遼國諸路之防務、軍政；河西房掌臨西夏諸路之防務、軍政；在京房掌京師諸路之防務、軍政，兼理川峽；廣西房掌沿交趾、大理諸路之防務、軍政；東南房掌其餘東南諸路之防務、軍政；審官司掌六品以上、三品以下武職人事。職方館掌地圖測繪，軍機檔案等，同時亦為對外情報機構；檢閱司掌督察三衙訓練，發布演習命令等；侍衛司，掌侍衛事務；知雜房掌諸雜事。樞密會議由樞密使、副，三品以上功勛武官，元老重臣，三衙都指揮使等組成，提供戰和攻守建議，為皇帝最高軍事顧問機構。武經閣為儲材之所。廢樞密學士等，建武經閣，設大學士、學士、侍讀學士、直學士、待制、侍講、侍讀、修撰等職名。凡三品以上武官，無實任且未退役者，從三品拜武經閣待制；正三品拜直學士；從二品拜侍讀學士；正二品拜學士；從一品拜大學士。凡侍講、侍讀、修撰，為三品以下武官之加銜。待制以上，入閣則拜，出閣實任即去職。
侍中，一人，正二品，侍郎一人，從二品。
屬官：左散騎常侍一人，正三品；左諫議大夫二人，正四品上；左補闋四人，正七品上；左拾遺四人，從七品上。
屬司：起居院，符寶司……
屬吏：錄事，從七品上；主事，從八品下；令史，正九品下；書令吏，從九品下……
職掌：熙寧新官制雖保持唐之三省制，但實為一省制，門下省與中書省主要為儲材之所並分掌諫權，門下省並掌郊祀之禮。侍中，虛位，非元老重臣不除。侍郎為副，為實際長官，掌省務。左散騎常侍、左諫議大夫、左補闋、左拾遺為高、中級顧問官、諫官。
令，一人，正二品；侍郎一人，從二品。
屬官：右散騎常侍一人，從三品；右諫議大夫二人，正四品下；右補闋四人，正七品下；右拾遺四人，從七品下。
屬司：中書舍人院……
屬吏：主書，從七品上；主事，從八品下；令史，正九品下；書令吏，從九品下……
職掌：中書省與門下省分掌諫權，並掌外製詔令、傳旨。中書令，虛設，以待元老重臣。侍郎為副，為實際長官，掌省務。右散騎常侍，右諫議大夫，右補闋，右拾遺掌如門下省等官。中書舍人掌外製，參議表章，詔旨制敕等。
都給事中，一人，正五品。副都給事中，一人，從五品。
屬官：諸科給事中各一人，正七品上下。
屬司：通進銀台司，進奏院……
屬吏：錄事，從七品上；主事，從八品下；令史，正九品下；書令吏，從九品下……
職掌：熙寧新官制中，門下後省為最重要之慎政部門。門下後省掌上下封駁權，下以直駁正百官章奏，上以封還詔敕，並掌上下書讀權。都給事中掌省事，副都給事中佐貳，按部門分設給事，掌上下封駁權和書讀權。通進銀台司原由通進司、銀台司、發敕司，封駁司組成，新官制裁併為通進銀台司，隸門下後省，掌中央各部門之奏牘，大臣之表疏，並具目分類以呈遞皇帝，批示後分付有司頒布內外；凡進奏院之奏章、案牘，依然經由通進銀台司進呈。進奏院掌地方於中央之郵遞事。
尚書一人，正三品；侍郎二人，分左右，從三品。
屬官：郎中六人，分文選、司封、稽勛、考功四司，文選司二人，分左右，余司各一人，正五品上；員外郎，四司各一人，從六品上；四司主事各二人，從七品上……
職掌：吏部掌六品以下文官之銓選。凡品階勛爵俸祿之制，選官、分職、功賞、考績之事皆總之。尚書掌部事，總文武官之選試、注擬及遷授等等之政令。侍郎佐貳。郎中掌司事，員外郎佐貳，主事總各案文書。
尚書一人，正三品；侍郎二人，分左右，從三品。
屬官：郎中四人，分戶部、度支、金部、倉部四司，戶部司二人，分左右，余司各一人，正五品上；員外郎，四司各一人，從六品上；四司主事各二人，從七品上……
職掌：戶部掌全國戶口、土地、錢穀、賦役之政令。尚書掌部務，總軍國用度並舉審核州縣廢置升降以上尚書省決議。侍郎佐之。
尚書一人，正三品；侍郎一人，從三品。
屬官：郎中四人，分禮部、儀部、祠部、主客四司，各一人，正五品上；員外郎，四司各一人，從六品上；四司主事各二人，從七品上……
屬司：貢院，設判院事一人。以禮部郎中或員外郎兼領。
職掌：禮部總邦國貢舉、禮儀、祭祀、朝會等之政令。尚書掌部務，總邦國禮儀、祭祀、貢舉、朝會、吉慶凶喪等大典之政令。侍郎佐之。
尚書一人，正三品；侍郎一人，從三品。
屬官：郎中五人，分武選、兵籍、職方、驛傳、庫部五司，各一人，正五品下；員外郎，五司各一人，從六品下；五司主事各二人，從七品下……
屬司：廢武學，設講武學堂，山長由侍郎兼。培訓軍使以上，指揮使以下軍官。
職掌：兵部掌六品及以下武官品級的補選、升調轉遷，徵募兵員、士兵的遷補、退役；驛傳，後勤軍資等。武選司掌六品及以下武官品級，補選和升調轉遷等人事及武舉事宜。兵籍司掌士兵徵募、遷補、退役、撫恤等。職方司掌國內地圖之測繪、烽侯，督察城隍要寨之修築等事，同時為對內之情報機構。各軍、營皆有掌地圖測繪之軍官，隨軍測繪地圖，上報職方司以及樞院職方館。驛傳司舉傳驛之事。庫部司掌軍資料賬。凡各軍所需軍資，報三衙審核批准，由庫部司複核發出。
尚書一人，正三品；侍郎一人，從三品。
屬官：郎中六人，分刑部，都官、比部、司門四司，刑部司二人，分左右，余各一人，正五品下；員外郎，四司各一人，從六品下；四司主事各二人，從七品下……
職掌：刑部掌律法，按覆大理及天下案件、依赦宥條格決定犯科官員的赦免和錄用並報尚書省決定。
尚書一人，正三品；侍郎一人，從三品。
屬官：郎中四人，分工部、屯田、虞部、水部四司，各一人，正五品下；員外郎，四司各一人，從六品下；四司主事各二人，從七品下……
職掌：工部掌城池、屋宇、街道、橋樑等公共設施修建，舟、車器械百工製作及掌屯田、營田、職田、學田、官莊、堤堰等，並山澤、苑囿、敗獵、伐木及各種礦產資源開採廢置，溝洫、津梁、舟楫、漕運等之政令。尚書掌部事，侍郎佐之。
卿一人，正四品上；少卿一人，從四品上。
屬官：丞二人，正六品上；主簿二人，從七品上，博士二到四人，從七品上；太祝四人，從九品上；奉禮郎二人，從九品上；協律郎二人，正八品上，錄事二人，正九品下。
屬司：郊社局，太樂局，祭器所，廟祀局……