──人類再生機構「凰花」。
那是舊時代的智慧結晶，是遭孢子獸奪走地上生存權的人類最後，也是唯一的生存圈。
於二○三○年發現的未知物質「煉素」，會對特定程序──名為「魔法」的行動產生反應，改寫物理法則的「魔法原因物質」的發現，為世界帶來了革命。
隨著將「魔法」視為人類的嶄新可能性來研究的嘗試急速地進步、發展，人們開發出以科學方法重新構築的近代魔法程序。
最後獲得的成果，並不是將魔法應用在科學上，而是將科學應用在魔法上──主客易位的「魔法復古」，這成為和工業革命相同的一大運動，改寫了人類歷史。
理所當然地，魔法復古也被應用在軍事領域上。透過直接投予肉體來增加對煉素的親和性，擁有卓越魔法能力的人類──「魔法騎士」於焉誕生。
他們同時也是擁有最先進技術，以超凡能力討伐罪惡的英雄，而成為許多人心中憧憬的對象。
魔法與科學極度繁盛的時代。人類的黃金時期。
那個全盛時代的旗手，無疑地正是魔法騎士。
歷經二○四八年發生的世界大戰，還有因最初「大災難」而產生的變異生物──孢子獸的大量產生及伴隨而來的致命環境污染，魔法騎士的存在長久以來一直被視為人類的希望。
如今，要是沒有了魔法和技術的支援，人類不可能存活。
在那樣的情況下，變得無法生存的地球上所剩唯一的樂園──建造在舊亞洲地區的日本地下最深處，依循國情進行精密設計後利用魔法技術完美重現環境循環，擔起人類再生的職責，養育地球總人口約一千萬人的人造方舟。
那就是人類再生機構──凰花。
在其最深處。在人類的末世危機中受到安全保障，以培育和保護魔法騎士為目的所設立的教育特區第一學府，唯有在極端的選擇主義與重視實力之下培植出來的學生才能就讀的頂尖菁英培育學園，那就是洛塔斯．波多姆第一魔法騎士學園。
為了培育肩負凰花將來的魔法騎士而設立的搖籃。不只是學生，就連家人、親戚也包含在內，規模之大等同一座都市的教育機構。
在總人口約有八成是學生的最深區域(洛塔斯．波多姆)里，有著第一到第十的魔法騎士學園，由統轄所有學園的統括學生會掌管行政。
其中最優秀人才雲集的學園，是洛塔斯．波多姆第一魔法騎士學園。
統括學生會的人才也幾乎都是從這個「第一」中被挑選出來，統括學生會長古蘭．瑪麗亞也是這所學園的學生首席。
前線(頂層)、中心(中層)、最深(底層)。
透過巨大地下電梯連結，全三層結構的人類再生機構。讓孩子進入擁有相當於其三分之一行政權的菁英學校就讀，是所有父母的夢想及心愿。
由於魔法騎士的才能會受到體內煉素總量這樣的天賦才能影響，因此能夠成為表現突出的英雄培訓生之人，多半出身歷代祖先具有才能的門第，幾乎沒有學生是因為被挖掘出意外的才能而進入「第一」就讀──
不過，凡事當然都有「例外」。
「以軍備品的貨櫃為優先，快點裝貨。第二站是軍方專用！」
貨物兵團的將士單手拿著擴音器，站在街頭。
「新入學生排隊移動，不要迷路了。從第二、第三前往正門！」
「外部生轉乘時不要弄錯目的地。動作快！」
在堪稱最深區域的大門口電梯車站裡，青澀的學生排著隊伍。
從直通地上的巨大電梯井猶如植物根部分歧而出的無數鐵軌，象是微血管一樣不分日夜地持續將大量貨物和人員運送到都市的各個角落。
「呼……呼哇……好大好寬敞，我都要頭暈了……」
少女慌張失措地在人潮推擠下，被從隊伍中擠了出來。
充斥視野的大批學生，其中有大半是第二到第十學園的學生。
以電梯為中心，最深區域被劃分成十個地區，各個學區內都有一所魔法學園，分別對學生施行不同領域的教育。
和從中央轉運站這裡直接前往校舍的「第一」生不同，就讀其他學園的「外部生」要從這裡轉乘前往各學區，因此早晨時段人潮十分擁擠。
如果是已經習慣的人，會為了避開人潮提早或晚點出發──但是這位身穿嶄新第一學園高中部制服的少女，要學會那種生活智慧還要很長一段時間。
「空氣好新鮮……果然和國中部不一樣呢，呵呵♪」
金黃色秀髮閃耀的女孩年約十四五歲。她將在陽光照射下如蜂蜜般閃閃發亮的頭髮綁成兩束，一雙藍眼中閃耀著對未來的希望。
「而且不僅綠意盎然，日照光線也好充足……好棒，所有的一切都好像公園！」
遠離人潮，少女任憑頭髮隨風搖曳，來到戶外。轉運車站位在高地上，能夠將超近代深層都市的景色盡收眼底，而那裡有著多得驚人的綠意。
植物所發散出來的天然氧氣的放鬆效果；自天空灑落，重現得和地上一樣的模擬陽光。為肩負人類未來的菁英所準備的最佳生活環境，看在生長於其他地區的她眼裡宛如天堂。
（光線強到刺眼的地步……不對，還是第十學園地區太昏暗了呢？）
路上的學生紛紛回頭望向興高采烈地走在路上的少女。
將制服撐起的豐滿胸部，能夠窺知確實有在運動的柔韌四肢。
牛奶色的臉頰和金髮，傳達出少女擁有歐洲血統而非東方血統的事實；彷佛在訴說目光所及的一切都好稀奇的閃亮眼神及充滿好奇心的舉止，就像一隻小狗似的。
然而，最重要的是她的表情──那副好比此刻正在歌頌人生的幸福，柔和平靜又開朗的笑容，釋放出令所有擦肩而過的人不由得泛起微笑的魅力。
──少女名叫亞蓮娜．史庫羅維尼。
別在她領口和袖口上的階級章，顯示她畢業於最深區域外圍的第十學園國中部，並且是在升上高中部的同時被「拔擢」至第一學園的成功人士。
但是，和那種嚴肅的頭銜完全相反……
「咦……啊，貓！有貓咪！哇～～太棒了！」
她帶著孩子般天真無邪的笑容，跑去追一瞬間從眼前跳過的貓。
為了緩和都市內壓力而被釋放出一定數量的「地區貓」，在基於節省資源的觀點，很難獲准飼養個人寵物的學園學生之間深受寵愛，甚至還會彼此交換照片資料。
她眼神發亮地追在貓後面，結果見到它迅速跑進某條小巷中──昏暗的小巷讓她有些猶豫。
「……一下下，只要一下下就好。至少讓我拍張照片……奇怪？」
就在她把身子探進大樓縫隙間時，她在資材後方看見用舊毛毯揉成的床鋪。
恐怕是學生從宿舍帶出來的吧。被包裹在綉有學校標誌的毛毯里的，是剛出生的幼貓──她追到這裡的貓似乎是母貓，此刻正憐愛地舔著幼貓的臉。幼貓一副筋疲力盡的樣子，叫聲也很虛弱，看起來好像很痛苦。
「幼貓……是你的寶寶嗎？」
「喵～嗚……」
「呃……不好意思……請讓我診察一下……！」
她伸出手指，為了不讓幼貓沾染到人類的氣味，僅釋放魔力波動來診察幼貓。
線框圖描繪在腦中。
從反彈波動的病灶陰影讀取問題，同時思考對策──
「……因為有接受都市管理機構的調整，所以營養很充足。是基因方面的問題，稍微對內臟功能造成阻礙……不行，腎臟功能太差了。」
長期在封閉環境下進行繁殖，基因庫比人類來得小的小型玩賞動物、貓、狗，如今已成為引發大眾議論的社會問題。背負那種天生缺陷的動物若是放著不管，保健局就會帶回去治療，或是──
（……也許會被判定生存困難，然後遭到處置。）
俯視母貓拚命舔著筋疲力竭的幼貓的模樣，亞蓮娜僅僅猶豫了一瞬間。
「小貓咪……不要告訴別人喔？」
「喵？」
她一露出淘氣的微笑，魔力隨即在她伸出的指尖點亮。
「固有絕技(一流藝術)──『女神之歌(福音歌曲)』。」
那是美妙的樂聲。救星所演奏好似喇叭的聲音和光線在小巷裡響起，同時奇蹟力量降臨在生病的幼貓身上，使其衰弱的內臟功能恢複並且修復基因。
「喵～！」
「……已經沒事嘍。呵呵……真是太好了，小