蔡元培說：「近代學者人格之美，莫如陳獨秀！」
傅斯年說：陳獨秀是中國革命史上光芒萬丈的大彗星。
陳銘樞說陳獨秀：謗積丘山，志吞江海，下開百劫，世負斯人！
汪原放說：蔡元培道貌溫言，令人起敬，吾國之唯一人物也。
周氏兄弟的業師壽洙鄰說蔡元培：「孑民學問道德之純粹高深，和平中正，而世多訾嗷，誠如莊子所謂純純常常，乃比於狂者矣。」又說：「孑民道德學問，集古今中外之大成，而實踐之，加以不擇壤流，不恥下問之大度，可謂偉大矣。」
馮友蘭說：蔡元培是近代確合乎君子的標準的一個人。曾子說：「可以托六尺之孤，可以寄百里之命，臨大節而不可奪也。君子人歟，君子人也。」儒，「粥粥若無能」，但是「可親而不可劫也，可近而不可迫也，可殺而不可辱也」。「身可危也，而志不可奪也」。這樣的人，才是君子。孔子說「君子可欺以其方，難枉以非其道。」馮說，蔡先生的人格，是儒家教育理想的最高的表現。
傅斯年說：「蔡元培先生實在代表兩種偉大文化：一曰，中國傳統聖賢之修養；一曰，西歐自由博愛之理想。此兩種文化，具其一難，兼備尤不可覯。先生歿後，此兩種文化，在中國之氣象已亡矣！」
1940年蔡元培病逝於香港，全中國不分政治派別，均表深切哀悼。國民政府發布褒揚令說：蔡元培「道德文章，夙負時望」，「推行主義，啟導新規，士氣昌明，萬流景仰」。