巴羅慈遺迹被摧毀，還跑出了一頭強大無比的怪獸，向基地彙報後大地明日菜兩個沒有久留，和夏龍一起帶著青石搭乘天空馬斯返航，隨行的還有那個眼鏡女子和一個叫悠斗的小男孩。
自我介紹後，夏龍才知道女子叫玉城典紗，是東都大學考古學教授，一直對超古代文明深有研究，小男孩則是教授的兒子，喜歡跟著教授考古，這次因為在附近找東西而沒有被捲入危機。
回程路上，天空馬斯凱迪攜帶著一輛戰車平靜地穿梭在雲層間，明日菜陪玉城典紗母子在戰車裡休息，夏龍則和大地兩個單獨呆在戰機上。
「咻！」
大地默默地看著窗外的雲霧，儘管已經擺脫危險，情緒依然不高，腦海里不斷回想著和賽格古的戰鬥。
最後如果不是扎基擋下破壞光線，艾克斯恐怕……
想到遭到侵蝕的扎基，大地不由得看向身旁小憩的夏龍。
「拓司先生……」
「大地，等賽格古再次出現，能夠阻止它的就只有我們了。」夏龍突然睜開眼道。
「嗯，」大地難受地點點頭，自責道，「抱歉，如果不是因為我，扎基人偶也不會變成那樣……」
「扎基人偶只是暫時受損而已，比起這個，你和艾克斯的安危更重要，」夏龍打斷道，「別擔心，既然賽格古會在超古代被封印，我們也可以成功的。」
鼓勵一句，夏龍再次閉目養神。
其實比起賽格古，他更擔心路西法和暗黑雷暴能量的源頭，隱藏在暗中的敵人有時更為可怕。
……
Xio基地，馬斯凱迪降落後，夏龍立馬帶著青石進入實驗室。
「唔，這就是在遺迹里發掘的青石？」古爾曼博士迎上來，詫異地接過夏龍手上的青石。
悠斗被小薰小滿拉到一旁，夏龍和大地兩個跟著古爾曼走到實驗台前。
在遺迹現場獲取的資料已經傳到了這裡，交給阿守進行研究。
「博士，這是埋在金字塔里的石像。」
「有意思，」古爾曼將青石放到一邊，打量起電腦畫面，「是超古代的奧特戰士嗎？」
「是古文書中記載的巨人，迪迦，」玉城典紗走過來，頓了頓，凝重地看向青石道，「太古時期的地球，地面燃燒海洋煮沸如同地獄，是賽格古的世界，直到光之巨人降臨，將賽格古封印到了地底深處，但是現在封印卻不知道因為什麼解除了。」
「賽格古就是巴羅慈遺迹里的那頭可怕怪獸？」古爾曼博士張大嘴，沉聲思索，「有辦法再封印起來嗎？」
「我想遺迹里的碑文說不定是封印賽格古的提示，」玉城典紗看了看眾人，複述道，「依靠碧石，天之光地之光在此結合，結合之光蘇醒時，黑暗歸為黑暗，如果能夠弄明白結合之光的話，或許可以再次封印賽格古。」
「博士，教授，總之先解析這塊青石吧。」
夏龍點點頭，讓博士一行人開始對青石進行研究後，轉身走向另一邊的孩子們。
有青石在這裡，基地已經相當不安全了，可是讓孩子們離開基地也不合適……
「嗯？」
夏龍視線不經意掃過小薰幾個，意外注意到悠斗從背包里拿出一個奇怪的石頭。
「這是？」
夏龍視線頓住。
「可以把這個給我看看嗎？」疑惑間，夏龍走到孩子們身邊拿過石頭。
雖然看著只是普通石頭，但獨特的造型還是幾乎一眼就能認出來。
「這是，是神光棒？」
圓柱把柄加上雙葉般的頂部，甚至還有縫隙間露出的神秘紋路，的確就是迪迦變身器。
「什麼神光棒？」悠斗好奇道，「這個好像是古代的鐵鎚吧？」
「沒什麼，」夏龍仔細打量一眼悠斗，笑了笑，沒有多說什麼，把神光棒還給悠斗道，「放好吧，千萬不要把這個弄丟了。」
暫時放下帶孩子們離開基地的想法，夏龍起身離開實驗室。
青石的事交給玉城教授還有博士等人，Xio方面也開始進行作戰部署，以防閻魔獸賽格古來襲。
可以預想，等賽格古恢複後肯定會來破壞青石……
「卡利歐，」走到天台後，拓司擔憂出聲道，「他們能夠成功嗎？」
「不知道，不過努力肯定沒錯。」
夏龍回到印記空間，看著探測光幕道：「拓司，不管怎樣都不能輸，這場戰鬥如果輸了的話，整個地球都會毀於一旦。」
扎基人偶雖然不能用，但卡利歐的力量卻已經跟上來了，最近與拓司融合度持續提升，距離進化也只差一步而已。
如果能夠成功邁過這一步，戰鬥力將發生質的變化，至少對付賽格古是沒問題了。
「拓司，下一次戰鬥，我會完全交給你。」
……
緊張地準備中，第二天Xio終於探測到賽格古蹤跡，一團巨大的熱源隱藏在地下600米深處正以時速120千米朝Xio基地移動。
「果然是為了破壞青石嗎？」
指揮室眾人面色凝重，迅速展開行動。
「開始迎擊！」
實驗室，古爾曼博士等人除了從青石上檢測到初代奧特曼的力量，並沒有太大收穫，不過卻嘗試著進行開發迪迦與初代奧特曼電子卡片，將希望寄托在艾克斯身上。
既然沒法找到讓青石結合天地之光的方法，只好進行另類的結合，決定依靠艾克斯來驅動兩個奧特曼的力量試試。
「滴滴！」急促警報聲在基地傳響不止，很快大地和阿守離開實驗室出動作戰，只有古爾曼與琉依留下來繼續開發電子卡片。
「博士，怎麼樣？」夏龍看向開發中的電腦界面，發現電子卡片始終無法成型。
「果然數據還是太少了嗎？」古爾曼博士張著嘴，一遍又一遍進行調試。
基地外，Xio眾人趕到預先設置的作戰地點後，由大地實體化虛擬哥莫拉。
「地底賽格古，鎖定！」
「距離接觸還有5、4、3……」
鎖定賽格古位置，大地迅速操控哥莫拉朝地底發出攻擊：「電子超振動波！」
「砰！」高速移動中的賽格古徑直撞在哥莫拉攻擊上，劇烈的震蕩過後，Xio探測中賽格古位置急速上升。
「命中賽格古！」
「上來了！」
「昂！」
隨著地面融化成一片血海，賽格古咆哮著衝上地面，進入Xio預設的攻擊圈之中。
「攻擊！」
……
「轟隆！」
地下實驗室，古爾曼博士抓緊時間進行著電子卡片開發，夏龍的注意力則轉向了外面的戰鬥。
賽格古被Xio用能量護盾困住，但形勢依舊很嚴峻，賽格古背部直接射出兩根刺破開護盾，化為兩頭新的怪獸，連電子哥莫拉都被瞬間擊潰。
玉城典紗母子緊張地看著電腦轉播畫面，地面的戰鬥餘波遠遠傳過來，整個實驗室都微微晃動。
「一定要贏啊。」
看著情況不對，玉城典紗朝青石祈禱起來：「拜託了，這樣下去大家都會……」
「嘩！」隨著玉城典紗的祈禱，擺放在解析儀器上的青石突然散發出柔和光暈，吸引住眾人視線。
同一時間，悠斗背包里的石頭神光棒也跟著閃閃發光，就好像在呼應般。
古爾曼詫異地停下工作：「這是什麼？這個光難道就是碑文上說的光？」
「或許吧，」夏龍視線掃過青石，轉向古爾曼道，「博士，電子卡片還不行嗎？」
Xio已經快支撐不住了，再這樣下去基地將直面賽格古。
「奧特曼還好，但是迪迦還缺關鍵性數據……」
「試試這個。」
夏龍想了想，忙從悠斗手上借過神光棒交給博士。
「嗯？這是……」博士仔細看了看，急忙把神光棒放到解析裝置上。
「居然是迪迦的變身器，這樣的話說不定可以成功……」
「不好了！」琉依驚聲打斷道，「賽格古已經突破防線了！」
「轟隆！」隨著琉依的喊話，實驗室又是一陣晃動，夏龍看向監測畫面，果然看到賽格古連同哥爾贊與安東拉一起粉碎了Xio攻擊圈。
「博士，那這裡就交給你了，我出去看看。」
將小薰小滿交給琉依照顧，夏龍離開實驗室跑到基地外。
就這麼一會的時間，大地已經融合艾克斯展開戰鬥，橘也變身奈克瑟斯落入了戰場，只是得到暗黑雷暴能量強化的賽格古依舊強勢無比，合兩人之力才能勉強抵抗，剩下的哥爾贊與安東拉只能交給Xio牽制。
夏龍抬頭望向戰場上空，儘管沒有暗黑雷暴能量落下，天空還是出現了一個個雷暴漩渦，反應比以往任何時候都要強烈，中間更是夾雜著路西